২০২৫ সালের ৮ অক্টোবর,দক্ষিণ চীন কৃষি বিশ্ববিদ্যালয়ের পশু বিজ্ঞান কলেজের একটি দল তাদের সর্বশেষ গবেষণা প্রকাশ করেছে আন্তর্জাতিক খ্যাতিসম্পন্ন মাইক্রোবায়োলজি জার্নালে * মাইক্রোবায়োলজি স্পেকট্রাম*, শূকরদের শ্বাসযন্ত্রের রোগ, ডায়রিয়া এবং প্রজনন ব্যাধিগুলির সাথে ঘনিষ্ঠভাবে যুক্ত একটি নতুন শূকর সিরকোভাইরাস ¢ পিসিভি 5 ¢ সনাক্তকরণ এবং পদ্ধতিগতভাবে বিশ্লেষণ।
গবেষণার হাইলাইট
* **নোভেল ভাইরাসঃ** পিসিভি-৫ এর জিনোমিক কাঠামো, রেপ, এবং ক্যাপ প্রোটিন সিকোয়েন্সের ক্ষেত্রে পরিচিত পিসিভি১-পিসিভি-৪ এর সাথে কম সমতা (শুধুমাত্র ২৬.২%) রয়েছে।ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে এটি সার্কোভাইরাস পরিবারের অন্তর্গত নয়, তবে এটি সীল-ফেকাল-সম্পর্কিত সার্কোভাইরাসগুলির সাথে সবচেয়ে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত.
* **বিস্তৃত প্রচলনঃ** আমার দেশের দক্ষিণের পাঁচটি প্রদেশের ৭০টি শূকর খামারে ২৪.৩% খামারে পিসিভি-৫ সনাক্ত করা হয়েছে এবং সেরোলজিক্যাল পরীক্ষায় দেখা গেছে যে ৬৬%।84% শূকর PCV5 অ্যান্টিবডি বহন করে.
* **শক্তিশালী প্যাথোজেনিকতাঃ** PCV5 ভাইরাল লোড রোগের তীব্রতার সাথে ইতিবাচকভাবে সম্পর্কিত, অন্ত্র এবং মস্তিষ্কের টিস্যুতে উচ্চ ভাইরাল লোডের সাথে পর্যবেক্ষণ করা হয়েছে,রক্ত-মস্তিষ্কের বাধা অতিক্রম করার সম্ভাব্য ক্ষমতা.
• প্রযুক্তিগত অগ্রগতিঃ গবেষণা দলটি প্রায় ২০ এনএম ব্যাসার্ধের বিশুদ্ধ ভাইরাল কণা পিসিভি৫ এর জন্য একটি ইন ভিট্রো সংস্কৃতি সিস্টেম সফলভাবে প্রতিষ্ঠা করেছে।এবং একটি অত্যন্ত সংবেদনশীল এলআইএসএ সনাক্তকরণ পদ্ধতি তৈরি করেছে যা টুকরো টুকরো ক্যাপ প্রোটিন ব্যবহার করে ভাইরাসের মতো কণায় নিজেকে একত্রিত করে.
![]()
গুয়াংডং প্রদেশের কৃষি প্রজনন প্রযুক্তি উদ্ভাবন প্রকল্প এবং জাতীয় মূল গবেষণা ও উন্নয়ন কর্মসূচি দ্বারা যৌথভাবে অর্থায়িত এই গবেষণা,গবেষণা দলটি মহামারী সংক্রান্ত সমীক্ষা সম্পন্ন করেছে, জিনোম বিশ্লেষণ, ইন ভিট্রো সংস্কৃতি, এবং পিসিভি 5 এর রোগজীবাণুবিদ্যা বিশ্লেষণ দুই বছরেরও বেশি সময় ধরে পদ্ধতিগত গবেষণার পরে।CRESS ডিএনএ ভাইরাসগুলির বিবর্তন এবং রোগ সৃষ্টিকারী প্রক্রিয়া সম্পর্কে আরও গভীরভাবে বোঝার জন্য এই ফলাফলগুলি গুরুত্বপূর্ণ তথ্য প্রদান করে.
পরিচিতি
সাইনস সার্কোভাইরাস (পিসিভি) দীর্ঘদিন ধরে বিশ্বব্যাপী শূকর রোগের একটি গুরুত্বপূর্ণ রোগজীবাণু। পিসিভি 2, পিসিভি 3, এবং পিসিভি 4 এর কারণে গুরুতর ক্ষতি হয়, যার মধ্যে ইমিউনোসপ্রেসন,ডার্মাটিস-নেফ্রোপাথিএই গবেষণায় দেখা গেছে যে, গরুর খামারে সিরকোভাইরাস নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা নতুন চ্যালেঞ্জের মুখোমুখি হচ্ছে।
গবেষণার ফলাফল
1- এপিডেমিওলজিক্যাল বৈশিষ্ট্যঃ
২০২১ সালের অক্টোবর থেকে ২০২৩ সালের জুন পর্যন্ত, গবেষণা দলটি পাঁচটি প্রদেশের ৭০টি শূকর খামারে পর্যবেক্ষণ পরিচালনা করেছিলঃ গুয়াংডং, গুয়াংসি, হুনান, ইউনান এবং হাইনান।১৭টি শূকর খামারে পিসিভি-৫ এর ইতিবাচকতা পাওয়া গেছেসেরোলজিক্যাল সার্ভে থেকে দেখা গেছে যে, শূকর পালের ৬৬.৮৪% গরুর পিসিভি-৫ অ্যান্টিবডি রয়েছে, গরুর গরুর ক্ষেত্রে এই হার ৭১.৩৭%।
![]()
চিত্র ১. পিসিভি-৫ এর ভৌগোলিক বন্টন এবং জিনোম গঠন
(A) নীল অঞ্চলটি সেই অঞ্চলকে উপস্থাপন করে যেখানে PCV5 পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল, এবং লাল বৃত্তগুলি পিসিভি 5 দ্বারা সংক্রামিত হওয়ার বিষয়টি নিশ্চিত হওয়া গরু খামারগুলির অবস্থান নির্দেশ করে। গুয়াংসিতে মোট 17 টি গরু খামার,গুয়াংডং(B) PCV5-এর একটি একক-শ্রেণীযুক্ত বৃত্তাকার জিনোম (2904 nt) রয়েছে, যার মধ্যে Cap জিন (1182 nt), Rep জিন (1056 nt),এবং একটি স্টেম-লুপ কাঠামো (স্টেম: ৯ নট, লুপঃ ১৭ নট) ।
2জিনোম এবং বিবর্তনগত বৈশিষ্ট্যঃ
পিসিভি৫ জিনোমের দৈর্ঘ্য ২৯০৪ এনটি, এতে দীর্ঘতম ক্যাপ (১১৮২ এনটি) এবং রেপ (১০৫৬ এনটি) জিন অঞ্চল এবং বর্ধিত স্টেম-লুপ কাঠামো রয়েছে। এর রেপ এবং ক্যাপ প্রোটিনগুলি কেবল ২৬.২% এবং ২০% ভাগ করে।পরিচিত পিসিভি পরিবারের সদস্যদের সাথে 8% অ্যামিনো অ্যাসিড হোমোলজি, যথাক্রমে। বিবর্তনগতভাবে এটি সামুদ্রিক সিংহ-সম্পর্কিত সার্কোভাইরাস (এফএসএফএসিভি) এর সাথে সবচেয়ে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত। 12 টি পিসিভি 5 স্ট্রেন এবং এফএসএফএসিভি এর মধ্যে ক্যাপ প্রোটিনের সাদৃশ্য 89.1% থেকে 99.2% এর মধ্যে রয়েছে।
![]()
চিত্র ২. পিসিভি৫ ক্যাপ এবং রিপ এর সাবসেলুলার স্থানীয়করণ
![]()
চিত্র ৩. পিসিভি-৫ স্ট্রেন এবং পিসিভি-১, পিসিভি-২, পিসিভি-৩, পিসিভি-৪, পিসিএলভি এবং বেশ কয়েকটি মানব সার্কোভাইরাসগুলির মধ্যে জেনেটিক সম্পর্ক।
অন্যান্য সার্কোভাইরাসগুলির সাথে 12 টি পিসিভি 5 স্ট্রেনের রেপ (এ) এবং ক্যাপ (বি) এর অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের পরিচয়। কালো নক্ষত্রগুলি পিসিভি 1, পিসিভি 2, পিসিভি 3, পিসিভি 4 এবং পিসিএলভিকে উপস্থাপন করে,এবং নীল বৃত্তগুলি FSfaCV স্ট্রেন (অংশগ্রহণ নম্বর KF246569) উপস্থাপন করে.1) ।
![]()
চিত্র ৪। CRESS ডিএনএ ভাইরাসের রেপ প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের ভিত্তিতে নির্মিত ফাইলোজেনেটিক গাছ।
পিসিভি-৫ স্ট্রেনগুলি লাল বৃত্ত দিয়ে চিহ্নিত করা হয় এবং কালো বৃত্তগুলি পাঁচটি শূকর সার্কোভাইরাসকে প্রতিনিধিত্ব করেঃ পিসিভি-১, পিসিভি-২, পিসিভি-৩, পিসিভি-৪ এবং পিসিএলভি।
3জৈব রাসায়নিক এবং আকারগত বৈশিষ্ট্যঃ
PCV5 Rep প্রোটিনটি CRESS ডিএনএ ভাইরাসগুলির সাধারণ এন্ডোনুক্লিয়াস, অলিগোমেরাইজেশন এবং হেলিকাজ ডোমেনগুলি ধারণ করে এবং এটিপিজেস কার্যকলাপ প্রদর্শন করে; ভাইরাস কণাগুলি অ-আচ্ছাদিত আইকোসাহেড্রাল,প্রায় ২০ এনএম ব্যাসার্ধ, এবং কেপ প্রোটিনটি ভাইরাসের মতো কণা তৈরি করতে পারে।
![]()
চিত্র ৫. পিসিভি৫ রেপ এর দ্রবণীয় অভিব্যক্তি এবং এটিপিএজ কার্যকলাপের নির্ধারণ
(ক) পিসিভি৫ রেপ এবং পিসিভি২ রেপ এর কাঠামোগত তুলনা। নীল, সাদা, হলুদ এবং কমলা অত্যন্ত উচ্চ, নির্ভরযোগ্য, নিম্ন এবং অত্যন্ত নিম্ন পূর্বাভাসিত স্থানীয় দূরত্ব পার্থক্য পরীক্ষার (পিএলডিডিটি) স্কোর উপস্থাপন করে।যথাক্রমে (pLDDT পরিসীমা 0-100, যা অবশিষ্টাংশের নির্ভরযোগ্যতা বন্টনকে প্রতিফলিত করে) N এবং C যথাক্রমে প্রোটিনের N-terminus এবং C-terminus প্রতিনিধিত্ব করে।
(B) পূর্ণ দৈর্ঘ্যের PCV5 Rep এর ইলেক্ট্রোফোরেসিস ফলাফল। M হল প্রোটিনের আণবিক ওজন চিহ্নিতকারী। লাইন 1 হল প্রবর্তনের আগে নমুনা, লাইন 2 হল প্রবর্তনের পরে নমুনা,লাইন ৩ হল ইনডাকশনের পর সুপারন্যাটেন্ট নমুনা, এবং লাইন ৪ হল ইনডাকশনের পর অবনতির নমুনা।
(C) PCV5 Rep PGEX-GST প্লাস্মিড প্রোকারিওটিক সিস্টেমে NΔ118 এর স্থিতিশীল অভিব্যক্তি; লাইন 1: প্রয়োগের আগে নমুনা; লাইন 2: প্রয়োগের পরে precipitate; লাইন 3: নিকেল কলাম অনুপ্রবেশ বাফার;লাইন ৪-৬: যথাক্রমে ৩০ এমএম, ৫০ এমএম এবং ৩০০ এমএম ইমিডাজল এলিউশন বাফার; (D) আণবিক সিট বিশুদ্ধকরণের পরে প্রোটিন ঘনত্ব এবং ইলেক্ট্রোফোরেসিসের ফলাফল; (E) পিসিভি ৫ রেপ এনডি১১৮ এর এটিপিএজ কার্যকারিতা মূল্যায়ন।
4. রোগজনিততার প্রমাণঃ
পিসিভি-৫ শ্বাসযন্ত্রের রোগ, ডায়রিয়া, এবং শূকর বাচ্চাদের প্রজনন ব্যাধিগুলির সাথে যুক্ত এবং এটি সিরকোভাইরাস-সম্পর্কিত রোগের (পিসিভিএডি) কারণ হতে পারে। এটি ব্যাপকভাবে একাধিক অঙ্গকে সংক্রামিত করে,হৃদয় সহ, লিভার, মৃগী, ফুসফুস, কিডনি, মস্তিষ্ক এবং অন্ত্র, এবং রক্ত-মস্তিষ্কের বাধা অতিক্রম করতে পারে; ভাইরাল কপি সংখ্যা রোগের তীব্রতার সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত,ইলেয়ামে সবচেয়ে বেশি ক্ষতি হয়. পিসিভি-৫-এ আক্রান্ত ইঁদুরগুলিতে কোনো ক্লিনিকাল লক্ষণ দেখা যায় না এবং ভাইরাসটি সনাক্ত করা যায় না, যা তাদের পিসিভি-৫ রোগের মডেল হিসেবে অনুপযুক্ত করে তোলে।
![]()
চিত্র ৬। ১২টি শুয়োরের অঙ্গের মধ্যে PCV5 ভাইরাসের সিটি মান
সংক্ষিপ্তসার
এই গবেষণায় প্রথমবারের মতো পিসিভি-৫ এর অস্তিত্ব এবং রোগজীবাণু প্রমাণিত হয়েছে, এছাড়া শূকর সার্কোভাইরাসকে শ্রেণীবিভাজন করার বর্তমান কাঠামো ভেঙে দেওয়া হয়েছে।CRESS ডিএনএ ভাইরাসগুলির বৈচিত্র্যের গবেষণার জন্য একটি নতুন দৃষ্টিভঙ্গি প্রদান করেদক্ষিণ চীনে পিসিভি-৫-এর উচ্চ প্রাদুর্ভাব এবং বিস্তৃত রোগজীবাণু উদ্ভাবন বর্তমান শূকর সার্কোভাইরাস রোগ প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থার জন্য নতুন চ্যালেঞ্জ সৃষ্টি করেছে।এবং লক্ষ্যবস্তু ডায়াগনস্টিক রিএজেন্ট এবং ভ্যাকসিনের বিকাশের ভিত্তি স্থাপন করে.
ভবিষ্যতের গবেষণায় পিসিভি-৫ এর সংক্রমণ পথ, প্রজাতি-প্রজাতি সংক্রমণের ঝুঁকি এবং অন্যান্য রোগজীবাণুর সাথে সংক্রমণের প্রক্রিয়া আরও স্পষ্ট হবে।বৈজ্ঞানিক প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণ কৌশল তৈরির জন্য তাত্ত্বিক সহায়তা প্রদান.
ব্যক্তি যোগাযোগ: Mr. Huang Jingtai
টেল: 17743230916