nouvelles de l'entreprise Une nouvelle percée dans la recherche sur l'évolution du PEDV. Une analyse systématique du gène S de 1109 souches en Chine

Le virus de la diarrhée épidémique porcine (VEDP) est un pathogène majeur dans l'industrie porcine mondiale.une épidémie de GII a éclaté en Chine (avec un taux de mortalité des porcelets supérieur à 90%)L'échec du vaccin classique a révélé que le virus peut échapper à l'immunité par dérive antigénique ou recombinaison, et le mécanisme spécifique reste à élucider.

Le 2 juillet 2025, une équipe de l'Université Northwest A&S et de l'Institut vétérinaire de Lanzhou a publié une étude dans la revue BMC Vet Res basée sur 1 109 souches de VEDP, révélant des mutations du gène S,points chauds de recombinaison, et des variations de glycosylation, fournissant un soutien clé pour le développement de vaccins.

Les résultats ont montré que les souches GII (87,38%) conduisent l'évolution et la prévalence de la VEPD par des mutations à haute fréquence dans la région du COE (comme L521H), les points chauds de recombinaison du domaine 0,les variations de glycosylation N62/N118, améliorant la liaison aux récepteurs et l' évasion immunitaire.

Introduction au projet

L'analyse du gène S de 1 109 souches de PEDV dans mon pays a révélé que les souches GII (dominantes,Les acides sialiques (qui représentent plus de 85% du GIIa/b/c combiné) évoluent à travers une double stratégie de liaison à l'acide sialique et d'évasion immunitaire.." Leurs points chauds de recombinaison (domaine D0) et leurs schémas de glycosylation uniques (sites N62/N118) stimulent la transmission entre espèces,fournir des informations clés pour l'optimisation des vaccins et la prévention et le contrôle régionaux.

Résultats de la recherche

1Les souches GII dominent

Un arbre phylogénétique montre que les souches de PEDV en Chine appartiennent à deux grands clades: GI (classique) et GII (variante), comprenant six sous-types.La proportion de GIIa est en baisse depuis 2014La GIIb reste stable, les deux derniers sous-types constituant actuellement les souches prédominantes.

Figure 1. Analyse phylogénétique des séquences du gène S de 1099 isolats de PEDV dans cette étude.

Gla (jaune), Glb (brun), S-INDEL (violet),

Le GIIa (rouge), le GIIb (bleu) et le GIIc (vert).

Figure 2. Fréquence relative des différents sous-types de virus par année.

Figure 3. Répartition géographique de la PEDV dans les différentes régions de Chine

Les provinces sont divisées en sept régions en fonction de la distance: Chine du Nord, Chine du Nord-Est, Chine de l'Est, Chine centrale, Chine du Sud, Chine du Sud-Ouest et Chine du Nord-Ouest.

Conclusion: L'analyse de la répartition géographique montre que les provinces du Guangdong, du Sichuan et du Henan présentent la prévalence la plus élevée du VEDP.

2Mutations dans les protéines d' acides aminés

La comparaison des épitopes neutralisants dans la protéine S de différentes souches a révélé huit mutations courantes avec une fréquence élevée dans la région COE, y compris L521H et S523G,ainsi que la variante croisée du sous-type A517SLa région SS6 est dominée par la mutation Y766S. La souche GIIa a une insertion clé aux positions 608-609.suggérant que le virus échappe à la pression immunitaire par des mutations épitopiques ciblées.

Figure 4. Analyse des mutations d'acides aminés des épitopes neutralisants SS2 (A),

SS6 (B), 2C10 (C) et COE (D) dans la protéine chinoise PEDV S

Conclusion: les souches GII présentent des mutations fréquentes dans les régions COE et SS6 (par exemple, L521H/S523G, Y766S), mais les épitopes SS2 et 2C10 sont très conservés,leur permettant d'échapper aux anticorps neutralisants.

3Analyse de la recombinaison

Les recherches ont montré que la recombinaison est une force motrice clé dans l'évolution virale du VEDP.L'analyse indique que les souches GII sont la principale source parentale des événements de recombinaison récents dans le gène S des souches PEDV.

Plus précisément: les souches recombinantes GIb sont principalement formées par recombinaison entre les souches GI et GII, et leurs régions de recombinaison incluent toutes le domaine 0;Les souches recombinantes GIIb sont principalement produites par recombinaison entre différentes souches GIIb, et les régions de recombinaison couvrent principalement HR2, TM et domaine 0; une partie des souches recombinables GIIc provient de la recombinaison entre souches GIIb,et la région comprend essentiellement FP et HR1 de S1 et S2, tandis que l'autre partie est le recombinant des souches GIa et GIIb, et la région de recombinaison comprend également le domaine 0.

Tableau 1. Informations sur les événements de recombinaison du gène S dans 282 souches de VPD en Chine de 2020 à 2024

Conclusion: Ces dernières années, les événements de recombinaison du gène S se sont principalement produits dans les souches GII, et tous les types de recombinaison impliquent des régions clés telles que le domaine 0.

4Variation du site de N-glycosylation

Des études ont montré que la N-glycosylation est cruciale pour l'invasion du VEDP et l'évasion immunitaire.Les souches G1 (contenant des G1a/G1b/S-INDEL) présentent des schémas de glycosylation similaires à ceux des souches CV777 et manquent de sites nouvellement ajoutés.Cependant, les souches GII (GIIa/GIIb/GIIc) présentent des sites très spécifiques nouvellement ajoutés (par exemple, N62 et N118) dans le domaine 0, ce qui peut avoir un impact sur les interactions hôte-virus et la reconnaissance immunitaire.

En comparaison avec la souche de vaccin CV777, la protéine S des différents sous-types de VEDP présente des différences dans le nombre de sites clés de N-glycosylation.

Conclusion: Par rapport à la souche CV777, tous les sous-types ont généralement perdu leur glycosylation aux sites 127, 511 et 553.

Résumé

Cette étude a révélé trois caractéristiques évolutives clés des virus PEDV en Chine:Les sous-types GII atteignent les deux avantages d'une "haute affinité pour l'acide sialique et d'une évasion immunitaire" grâce à des mutations dans le domaine D0.; les points chauds de recombinaison concentrés dans la région D0 stimulent l'évolution adaptative; et les modifications de glycosylation aux sites N62/N118 médient l'évasion immunitaire.

Ainsi, des stratégies ciblées de prévention et de contrôle sont proposées: développer un vaccin à ARNm multivalent ciblant les épitopes aglycosylés,établissant un système de surveillance basé sur les points chauds de recombinaison, et d'évaluer le risque de transmission entre espèces.