berita perusahaan tentang Data epidemiologi terbaru tentang rotavirus babi di Tiongkok Barat Daya dirilis! Genotipe G9/G4 menjadi arus utama, dan rec

Pada tanggal 29 November 2025, tim Profesor Yan Qigui dari College of Veterinary Medicine, Universitas Pertanian Sichuan, and the Juxing Agricultural and Animal Husbandry Research Institute published a new study in the international journal *Veterinary Sciences* on the molecular epidemiological characteristics and virus isolation and identification of porcine rotavirus (PoRV) in Southwest China.

Studi ini secara sistematis mengungkapkan karakteristik epidemiologis, perubahan genotipe, dan rekombinasi lintas spesies PoRV di China Barat Daya dari tahun 2024 hingga 2025,memberikan bukti ilmiah penting untuk pencegahan dan pengendalian diare babi dan peningkatan vaksin.

Sorotan Penelitian

* **Situasi parah:** Tingkat infeksi PoRV di barat daya China setinggi 57,14%, jauh melebihi wilayah lain di China (Guangdong 36,44%, Guangxi 37,13%),membuat itu patogen utama diare virus pada babi di wilayah.

* **Rearrangement Genotypic Major:** Genotipe G5 yang secara tradisional dominan telah digantikan oleh G9 (35,71%) dan G4 (39,28%), sedangkan vaksin komersial saat ini hanya mengandung genotipe G5,menimbulkan pertanyaan tentang efektivitas pelindung mereka.

• Peringatan rekombinasi lintas spesies: Strain G1P[7] langka diisolasi untuk pertama kalinya di Sichuan. Analisis genomik mengkonfirmasi bahwa fragmen gen NSP2-NSP4 berasal dari rotavirus manusia,menimbulkan risiko penularan antar spesies.

• Koeksistensi beberapa patogen: Rotavirus Grup C terdeteksi pada 33,04% sampel dan 7,14% adalah infeksi campuran dari Grup B dan Grup C,menunjukkan tingkat yang belum pernah terjadi sebelumnya dari kompleksitas dalam epidemi.

Penelitian ini bertujuan untuk secara sistematis menyelidiki prevalensi dan karakteristik molekuler rotavirus babi (PoV) di peternakan babi berskala besar di barat daya China dari tahun 2024 hingga 2025,mengisi kesenjangan penelitian di bidang ini.

Tim peneliti mengumpulkan 196 sampel diare klinis dari 29 peternakan babi berskala besar di China Barat Daya selama 2024-2025. Menggunakan teknik seperti RT-qPCR, RT-PCR, isolasi virus,Urutan seluruh genom, dan analisis filogenetik, mereka melakukan analisis mendalam tentang prevalensi, distribusi genotipe, karakteristik seluruh genom, dan hubungan evolusi genetik PoV.

Pengantar

Rotavirus babi adalah salah satu patogen utama yang menyebabkan diare akut pada anak babi, seringkali mengakibatkan infeksi bersamaan dengan patogen diare lainnya dan menyebabkan kerugian ekonomi yang serius.tidak mendapat perhatian yang cukup karena tingkat kematian yang rendahNamun, dalam beberapa tahun terakhir, prevalensinya telah meningkat secara signifikan, dan genotipnya menjadi semakin kompleks, menimbulkan tantangan baru untuk pencegahan dan pengendalian.

Pada tahun 2023, tingkat deteksi rotavirus babi dalam kawanan babi di negara saya melebihi virus diare epidemi babi (PEDV) untuk pertama kalinya, menjadi "patogen diare nomor satu"." Barat daya negara saya, sebuah wilayah peternakan babi utama, sangat terpengaruh oleh epidemi, tetapi data epidemiologi molekuler sistematis kurang.

Hasil Penelitian

1Deteksi sampel dan karakteristik epidemiologis:

Dari tahun 2024 hingga 2025, tim peneliti mengumpulkan 196 sampel diare (100 sampel jaringan usus dan 96 sampel feses) dari 29 peternakan babi berskala besar di barat daya China.

· Tingkat positif PoRV secara keseluruhan adalah 57,14% (112/196), dengan kelompok A (PoRVA) menyumbang proporsi tertinggi (46,43%), menjadikannya kelompok dominan mutlak;

· Tingkat positif untuk kelompok B (PoRVB) dan kelompok C (PoRVC) masing-masing 10,71% dan 33,04%, dengan tingkat infeksi campuran 9,82%, dan kombinasi PoRVB+PoRVC yang paling umum (7,14%).

Tabel 1. Tingkat positif dalam kelompok PoRV yang berbeda.

2Distribusi genotipe dan analisis evolusioner:

Analisis sekuensing gen VP4 dan VP7 pada 52 sampel positif PoRVA menunjukkan bahwa:

· Genotipe VP4 diklasifikasikan menjadi empat genotipe P: P[13] (77.78%), P[7] (14.81%), P[6] (3.7%), dan P[23] (3.7%), dengan P[13] sebagai genotipe dominan mutlak;

Gambar 1. pohon ML gen VP4 dalam sampel PoRVA.

· Gen VP7 diklasifikasikan menjadi 6 genotipe G: G4 (39,28%), G9 (35,71%), G5 (10,71%), G1 (7,14%), G3 (3,57%), dan G11 (3,57%);

· Kombinasi G/P yang dominan adalah G9P[13] dan G4P[13] (masing-masing menyumbang 33,33%), yang secara signifikan berbeda dari G5P[7] dan G3P[13] yang populer secara tradisional.

Gambar 2. pohon ML dari gen VP7 dalam sampel PoRVA.

3Isolasi virus dan karakteristik genomik:

Satu strain PoRV (RVA/Pig-wt/SCLS-JW/2024/G1P [7]) berhasil diisolasi.Morfologi dan infektivitas rotavirus khasnya diverifikasi dengan mikroskop elektron transmisi dan imunofluoresensi tidak langsung (IFA).:

· Konstelasi genom adalah G1-P [7]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1, dan gen struktural (VP1-VP4, VP6-VP7) sangat homolog dengan strain babi;

Gambar 3. Pohon filogenetik gen VP1 hingga VP4, VP6, dan VP7 dalam isolate RVA/SCLS-JW/2024.

• Gen non-struktural NSP2-NSP4 menunjukkan 94%-98% kesamaan dengan rotavirus manusia, mengkonfirmasi sebagai strain rekombinan manusia-babi;

Gambar 4. Pohon filogenetik gen NSP1 hingga NSP5 dalam isolate RVA/SCLS-JW/2024.

· Strain ini mereplikasi dengan baik pada sel MA104, mencapai titer virus 106 TCID50/ ml setelah 24 jam, menunjukkan kemampuan replikasi yang kuat.

Gambar 5. Hasil isolasi dan identifikasi virus.

Ringkasan

Studi ini secara sistematis mengungkapkan karakteristik epidemiologis terbaru dari rotavirus babi di barat daya China dari tahun 2024 hingga 2025,yang memperjelas bahwa genotipe G9 dan G4 telah menggantikan G5 tradisional sebagai strain yang mendominasi, mengisi kesenjangan dalam data epidemiologi molekuler terbaru untuk wilayah ini.

Hasilnya menunjukkan ketidakcocokan antigenik yang signifikan antara strain vaksin yang ada dan strain yang beredar, yang dapat mempengaruhi efektivitas perlindungan kekebalan tubuh.strain rekombinan manusia-babi yang teridentifikasi menunjukkan risiko penularan antar spesies, yang menyoroti pentingnya pengawasan terus menerus dan pembaruan vaksin untuk pengendalian diare virus babi.