اخبار شرکت آخرین داده های اپیدمیولوژیکی در مورد روتا ویروس خوک در جنوب غربی چین منتشر شد!

در تاریخ ۲۹ نوامبر ۲۰۲۵، تیم پروفسور یان کی‌گویی از دانشکده دامپزشکی دانشگاه کشاورزی سیچوان و مؤسسه تحقیقات کشاورزی و دامپروری جوکسینگ، مطالعه جدیدی را در مجله بین‌المللی *علوم دامپزشکی* در مورد ویژگی‌های اپیدمیولوژیک مولکولی و جداسازی و شناسایی ویروس روتاویروس خوکی (PoRV) در جنوب غربی چین منتشر کردند.

این مطالعه به طور سیستماتیک ویژگی‌های اپیدمیولوژیک، تغییرات ژنوتیپی و نوترکیبی بین گونه‌ای PoRV را در جنوب غربی چین از سال ۲۰۲۴ تا ۲۰۲۵ نشان داد و شواهد علمی حیاتی را برای پیشگیری و کنترل اسهال خوک و ارتقای واکسن ارائه کرد.

نکات برجسته تحقیق

* **وضعیت شدید:** میزان عفونت PoRV در جنوب غربی چین به ۵۷.۱۴٪ می‌رسد که بسیار بیشتر از سایر مناطق چین (گوانگدونگ ۳۶.۴۴٪، گوانگشی ۳۷.۱۳٪) است و آن را به عامل اصلی بیماری‌زای اسهال ویروسی در خوک‌ها در این منطقه تبدیل می‌کند.

* **تغییر ژنوتیپی عمده:** ژنوتیپ G5 که به طور سنتی غالب بود، جای خود را به G9 (35.71%) و G4 (39.28%) داده است، در حالی که واکسن‌های تجاری فعلی فقط حاوی ژنوتیپ G5 هستند که این امر سوالاتی را در مورد اثربخشی محافظتی آن‌ها ایجاد می‌کند.

• هشدار نوترکیبی بین گونه‌ای: یک سویه نادر G1P[7] برای اولین بار در سیچوان جدا شد. تجزیه و تحلیل ژنومی تأیید کرد که قطعات ژن NSP2-NSP4 آن از روتاویروس انسانی منشأ گرفته‌اند و خطر انتقال بین گونه‌ای را به همراه دارد.

• همزیستی چندین عامل بیماری‌زا: روتاویروس گروه C در ۳۳.۰۴٪ از نمونه‌ها شناسایی شد و ۷.۱۴٪ عفونت‌های ترکیبی از گروه B و گروه C داشتند که نشان‌دهنده سطح بی‌سابقه‌ای از پیچیدگی در همه‌گیری است.

هدف این مطالعه بررسی سیستماتیک شیوع و ویژگی‌های مولکولی روتاویروس خوکی (PoV) در مزارع بزرگ خوک در جنوب غربی چین از سال ۲۰۲۴ تا ۲۰۲۵ است و شکاف تحقیقاتی در این زمینه را پر می‌کند.

تیم تحقیقاتی ۱۹۶ نمونه اسهال بالینی را از ۲۹ مزرعه بزرگ خوک در جنوب غربی چین در سال‌های ۲۰۲۴-۲۰۲۵ جمع‌آوری کرد. با استفاده از تکنیک‌هایی مانند RT-qPCR، RT-PCR، جداسازی ویروس، توالی‌یابی کل ژنوم و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، آن‌ها تجزیه و تحلیل عمیقی از شیوع، توزیع ژنوتیپ، ویژگی‌های کل ژنوم و روابط تکاملی ژنتیکی PoV انجام دادند.

مقدمه

روتاویروس خوکی یکی از عوامل بیماری‌زای اصلی است که باعث اسهال حاد در بچه خوک‌ها می‌شود و اغلب منجر به عفونت همزمان با سایر عوامل بیماری‌زای اسهال و ایجاد خسارات اقتصادی جدی می‌شود. در گذشته، به دلیل میزان مرگ و میر کم، توجه کافی به آن نمی‌شد. با این حال، در سال‌های اخیر، شیوع آن به طور قابل توجهی افزایش یافته و ژنوتیپ‌های آن به طور فزاینده‌ای پیچیده شده‌اند و چالش‌های جدیدی را برای پیشگیری و کنترل ایجاد کرده‌اند.

در سال ۲۰۲۳، میزان تشخیص روتاویروس خوکی در گله‌های خوک در کشور من برای اولین بار از ویروس اسهال همه‌گیر خوکی (PEDV) فراتر رفت و به «عامل بیماری‌زای شماره یک اسهال» تبدیل شد. جنوب غربی کشور من، یک منطقه اصلی پرورش خوک، به ویژه تحت تأثیر این همه‌گیری قرار دارد، اما داده‌های اپیدمیولوژیک مولکولی سیستماتیک وجود ندارد.

نتایج تحقیق

۱. تشخیص نمونه و ویژگی‌های اپیدمیولوژیک:

از سال ۲۰۲۴ تا ۲۰۲۵، تیم تحقیقاتی ۱۹۶ نمونه اسهال (۱۰۰ نمونه بافت روده و ۹۶ نمونه مدفوع) را از ۲۹ مزرعه بزرگ خوک در جنوب غربی چین جمع‌آوری کرد. آزمایش RT-qPCR نشان داد:

· میزان مثبت بودن کلی PoRV 57.14٪ (112/196) بود که گروه A (PoRVA) بیشترین سهم را داشت (46.43٪) و آن را به گروه غالب مطلق تبدیل کرد;

· میزان مثبت بودن برای گروه B (PoRVB) و گروه C (PoRVC) به ترتیب ۱۰.۷۱٪ و ۳۳.۰۴٪ بود، با میزان عفونت ترکیبی ۹.۸۲٪ و ترکیب PoRVB+PoRVC رایج‌ترین (۷.۱۴٪) بود.

جدول ۱. میزان مثبت بودن در گروه‌های مختلف PoRV.

۲. توزیع ژنوتیپ و تجزیه و تحلیل تکاملی:

تجزیه و تحلیل توالی ژن‌های VP4 و VP7 در ۵۲ نمونه مثبت PoRVA نشان داد:

· ژنوتیپ‌های VP4 به چهار ژنوتیپ P طبقه‌بندی شدند: P[13] (77.78٪)، P[7] (14.81٪)، P[6] (3.7٪) و P[23] (3.7٪)، که P[13] ژنوتیپ غالب مطلق بود;

شکل ۱. درخت ML ژن VP4 در نمونه‌های PoRVA.

· ژن VP7 به ۶ ژنوتیپ G طبقه‌بندی شد: G4 (39.28٪)، G9 (35.71٪)، G5 (10.71٪)، G1 (7.14٪)، G3 (3.57٪) و G11 (3.57٪);

· ترکیبات غالب G/P عبارت بودند از G9P[13] و G4P[13] (هر کدام ۳۳.۳۳٪)، که با G5P[7] و G3P[13] که به طور سنتی محبوب بودند، تفاوت قابل توجهی داشتند.

شکل ۲. درخت ML ژن VP7 در نمونه PoRVA.

۳. جداسازی ویروس و ویژگی‌های ژنومی:

یک سویه PoRV (RVA/Pig-wt/SCLS-JW/2024/G1P [7]) با موفقیت جدا شد. مورفولوژی و عفونت‌زایی معمولی آن توسط میکروسکوپ الکترونی انتقالی و ایمونوفلورسانس غیرمستقیم (IFA) تأیید شد:

· صورت فلکی ژنومی G1-P [7]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1 است و ژن‌های ساختاری (VP1-VP4، VP6-VP7) بسیار همولوگ با سویه‌های خوکی هستند;

شکل ۳. درخت فیلوژنتیک ژن‌های VP1 تا VP4، VP6 و VP7 در جدایه RVA/SCLS-JW/2024.

• ژن‌های غیرساختاری NSP2-NSP4 شباهت ۹۴٪ تا ۹۸٪ به روتاویروس انسانی نشان می‌دهند و آن را به عنوان یک سویه نوترکیب انسانی-خوکی تأیید می‌کنند;

شکل ۴. درخت فیلوژنتیک ژن‌های NSP1 تا NSP5 در جدایه RVA/SCLS-JW/2024.

· این سویه در سلول‌های MA104 به خوبی تکثیر شد و پس از ۲۴ ساعت به تیتر ویروسی ۱۰⁶ TCID₅₀/mL رسید که نشان‌دهنده توانایی تکثیر قوی است.

شکل ۵. نتایج جداسازی و شناسایی ویروس.

خلاصه

این مطالعه به طور سیستماتیک آخرین ویژگی‌های اپیدمیولوژیک روتاویروس خوکی را در جنوب غربی چین از سال ۲۰۲۴ تا ۲۰۲۵ نشان داد و مشخص کرد که ژنوتیپ‌های G9 و G4 جایگزین G5 سنتی به عنوان سویه‌های غالب در گردش شده‌اند و شکافی را در داده‌های اپیدمیولوژیک مولکولی اخیر برای این منطقه پر می‌کنند.

نتایج نشان‌دهنده عدم تطابق آنتی‌ژنی قابل توجهی بین سویه‌های واکسن موجود و سویه‌های در گردش است که ممکن است بر اثربخشی محافظت ایمنی تأثیر بگذارد. در همین حال، سویه‌های نوترکیب انسانی-خوکی شناسایی شده خطر انتقال بین گونه‌ای را نشان می‌دهند و اهمیت نظارت مداوم و به‌روزرسانی واکسن‌ها را برای کنترل اسهال ویروسی خوکی برجسته می‌کنند.