Le 16 janvier 2026,Une équipe de recherche conjointe de l'Université de Jilin et de la Biopharmaceutique Tiankang du Xinjiang a publié ses dernières recherches sur les virus liés à la diarrhée dans les troupeaux de porcs chinois dans * Pathogen GeneticsCette étude a systématiquement révélé les modèles de distribution spatio-temporelle et les caractéristiques évolutives moléculaires de quatre virus majeurs de la diarrhée (PEDV).,PoRVA, TGEV et PDCoV) entre 2022 et 2024, fournissant des preuves scientifiques importantes pour la prévention et le contrôle précis de la diarrhée virale chez les porcs dans mon pays et pour le développement de vaccins.
Points marquants de la recherche
* Le VEDP est absolument dominant: avec un taux de positivité de 50,90% et un taux de positivité de 66,67% dans les exploitations, il est le principal agent pathogène responsable de la diarrhée porcine.
* Le PoRVA représente une menace importante: avec un taux de positivité de 33,80%, et son taux d'infection a dépassé celui du PEDV dans six provinces, dont le Henan et le Gansu,nécessitant une surveillance étroite de sa situation épidémique.
• Des variations saisonnières et régionales importantes: la PEDV est prévalente au printemps et en hiver, tandis que la PoRVA augmente au quatrième trimestre.Les taux d'infection par le VEDP sont généralement plus élevés dans les provinces du sud, tandis que la PoRVA est plus active dans le centre et le nord-ouest de la Chine.
• Co-infection généralisée: le taux de co-infection du VEDP et du VPOV est aussi élevé que 19,05%, ce qui augmente considérablement la complexité clinique et la difficulté de prévention et de contrôle.
• Révèle les principales caractéristiques de la variation antigénique: pour la première fois, le schéma de variation des épitopes neutralisants de la protéine PEDV S dans la souche circulante actuelle a été élucidé:Les épitopes SS2 et SS6 sont très conservés et constituent des cibles idéales pour la conception de vaccins à large spectre.; tandis que les régions COE et 2C10 présentent des variations fréquentes, ce qui suggère un risque important d'évasion immunitaire virale et en fait un objectif clé pour les mises à jour des vaccins.
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Entre 2022 et 2024, l'équipe de recherche a recueilli 1343 échantillons de diarrhée (tissu intestinal, contenu intestinal et excréments) provenant de 84 élevages de porcs dans 20 provinces de Chine.Utilisation de la PCR quantitative quadruple en temps réel, ils ont systématiquement analysé l'état d'infection du PEDV, du PoRVA, du TGEV et du PDCoV, et ont séquencé et effectué une analyse évolutive du gène S du PEDV et du gène VP7 du PoRVA.
Introduction au projet
La diarrhée virale porcine est l'une des principales maladies infectieuses auxquelles l'industrie porcine mondiale est confrontée, touchant principalement les porcelets et provoquant une diarrhée sévère, des vomissements et une déshydratation.Les taux de mortalité chez les porcelets de 3 jours peuvent atteindre 70% à 100%..
Dans mon pays, la diarrhée virale porcine est depuis longtemps endémique et son schéma épidémique a continué de changer ces dernières années.L'évolution moléculaire continue de différents virus (tels que le PEDV et le PoRVA) pose des défis continus à la prévention et au contrôle précis.Par conséquent, systematically elucidating the epidemiological patterns and molecular characteristics of the current major diarrhea viruses is of urgent practical significance for updating prevention and control strategies and guiding vaccine development.
Résultats de la recherche
1Le PEDV reste l'agent pathogène dominant à l'origine de la diarrhée porcine, les infections mixtes étant un problème majeur.
L'équipe de recherche a effectué des tests RT-qPCR quadruples sur 1343 échantillons. Les résultats ont montré un taux de positivité du PEDV aussi élevé que 50,90% (66,67% des élevages porcs ont été infectés);le taux de positivité au PoRVA était de 33.80%. En revanche, les taux de détection du TGEV (3,10%) et du PDCoV (6,00%) étaient inférieurs.indiquant une complexité significativement accrue dans le contrôle de la diarrhée porcine.
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Figure 1. Statut épidémiologique des virus associés à la diarrhée.
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Tableau 1. Épidémiologie des virus liés à la diarrhée porcine dans diverses provinces de Chine.
2. Différences régionales significatives en épidémiologie entre le nord et le sud de la Chine.
L'analyse de la visualisation géographique montre que, dans cette enquête, la prévalence du VEDP était significativement plus élevée dans le sud de la Chine (Guangdong, Guangxi et Yunnan), avec des taux de positivité supérieurs à 80%;Le PoRVA a formé des zones à forte prévalence dans le HenanLe PDCoV a été principalement détecté dans le Jiangxi et le Henan, suivi par le Gansu et le Liaoning; le TGEV n'a été détecté que de manière sporadique dans quatre provinces,restant globalement à un faible niveau de prévalence.
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Figure 2. Visualisation géographique de l'état d'infection de quatre virus liés à la diarrhée dans différentes régions de Chine.
3L'hiver et le printemps sont les principales saisons de pointe pour la propagation des virus de la diarrhée porcine.
La surveillance trimestrielle de 2022 à 2024 a montré que le VEDP était détectable toute l'année, mais les taux de positivité au premier, deuxième et quatrième trimestre étaient nettement plus élevés qu'en été (troisième trimestre);Le PoRVA a affiché un pic saisonnier clair, le taux de positivité augmentant à 57% ∼65% au quatrième trimestre de chaque année. Le PDCoV n'a pas été détecté en 2022, mais le taux de détection a considérablement augmenté à partir de 2023;Le TGEV a été détecté à nouveau à partir du quatrième trimestre 2023, ce qui suggère une éventuelle tendance à la reprise.
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Figure 3. Statut de l'infection et tendances de quatre virus liés à la diarrhée dans différentes régions de Chine de 2022 à 2024.
4L'évolution du gène PEDV est dominée par GIIa et GIIc.
L'analyse de séquence de 21 souches de gènes PEDV S a montré que la GIIa représentait 52,38%, la GIIc 42,86% et la GIIb 4,76%.L'analyse des épitopes a montré que les épitopes neutralisants de SS2 et SS6 étaient très conservés (une seule variation d'acide aminé a été trouvée), fournissant des cibles potentielles pour la conception de vaccins; cependant, 24 sites de mutation d'acides aminés sont apparus dans la région COE, et l'épitope 2C10 a montré des variations fréquentes,qui peut être liée à une fuite immunitaire virale.
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Figure 4. Arbre phylogénétique construit sur la base du gène PEDV S.
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Figure 5. Comparaison des épitopes d'acides aminés de la protéine PEDV S.
5. Les génotypes de la VARPO présentent une diversité significative.
L'analyse du gène VP7 de 16 souches de PoRVA a identifié six génotypes: G1, G3, G4, G5, G9 et G11.L' analyse de l' épitope a montré que, à l' exception de G1, les autres génotypes ont présenté une variation significative dans les régions d'antigènes A, B et C, tandis que la région E était relativement conservée.Cette étude a également identifié trois peptides courts conservés (aa106, 159?? 170 et 251?? 259), toutes situées dans la région de la boucle protéique VP7, qui ont une valeur de recherche en tant que cibles diagnostiques potentielles et antigènes candidats au vaccin.
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Figure 6. Arbre phylogénétique de PoRVA construit sur la base du gène VP7.
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Figure 7. Comparaison des épitopes d'acides aminés de la protéine PoRVA VP7.
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Figure 8. Emplacement du peptide PoRVA conservé dans la structure résolue de VP7.
Résumé
Cette étude a non seulement mis à jour les données de référence épidémiologiques du virus de la diarrhée porcine (VDPP) en Chine,Mais il a également révélé les caractéristiques évolutionnaires et les modèles de variation antigénique du PEDV et du PoRVA au niveau moléculaire.Les résultats indiquent que la conception actuelle du vaccin devrait se concentrer sur les régions hypervariables du VDEP telles que le COE et le 2C10,et explorer le potentiel des peptides PoRVA conservés comme cibles candidates de vaccins à large spectreParallèlement, l'étude suggère de renforcer les efforts de surveillance et de contrôle pendant l'hiver et le printemps et dans les zones à forte incidence, et de mettre en œuvre des mesures ciblées de vaccination et de biosécurité.
Personne à contacter: Mr. Huang Jingtai
Téléphone: 17743230916