Il 16 gennaio 2026,un gruppo di ricerca congiunto dell'Università di Jilin e della Xinjiang Tiankang Biopharmaceutical ha pubblicato la loro ultima ricerca sui virus correlati alla diarrea nelle mandrie di suini cinesi in Patogen GeneticsQuesto studio ha rivelato in modo sistematico i modelli di distribuzione spaziotemporale e le caratteristiche evoluzionistiche molecolari di quattro dei principali virus della diarrea (PEDV).,PoRVA, TGEV e PDCoV) tra il 2022 e il 2024, fornendo importanti prove scientifiche per la prevenzione e il controllo precisi della diarrea virale nei suini nel mio paese e per lo sviluppo di vaccini.
Punti salienti della ricerca
* Il PEDV è assolutamente dominante: con un tasso di positività fino al 50,90% e un tasso di positività delle aziende agricole pari al 66,67%, è il principale patogeno che causa la diarrea suina.
* La PoRVA rappresenta una minaccia significativa: con un tasso di positività del 33,80%, e il suo tasso di infezione ha superato quello della PEDV in sei province, tra cui Henan e Gansu,che richiede un attento monitoraggio della situazione epidemica.
• Variazioni stagionali e regionali significative: la PEDV è prevalente in primavera e in inverno, mentre la PoRVA aumenta nel quarto trimestre.I tassi di infezione da PEDV sono generalmente più elevati nelle province meridionali, mentre il PoRVA è più attivo nel centro e nel nord-ovest della Cina.
• Co-infezione diffusa: il tasso di co-infezione da PEDV e PoRVA raggiunge il 19,05%, aumentando significativamente la complessità clinica e la difficoltà di prevenzione e controllo.
• Rivela caratteristiche chiave di variazione antigenica: per la prima volta è stato chiarito il modello di variazione dell'epitopo neutralizzante della proteina PEDV S nel ceppo circolante attuale:gli epitopi SS2 e SS6 sono altamente conservati e sono obiettivi ideali per la progettazione di vaccini ad ampio spettro; mentre le regioni COE e 2C10 mostrano frequenti variazioni, suggerendo un rischio significativo di fuga dell'immunità virale e rendendole un obiettivo chiave per gli aggiornamenti dei vaccini.
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Tra il 2022 e il 2024, il team di ricerca ha raccolto 1343 campioni di diarrea (tessuto intestinale piccolo, contenuto intestinale e feci) da 84 allevamenti di suini in 20 province della Cina.Utilizzando la PCR quantitativa quadruplica in tempo reale, hanno analizzato sistematicamente lo stato di infezione di PEDV, PoRVA, TGEV e PDCoV, e sequenziato ed eseguito analisi evolutiva sul gene S di PEDV e sul gene VP7 di PoRVA.
Introduzione
La diarrea virale dei suini è una delle principali malattie infettive che affligge l'industria suina mondiale, colpendo principalmente i suinetti e causando grave diarrea, vomito e disidratazione.I tassi di mortalità nei suinetti di 3 giorni possono raggiungere il 70%-100%.
La diarrea virale suina è da tempo endemica nel mio paese e il suo modello epidemiologico ha continuato a cambiare negli ultimi anni.L'evoluzione molecolare continua di diversi virus (come il PEDV e il PoRVA) pone continuamente sfide alla precisa prevenzione e al controlloPertanto, systematically elucidating the epidemiological patterns and molecular characteristics of the current major diarrhea viruses is of urgent practical significance for updating prevention and control strategies and guiding vaccine development.
Risultati della ricerca
1Il PEDV rimane l'agente patogeno dominante che causa la diarrea suina, con infezioni miste che rappresentano un problema di primo piano.
Il team di ricerca ha condotto quattro test RT-qPCR su 1343 campioni. I risultati hanno mostrato un tasso di positività del PEDV fino al 50,90% (66,67% delle fattorie suine erano infette);il tasso di positività di PoRVA è stato di 33.80%. Al contrario, i tassi di rilevazione di TGEV (3,10%) e PDCoV (6,00%) erano inferiori. In particolare, il tasso di infezione misto di PEDV e PoRVA era alto fino al 19,05%,che indicano un aumento significativo della complessità nel controllo della diarrea suina.
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Figura 1. Statuto epidemiologico dei virus associati alla diarrea.
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Tabella 1. Epidemiologia dei virus legati alla diarrea suina nelle varie province della Cina.
2. Differenze regionali significative nell'epidemiologia tra il Nord e il Sud della Cina.
L'analisi della visualizzazione geografica mostra che, in questa indagine, la prevalenza del PEDV era significativamente più elevata nel sud della Cina (Guangdong, Guangxi e Yunnan), con tassi di positività superiori all'80%;Il PoRVA ha formato aree ad alta prevalenza nell'Henan, Xinjiang e Zhejiang, con tassi di positività superiori al 60%. Il PDCoV è stato rilevato principalmente nel Jiangxi e nell'Henan, seguito da Gansu e Liaoning; il TGEV è stato rilevato solo sporadicamente in quattro province,restando a un livello di prevalenza basso in generale.
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Figura 2. Visualizzazione geografica dello stato di infezione di quattro virus correlati alla diarrea in diverse regioni della Cina.
3L'inverno e la primavera sono le principali stagioni di picco per la diffusione dei virus della diarrea suina.
La sorveglianza trimestrale dal 2022 al 2024 ha mostrato che la PEDV è rilevabile tutto l'anno, ma i tassi di positività nel primo, secondo e quarto trimestre sono stati significativamente più elevati rispetto all'estate (terzo trimestre);Il PoRVA ha mostrato un chiaro picco stagionale, con il tasso di positività che sale al 57% ∼65% nel quarto trimestre di ogni anno. Il PDCoV non è stato rilevato nel 2022, ma il tasso di rilevazione è aumentato significativamente dal 2023 in poi;Il TGEV è stato rilevato nuovamente a partire dal quarto trimestre del 2023, suggerendo una potenziale tendenza di rinascita.
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Figura 3. Lo stato di infezione e le tendenze di quattro virus associati alla diarrea in diverse regioni della Cina dal 2022 al 2024.
4L'evoluzione del gene PEDV è dominata da GIIa e GIIc.
L'analisi di sequenziamento di 21 ceppi genici PEDV S ha mostrato che il GIIa rappresentava il 52,38%, il GIIc il 42,86% e il GIIb il 4,76%.L'analisi degli epitopi ha mostrato che gli epitopi neutralizzanti di SS2 e SS6 erano altamente conservati (solo una variazione di aminoacidi è stata trovata), fornendo potenziali bersagli per la progettazione del vaccino; tuttavia, 24 siti di mutazione degli amminoacidi sono comparsi nella regione COE e l' epitopo 2C10 ha mostrato frequenti variazioni,che può essere correlato alla fuga immunitaria virale.
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Figura 4. Albero filogenetico costruito sulla base del gene PEDV S.
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Figura 5. Confronto degli epitopi di aminoacidi della proteina PEDV S.
5I genotipi di PoRVA mostrano una significativa diversità.
L'analisi del gene VP7 di 16 ceppi di PoRVA ha identificato sei genotipi: G1, G3, G4, G5, G9 e G11.L' analisi dell' epitopo ha mostrato che, ad eccezione di G1, gli altri genotipi hanno mostrato variazioni significative nelle regioni degli antigeni A, B e C, mentre la regione E è stata relativamente conservata.In questo studio sono stati ulteriormente identificati tre peptidi brevi conservati (aa106, 159?? 170 e 251?? 259), tutte situate nella regione del ciclo proteico VP7, che hanno valore di ricerca come potenziali bersagli diagnostici e antigeni candidati al vaccino.
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Figura 6. Albero filogenetico di PoRVA costruito sulla base del gene VP7.
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Figura 7. Confronto degli epitopi di aminoacidi della proteina PoRVA VP7.
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Figura 8. Posizione del peptide PoRVA conservato nella struttura VP7 risolta.
Riassunto
Questo studio non solo ha aggiornato i dati epidemiologici di base del virus della diarrea suina (PEDV) in Cina,Ma ha anche rivelato le caratteristiche evoluzionistiche e i modelli di variazione antigenica di PEDV e PoRVA a livello molecolareI risultati indicano che l'attuale progettazione del vaccino dovrebbe concentrarsi sulle regioni ipervariabili del PEDV come COE e 2C10,e di esplorare il potenziale dei peptidi conservati di PoRVA come bersagli candidati di vaccini ad ampio spettroAllo stesso tempo, lo studio suggerisce di rafforzare gli sforzi di monitoraggio e controllo durante l'inverno e la primavera e nelle zone ad alta incidenza, e di attuare misure mirate di immunizzazione e biosicurezza.
Persona di contatto: Mr. Huang Jingtai
Telefono: 17743230916