bedrijfsnieuws over MDPI. Een nieuw H1N1 varkensgriepvirus ontdekt in Shandong Varkensvlees.

Op 15 januari 2026 heeft het team van professor Yu Zhijun van het College van Biologische Wetenschappen en Technologie, Jinan University,in samenwerking met het instituut voor pluimveeonderzoek van de Shandong Academy of Agricultural Sciences en de Shandong Normal University, publiceerde een onderzoeksartikel getiteld "Genetische karakterisatie en evolutionaire inzichten van nieuwe H1N1-varkensgriepvirussen die zijn geïdentificeerd bij varkens in de provincie Shandong,China" in het internationale tijdschrift virologie *Viruses* (MDPI).

In dit onderzoek werden in 2019 twee H1N1-virussen van varkensgriep (SD6591 en SD6592) gedetecteerd in varkensmonsters uit Linyi City en Shanghe County, Jinan City, provincie Shandong.en voltooide hun hele genoom sequentie en filogenetische analyseUit het onderzoek bleek dat de PA- en M2-genen van de SD6591-stam een hoge homologie vertoonden met het menselijke H1N1-virus.waaruit blijkt dat deze stam de kenmerken van het genetisch reassortment van het menselijk-varkensgriepvirus kan vertonenDe SD6592-stam was echter zeer homoloog met het varkensgriepvirus en vertoonde geen duidelijke kenmerken van cross-host gen reassortment.en zijn genetische kenmerken waren relatief behouden.

Dit onderzoek levert moleculair-epidemiologisch bewijsmateriaal om de evolutie van varkensgriepvirussen tussen soorten in de provincie Shandong te begrijpen,waarin het belang wordt benadrukt van een voortdurende versterking van de bewaking van varkensgriep en de beoordeling van zoönotische risico's.

Hoogtepunten van het onderzoek

* **Onthulling van een nieuw menselijk-varkens reassortant genotype:** Genomische analyse van de SD6591-stam toonde aan dat de PA- en M2-genen zeer homoloog zijn met menselijke seizoensgebonden H1N1-virussen,andere genen zijn voornamelijk afgeleid van varkensvirussen, wat aangeeft dat het om een nieuw mens-varkens reassortant virus gaat.

* ** Implicatie van een complex trans-species transmissienetwerk:** Phylogenetische analyse onthulde dat het M2-gen van SD6591 zich in dezelfde evolutionaire tak bevindt als h1n1-virussen bij honden,een mogelijke cyclus van meerdere gastheersoorten tussen varkens, honden en mensen, met de nadruk op de noodzaak om gezelschapsdieren in het bewakingssysteem op te nemen.

* ** Bevestiging van potentiële menselijke cel-infectiekracht:** In vitro experimenten met zeer homologe actieve stammen bevestigden dat het virus zich efficiënt kan repliceren in menselijke epitheelcellen van de long (A549), die rechtstreeks experimenteel bewijs levert van het mogelijke zoönotische risico.

• Een innovatieve functioneel validatiestrategie werd aangenomen: als reactie op de uitdaging om levende virussen niet te isoleren door het bewaren van monsters, werd een nieuwe methode ontwikkeld voor het opsporen van levende virussen.in het onderzoek zijn op innovatieve wijze bestaande stammen met een hoge genomische homologie (> 91%) gebruikt voor in vitro functionele substitutie validatie, die een haalbare oplossing biedt voor viruskenmerkenonderzoeken onder vergelijkbare omstandigheden.

Dit onderzoek voerde nucleïnezuuronderzoek uit op het H1N1-subtype varkensgriepvirus op 200 varkenslongweefselmonsters die in 2019 werden verzameld uit Liaocheng, Linyi, Jinan en Qingdao in de provincie Shandong.Twee positieve monsters (SD6591 en SD6592) werden gedetecteerd.De volledige virale genome sequentie werd verkregen door middel van high-throughput sequencing.en zijn genetische evolutionaire kenmerken werden systematisch geanalyseerd met behulp van homologievergelijking en filogenetische analyse. This study aims to provide basic data for molecular epidemiological surveillance of swine influenza virus in Shandong Province and to provide a scientific basis for assessing its cross-species transmission risk and formulating targeted prevention and control strategies.

Inleiding

Influenza A-virussen hebben een breed gastheergebied en infecteren meerdere soorten, waaronder mensen, vogels en varkens. Swine influenza virus (SIV) not only causes significant economic losses to the pig farming industry but also poses a persistent threat to public health due to the unique biological role of pigs as "mixing vessels" for influenza viruses, waardoor ze voortdurend nieuwe recombinante virussen kunnen genereren en zich over soorten heen kunnen verspreiden.

Onderzoeksresultaten

1. SD6591 vertoont unieke door de mens veroorzaakte genherstructureringskenmerken:

Het PA-gen van de stam SD6591 vertoont de hoogste homologie (96,99%) met het menselijke H1N1-virus van 2009.zijn gencluster is sterk gecorreleerd met menselijke seizoensgebonden H1N1-virussenZes gensegmenten, PB2, PB1, NP, NA, HA en NEP, zijn zeer homoloog met klassieke H1N1-virussen bij varkens.Dit patroon van "6+2" gencombinatie suggereert dat het virus een product kan zijn van een genherverdeling tussen menselijke en varkensgriepvirussen.. Het M2-gen toont opmerkelijk affiniteit voor zowel varkens- als hondenvirussen H1N1 (A/canine/Korea/MV1/2012) in de phylogenetische boom en clusters in dezelfde evolutionaire tak,waaruit blijkt dat dit gen mogelijk via overdracht tussen honden en varkens is binnengekomen in de varkenspopulatie.

Tabel 1. Stammen met de dichtstbijzijnde homologie van SD6591 voor elk gen.

2. SD6592 behoudt de genomische kenmerken van het klassieke varkensvirus H1N1:

In tegenstelling tot SD6591 delen alle acht gensegmenten van de SD6592-stam meer dan 98% homologie met het varkens-H1N1-virus en zijn ze het nauwst verwant aan het 2018 Beijing-isolaat A/varken/Beijing/0301/2018 (H1N1).Deze sterk bewaarde genomische eigenschap geeft aan dat deze stam een stabiele overdrachtsketen in de plaatselijke varkenspopulatie heeft opgebouwd en een aanhoudende ecologische niche bezet.

Tabel 2. Soorten met de hoogste homologie met SD6592.

3Bij de recombinatieanalyse is geen significant recombinatiesignaal vastgesteld:

SimPlot-analyse suggereerde chimerische eigenschappen in het PA-gen van SD6591 en de NA- en NP-genen van SD6592.met inbegrip van RDP, GENECONV en BootScan (met een gecorrigeerde p-waarde drempel < 0,05) vertoonden geen statistisch significant recombinatie-signaal.De bijbehorende sequentieverschillen zijn waarschijnlijker als gevolg van de geleidelijke accumulatie van puntmutaties of niet-geprobeerde vooroudersequenties., waaruit blijkt dat er op dit moment geen duidelijk bewijs is dat een recombinatie in deze afstamming heeft plaatsgevonden.

Figuur 1. Resultaten van de recombinatieanalyse van het SD6591 PA-gen.

Figuur 2. Resultaten van recombinatieanalyse van SD6592 NA en NP genen.

4. Zeer homologe substituties hebben de mogelijkheid tot celreplicatie met meerdere gastheercellen:

Het onderzoeksteam heeft in vitro functionele validatie uitgevoerd met behulp van een 2018-H1N1-isolaat (A/varkens/China/Qingdao/2018) met >91% genomische homologie met SD6591/SD6592.De resultaten van Western blot en qRT-PCR toonden aan dat het virus zich efficiënt in varkens (PK-15) kon vermenigvuldigen., honden (MDCK) en menselijke (A549) epitheelcellen, met een replicatie-kinetiek die vergelijkbaar is met de controlestam PR8.Deze resultaten suggereren op celniveau dat dit type varkensgriepvirus het potentieel heeft om cellen van meerdere gastheerbronnen te infecteren..

Tabel 3. Nucleotide-identiteit (%) tussen het SD6591-genfragment en twee referentiestammen van H1N1.

Tabel 4. Nucleotide-identiteit (%) tussen het SD6592-genfragment en twee referentiestammen van H1N1.

Figuur 3. Replicatie kinetiek van 2018-H1N1- en PR8-virussen in verschillende cellijnen.

5De evolutionaire kenmerken van het M2-gen suggereren aandacht voor plaatsen die verband houden met resistentie tegen geneesmiddelen:

Het M2-gen van SD6591 vertoont de hoogste homologie (97.93%) met het pandemievirus H1N1 van 2009 en clusters in dezelfde evolutionaire tak als het hondenvirus H1N1 (A/hondenvirus/Korea/MV1/2012) in de filogenetische analyseEerdere studies hebben aangetoond dat menselijke influenzavirussen in deze evolutionaire tak vaak belangrijke mutatiesites dragen die geassocieerd zijn met amantadine-resistentie (zoals S31N).Deze genetische achtergrond suggereert dat aandacht moet worden besteed aan de mogelijke moleculaire kenmerken van de SD6591-stam die verband houden met resistentie tegen geneesmiddelen., en verdere experimentele verificatie van de belangrijkste plaatsen en functies van het M2-eiwit is noodzakelijk.

Samenvatting

In dit onderzoek is de gehele genoomanalyse van twee H1N1-virussen van de varkensgriep uit de provincie Shandong afgerond.We hebben hun sequentie kenmerken gecorreleerd met hun in vitro replicatie fenotype, confirming that the H1N1 swine influenza virus circulating in pig populations still possesses the potential for cross-species multi-host cell infection even in the absence of detectable significant gene recombination events. This finding underscores the crucial importance of strengthening swine influenza virus genome surveillance and validating the phenotypic characteristics of representative strains for timely detection of potential adaptive mutations and early warning of novel influenza outbreaks.