hakkında şirket haberleri MDPI | Shandong Domuz Sürüsünde Yeni H1N1 Domuz Gribi Virüsü Keşfedildi: Türler Arası Bulaşma Riski Analizi ve

15 Ocak 2026'da Jinan Üniversitesi Biyolojik Bilim ve Teknoloji Fakültesi'nden Profesör Yu Zhijun'un ekibi, Shandong Tarım Bilimleri Akademisi Kanatlı Araştırma Enstitüsü ve Shandong Normal Üniversitesi ile işbirliği içinde, "Çin'in Shandong Eyaleti'ndeki Domuzlardan Tespit Edilen Yeni H1N1 Domuz Gribi Virüslerinin Genetik Karakterizasyonu ve Evrimsel İçgörüleri" başlıklı bir araştırma makalesini uluslararası viroloji dergisi *Viruses* (MDPI)'de yayınladı.

Bu çalışma, 2019 yılında Shandong Eyaleti, Linyi Şehri ve Jinan Şehri, Shanghe İlçesi'ndeki domuz örneklerinde iki H1N1 domuz gribi virüsü (SD6591 ve SD6592) tespit etti ve tam genom dizileme ve filogenetik analizlerini tamamladı. Çalışma, SD6591 suşunun PA ve M2 genlerinin insan H1N1 virüsü ile yüksek homoloji gösterdiğini, bu suşun insan-domuz gribi virüsü gen yeniden düzenlenmesi özelliklerini sergileyebileceğini düşündürdüğünü buldu. Bununla birlikte, SD6592 suşu domuz gribi virüsü ile yüksek homoloji gösterdi, belirgin bir konaklar arası gen yeniden düzenlenmesi özelliği göstermedi ve genetik özellikleri nispeten korunmuştu.

Bu çalışma, Shandong Eyaleti'ndeki domuz gribi virüslerinin türler arası evrimini anlamak için moleküler epidemiyolojik kanıtlar sunmakta, domuz gribi gözetiminin ve zoonotik risk değerlendirmesinin sürekli güçlendirilmesinin önemini vurgulamaktadır.

Araştırma Öne Çıkanları

* **Yeni Bir İnsan-Domuz Yeniden Düzenlenmiş Genotipinin Ortaya Çıkarılması:** SD6591 suşunun genomik analizi, PA ve M2 genlerinin insan mevsimsel H1N1 virüsleriyle yüksek homoloji gösterdiğini, diğer genlerin ise çoğunlukla domuz virüslerinden türediğini gösterdi, bu da onun yeni bir insan-domuz yeniden düzenlenmiş virüsü olduğunu gösteriyor.

* **Karmaşık Bir Türler Arası Bulaşma Ağının İmplikasyonu:** Filogenetik analiz, SD6591'in M2 geninin köpek H1N1 virüsleriyle aynı evrimsel dalda kümelendiğini ortaya koydu, bu da domuzlar, köpekler ve insanlar arasında olası çoklu konak döngüsünü düşündürüyor ve evcil hayvanların gözetim sistemine dahil edilmesinin gerekliliğini vurguluyor.

* **Potansiyel İnsan Hücresi Enfeksiyon Yeteneğinin Doğrulanması:** Yüksek homolojiye sahip aktif suşlarla yapılan in vitro deneyler, virüsün insan akciğer epitel hücrelerinde (A549) verimli bir şekilde çoğalabildiğini doğruladı, bu da potansiyel zoonotik riski için doğrudan deneysel kanıt sağlıyor.

• Yenilikçi bir fonksiyonel doğrulama stratejisi benimsendi: Örnek koruma nedeniyle canlı virüslerin izole edilememesi zorluğuna yanıt olarak, çalışma benzer koşullar altında virüs karakteristiği çalışmaları için uygulanabilir bir çözüm sunarak, in vitro fonksiyonel ikame doğrulaması için yenilikçi bir şekilde yüksek genomik homolojiye (>%91) sahip mevcut suşları kullandı.

Bu çalışma, 2019 yılında Shandong Eyaleti, Liaocheng, Linyi, Jinan ve Qingdao'dan toplanan 200 domuz akciğer dokusu örneğinde H1N1 alt tipi domuz gribi virüsü için nükleik asit testi yaptı. İki pozitif örnek (SD6591 ve SD6592) tespit edildi. Yüksek verimli dizileme yoluyla tam viral genom dizisi elde edildi ve genetik evrimsel özellikleri homoloji karşılaştırması ve filogenetik analiz kullanılarak sistematik olarak analiz edildi. Bu çalışma, Shandong Eyaleti'ndeki domuz gribi virüsünün moleküler epidemiyolojik gözetimi için temel veriler sağlamayı ve türler arası bulaşma riskini değerlendirmek ve hedeflenen önleme ve kontrol stratejileri formüle etmek için bilimsel bir temel sağlamayı amaçlamaktadır.

Giriş

İnfluenza A virüsleri, insanlar, kuşlar ve domuzlar dahil olmak üzere birçok türü enfekte eden geniş bir konak aralığına sahiptir. Domuz gribi virüsü (SIV), sadece domuz çiftçiliği endüstrisi için önemli ekonomik kayıplara neden olmakla kalmaz, aynı zamanda domuzların influenza virüsleri için "karışım kapları" olarak benzersiz biyolojik rolü nedeniyle halk sağlığı için sürekli bir tehdit oluşturur, bu da onların sürekli olarak yeni rekombinant virüsler üretmelerine ve türler arasında yayılmalarına olanak tanır.

Araştırma Sonuçları

1. SD6591, benzersiz insan kaynaklı gen yeniden düzenlenmesi özelliklerini sergiliyor:

SD6591 suşunun PA geni, 2009 H1N1 insan virüsü ile en yüksek homolojiye (%96.99) sahiptir. M2 geni ise Liaoning H1N1 domuz kaynaklı suş ile en yüksek homolojiye (%98.96) sahipken, gen kümesi insan mevsimsel H1N1 virüsleriyle yüksek korelasyon göstermektedir. Altı gen segmenti, PB2, PB1, NP, NA, HA ve NEP, klasik domuz H1N1 virüsleriyle yüksek homolojiye sahiptir. Bu "6+2" gen kombinasyon deseni, virüsün insan ve domuz gribi virüsleri arasındaki gen yeniden düzenlenmesinin bir ürünü olabileceğini düşündürmektedir. Özellikle, M2 geni, filogenetik ağaçta hem domuz hem de köpek H1N1 virüslerine (A/canine/Korea/MV1/2012) ilgi göstermekte ve aynı evrimsel dalda kümelenmektedir, bu da bu genin köpek-domuz türler arası bulaşma yoluyla domuz popülasyonuna girmiş olabileceğini düşündürmektedir.

Tablo 1. Her gen için SD6591 ile en yakın homolojiye sahip suşlar.

2. SD6592, klasik domuz H1N1 virüsünün genomik özelliklerini koruyor:

SD6591'den farklı olarak, SD6592 suşunun sekiz gen segmentinin tamamı, domuz H1N1 virüsü ile %98'den fazla homolojiye sahiptir ve 2018 Pekin izolatı A/swine/Beijing/0301/2018 (H1N1) ile en yakından ilişkilidir. Bu yüksek derecede korunmuş genomik özellik, bu suşun yerel domuz popülasyonunda kararlı bir bulaşma zinciri oluşturduğunu ve kalıcı bir ekolojik niş işgal ettiğini göstermektedir.

Tablo 2. SD6592 ile en yüksek homolojiye sahip suşlar.

3. Rekombinasyon analizinde önemli bir rekombinasyon sinyali tespit edilmedi:

SimPlot analizi, SD6591'in PA geninde ve SD6592'nin NA ve NP genlerinde kimerik benzeri özellikler öne sürdü. Ancak, RDP, GENECONV ve BootScan (düzeltilmiş p-değeri eşiği <0.05 ile) dahil olmak üzere RDP5 yazılım paketindeki birden fazla algoritma kullanılarak yapılan daha fazla doğrulama, istatistiksel olarak anlamlı bir rekombinasyon sinyali göstermedi. İlgili dizi farklılıklarının, nokta mutasyonların veya örneklenmemiş atadan gelen dizilerin kademeli birikiminden kaynaklanması daha olasıdır, bu da bu soyda yakın zamanda bir rekombinasyon olayının varlığını destekleyecek açık bir kanıt olmadığını göstermektedir.Şekil 1. SD6591 PA geni rekombinasyon analizi sonuçları.

Şekil 2. SD6592 NA ve NP genlerinin rekombinasyon analizi sonuçları.

4. Yüksek Homolog İkame Maddeleri Çoklu Konak Hücresi Çoğalma Yeteneğine Sahiptir:

Araştırma ekibi, SD6591/SD6592 ile >%91 genomik homolojiye sahip bir 2018-H1N1 izolatı (A/swine/China/Qingdao/2018) kullanarak in vitro fonksiyonel doğrulama yaptı. Western blot ve qRT-PCR sonuçları, virüsün domuz (PK-15), köpek (MDCK) ve insan (A549) epitel hücrelerinde, kontrol suşu PR8'e benzer çoğalma kinetiği ile verimli bir şekilde çoğalabildiğini gösterdi. Bu sonuçlar, hücresel düzeyde, bu tür domuz gribi virüsünün birden fazla konak kaynağından gelen hücreleri enfekte etme potansiyeline sahip olduğunu düşündürmektedir.

Tablo 3. SD6591 gen parçası ile iki referans H1N1 suşu arasındaki nükleotid kimliği (%).

Tablo 4. SD6592 gen parçası ile iki referans H1N1 suşu arasındaki nükleotid kimliği (%).

Şekil 3. Farklı hücre hatlarında 2018-H1N1 ve PR8 virüslerinin çoğalma kinetiği.

5. M2 geninin evrimsel özellikleri, ilaç direnciyle ilgili bölgelere dikkat çekiyor:

SD6591'in M2 geni, 2009 pandemik H1N1 virüsü ile en yüksek homolojiye (%97.93) sahiptir ve filogenetik analizde köpek H1N1 virüsü (A/canine/Korea/MV1/2012) ile aynı evrimsel dalda kümelenmektedir. Önceki çalışmalar, bu evrimsel daldaki insan gribi virüslerinin yaygın olarak amantadin direncine (örneğin S31N) bağlı anahtar mutasyon bölgelerini taşıdığını göstermiştir. Bu genetik arka plan, SD6591 suşunun potansiyel ilaç direnciyle ilgili moleküler özelliklerine dikkat etme ihtiyacını düşündürmektedir ve M2 proteininin anahtar bölgelerinin ve fonksiyonlarının daha fazla deneysel doğrulanması gereklidir.

Özet

Bu çalışma, Shandong Eyaleti'nden iki H1N1 domuz gribi virüsünün tam genom analizini tamamladı. Yenilikçi bir "homolog virüs fonksiyonel ikame" stratejisi kullanarak, dizi özelliklerini in vitro çoğalma fenotipleriyle ilişkilendirdik ve domuz popülasyonlarında dolaşan H1N1 domuz gribi virüsünün, tespit edilebilir önemli gen rekombinasyon olayları olmasa bile, türler arası çoklu konak hücresi enfeksiyon potansiyeline sahip olduğunu doğruladık. Bu bulgu, domuz gribi virüsü genom gözetimini güçlendirmenin ve potansiyel adaptif mutasyonların zamanında tespiti ve yeni gribi salgınlarının erken uyarısı için temsili suşların fenotipik özelliklerini doğrulamanın kritik önemini vurgulamaktadır.