Le blog À propos Lexogen lance un kit de séquençage à haut débit pour une préparation de librairie plus rapide

Dans le monde trépidant de la recherche en sciences de la vie, où la précision expérimentale détermine directement le succès, l'optimisation des cycles de PCR a longtemps représenté un défi critique pour les chercheurs. La fiabilité des données de séquençage à haut débit - la pierre angulaire de la recherche biologique moderne - dépend fondamentalement de la qualité de la préparation de la librairie, l'amplification par PCR en étant l'étape pivot.

Les chercheurs sont fréquemment confrontés à un dilemme persistant lors de la détermination des cycles de PCR optimaux. Un sous-cyclage entraîne des rendements de librairie insuffisants, particulièrement problématique avec des échantillons limités ou des cibles de faible abondance, pouvant entraîner une perte de données critique. Inversement, un sur-cyclage introduit des produits non spécifiques et des artefacts qui faussent les profils d'expression génique, pouvant conduire à des conclusions erronées.

Cet équilibre délicat entre l'efficacité d'amplification et la fidélité a traditionnellement nécessité des approches d'essais et d'erreurs approfondies, consommant un temps et des ressources précieux tout en fournissant des résultats incohérents.

Pour relever ces défis à l'échelle de l'industrie, Lexogen présente son produit révolutionnaireKit d'ajout et de réamplification de PCR V2, conçu pour apporter une précision sans précédent à la préparation de librairies d'ADNc pour les systèmes QuantSeq V2, QuantSeq-Pool et CORALL V2.

La capacité de détection qPCR révolutionnaire du kit, utilisant le colorant SYBR Green I, permet une surveillance en temps réel de la cinétique d'amplification. Cela permet aux chercheurs de :

• Déterminer les nombres de cycles de PCR de point final avec une précision scientifique
• Éliminer les conjectures et les estimations empiriques
• Prévenir les artefacts de sous-amplification et de sur-amplification

Le mélange de PCR optimisé comprend une polymérase de haute fidélité et des amorces compatibles Illumina (sans codes-barres), prenant en charge jusqu'à 96 réactions qPCR par kit. Notamment, cette fonction qPCR est spécifiquement conçue pour les produits Lexogen de génération actuelle et n'est pas recommandée pour les versions antérieures de QuantSeq ou CORALL.

Au-delà de l'optimisation des cycles, le kit comprend un système spécialisé d'amorces de réamplification (RE) qui :

• Augmente les rendements de librairie lorsque l'amplification initiale s'avère insuffisante
• Améliore la détection des transcrits de faible abondance
• Prend en charge les applications de panels d'enrichissement

Cette fonction de réamplification maintient la compatibilité sur toute la gamme de produits Lexogen, y compris toutes les versions de CORALL et QuantSeq, les préparations LUTHOR et les librairies de petit ARN-Seq.

Le kit à double fonction fournit :

• 96 réactions qPCRpour l'optimisation des cycles
• 96 réactions de réamplificationpour l'amélioration du rendement

La compatibilité comprend :

• CORALL RNA-Seq V2 avec UDI (Cat. 171-186)
• QuantSeq V2 avec UDI (Cat. 191-196)
• QuantSeq-Pool (Cat. 139)

Le kit est spécifiquement incompatible avec les produits TeloPrime (Cat. 013).

Le kit V2 de Lexogen représente un bond en avant significatif dans la technologie de préparation de librairies, offrant aux chercheurs :

• Détermination des cycles de PCR basée sur les données
• Options flexibles d'amélioration du rendement
• Compatibilité de flux de travail rationalisée
• Préparation pour la plateforme Illumina

En éliminant les défis traditionnels d'optimisation de la PCR, cette innovation permet aux scientifiques de se concentrer sur la découverte biologique plutôt que sur l'optimisation technique, accélérant potentiellement les percées dans l'analyse de l'expression génique et la recherche en transcriptomique.