وبلاگ در باره لکسوجن کیت توالی با سرعت بالا را برای آماده سازی سریع کتابخانه عرضه می کند

در دنیای پرشتاب تحقیقات علوم زیستی، جایی که دقت تجربی مستقیماً موفقیت را تعیین می‌کند، بهینه‌سازی چرخه PCR مدت‌هاست که چالشی حیاتی برای محققان بوده است. قابلیت اطمینان داده‌های توالی‌یابی با توان عملیاتی بالا - سنگ بنای تحقیقات بیولوژیکی مدرن - اساساً به کیفیت آماده‌سازی کتابخانه بستگی دارد، که تقویت PCR گام محوری آن است.

محققان اغلب هنگام تعیین چرخه‌های بهینه PCR با یک دوراهی مداوم روبرو هستند. کمبود چرخه منجر به بازده ناکافی کتابخانه می‌شود، به خصوص با نمونه‌های محدود یا اهداف با فراوانی کم مشکل‌ساز است و به طور بالقوه باعث از دست رفتن داده‌های حیاتی می‌شود. برعکس، چرخه بیش از حد، محصولات غیر اختصاصی و مصنوعاتی را معرفی می‌کند که پروفایل‌های بیان ژن را تحریف می‌کنند و به طور بالقوه منجر به نتایج نادرست می‌شوند.

این تعادل ظریف بین کارایی تقویت و وفاداری به طور سنتی نیازمند رویکردهای آزمون و خطا گسترده‌ای بوده است که زمان و منابع ارزشمند را مصرف می‌کند و در عین حال نتایج ناسازگار ارائه می‌دهد.

لکسوژن با پرداختن به این چالش‌های صنعتی، محصول پیشگام خود را معرفی می‌کند: کیت افزودنی PCR و تقویت مجدد V2 ، که برای ایجاد دقت بی‌سابقه در آماده‌سازی کتابخانه cDNA برای سیستم‌های QuantSeq V2، QuantSeq-Pool و CORALL V2 طراحی شده است.

قابلیت تشخیص qPCR انقلابی این کیت، با استفاده از رنگ SYBR Green I، امکان نظارت بلادرنگ بر سینتیک تقویت را فراهم می‌کند. این به محققان اجازه می‌دهد تا:

• تعداد چرخه‌های PCR نقطه پایانی را با دقت علمی تعیین کنند
• حدس و گمان و تخمین‌های تجربی را حذف کنند
• از مصنوعات کم‌تقویت و بیش‌تقویت جلوگیری کنند

مخلوط PCR بهینه‌شده شامل پلیمراز با وفاداری بالا و پرایمرهای سازگار با Illumina (بدون بارکد) است که از حداکثر 96 واکنش qPCR در هر کیت پشتیبانی می‌کند. قابل ذکر است که این عملکرد qPCR به طور خاص برای محصولات نسل فعلی لکسوژن طراحی شده است و برای نسخه‌های قبلی QuantSeq یا CORALL توصیه نمی‌شود.

فراتر از بهینه‌سازی چرخه، این کیت دارای یک سیستم پرایمر تقویت مجدد (RE) تخصصی است که:

• بازده کتابخانه را در صورت ناکافی بودن تقویت اولیه افزایش می‌دهد
• تشخیص رونوشت‌های با فراوانی کم را بهبود می‌بخشد
• از برنامه‌های پنل غنی‌سازی پشتیبانی می‌کند

این عملکرد تقویت مجدد سازگاری را در کل خط تولید لکسوژن، از جمله تمام نسخه‌های CORALL و QuantSeq، آماده‌سازی‌های LUTHOR و کتابخانه‌های کوچک RNA-Seq حفظ می‌کند.

کیت دوگانه عملکردی ارائه می‌دهد:

• 96 واکنش qPCR برای بهینه‌سازی چرخه
• 96 واکنش تقویت مجدد برای افزایش بازده

سازگاری شامل موارد زیر است:

• CORALL RNA-Seq V2 با UDI (Cat. 171-186)
• QuantSeq V2 با UDI (Cat. 191-196)
• QuantSeq-Pool (Cat. 139)

این کیت به طور خاص با محصولات TeloPrime (Cat. 013) ناسازگار است.

کیت V2 لکسوژن گامی قابل توجه در فناوری آماده‌سازی کتابخانه است که به محققان ارائه می‌دهد:

• تعیین چرخه PCR مبتنی بر داده
• گزینه‌های انعطاف‌پذیر برای افزایش بازده
• سازگاری گردش کار ساده شده
• آمادگی برای پلتفرم Illumina

با حذف چالش‌های سنتی بهینه‌سازی PCR، این نوآوری به دانشمندان اجازه می‌دهد تا به جای بهینه‌سازی فنی، بر کشف بیولوژیکی تمرکز کنند و به طور بالقوه پیشرفت‌هایی را در تجزیه و تحلیل بیان ژن و تحقیقات ترانسکریپتومیکس تسریع کنند.