Blog về Lexogen ra mắt bộ thứ tự công suất cao để chuẩn bị thư viện nhanh hơn

Trong thế giới nghiên cứu khoa học đời sống với nhịp độ nhanh, nơi độ chính xác của thí nghiệm quyết định trực tiếp đến thành công, việc tối ưu hóa chu kỳ PCR từ lâu đã là một thách thức quan trọng đối với các nhà nghiên cứu. Độ tin cậy của dữ liệu giải trình tự thông lượng cao - nền tảng của nghiên cứu sinh học hiện đại - về cơ bản phụ thuộc vào chất lượng chuẩn bị thư viện, với khuếch đại PCR đóng vai trò là bước then chốt.

Các nhà nghiên cứu thường xuyên đối mặt với một tình thế tiến thoái lưỡng nan dai dẳng khi xác định chu kỳ PCR tối ưu. Khuếch đại dưới mức dẫn đến năng suất thư viện không đủ, đặc biệt có vấn đề với các mẫu hạn chế hoặc các mục tiêu có số lượng thấp, có khả năng gây mất dữ liệu quan trọng. Ngược lại, khuếch đại quá mức lại tạo ra các sản phẩm không đặc hiệu và các sản phẩm giả làm sai lệch hồ sơ biểu hiện gen, có khả năng dẫn đến kết luận sai lầm.

Sự cân bằng tinh tế giữa hiệu quả khuếch đại và độ trung thực này theo truyền thống đòi hỏi các phương pháp thử và sai tốn nhiều công sức, tiêu tốn thời gian và nguồn lực quý báu trong khi mang lại kết quả không nhất quán.

Để giải quyết những thách thức trên toàn ngành, Lexogen giới thiệu bộ kit đột phá của mình PCR Add-on và Reamplification Kit V2 , được thiết kế để mang lại độ chính xác chưa từng có cho việc chuẩn bị thư viện cDNA cho các hệ thống QuantSeq V2, QuantSeq-Pool và CORALL V2.

Khả năng phát hiện qPCR mang tính cách mạng của bộ kit, sử dụng thuốc nhuộm SYBR Green I, cho phép theo dõi động học khuếch đại theo thời gian thực. Điều này cho phép các nhà nghiên cứu:

• Xác định số chu kỳ PCR cuối cùng với độ chính xác khoa học
• Loại bỏ phỏng đoán và ước tính kinh nghiệm
• Ngăn ngừa cả hiện tượng khuếch đại dưới mức và khuếch đại quá mức

Hỗn hợp PCR tối ưu hóa bao gồm polymerase có độ trung thực cao và các mồi tương thích với Illumina (không có mã vạch), hỗ trợ tới 96 phản ứng qPCR mỗi bộ kit. Đáng chú ý, chức năng qPCR này được thiết kế đặc biệt cho các sản phẩm Lexogen thế hệ hiện tại và không được khuyến nghị cho các phiên bản QuantSeq hoặc CORALL cũ hơn.

Ngoài việc tối ưu hóa chu kỳ, bộ kit còn có hệ thống mồi khuếch đại lại (RE) chuyên dụng:

• Tăng năng suất thư viện khi khuếch đại ban đầu không đủ
• Tăng cường phát hiện các bản phiên có số lượng thấp
• Hỗ trợ các ứng dụng bảng làm giàu

Chức năng khuếch đại lại này duy trì khả năng tương thích trên toàn bộ dòng sản phẩm của Lexogen, bao gồm tất cả các phiên bản CORALL và QuantSeq, các chế phẩm LUTHOR và các thư viện small RNA-Seq.

Bộ kit hai chức năng cung cấp:

• 96 phản ứng qPCR để tối ưu hóa chu kỳ
• 96 phản ứng khuếch đại lại để tăng năng suất

Khả năng tương thích bao gồm:

• CORALL RNA-Seq V2 với UDI (Cat. 171-186)
• QuantSeq V2 với UDI (Cat. 191-196)
• QuantSeq-Pool (Cat. 139)

Bộ kit này không tương thích với các sản phẩm TeloPrime (Cat. 013).

Bộ kit V2 của Lexogen đại diện cho một bước tiến đáng kể trong công nghệ chuẩn bị thư viện, mang đến cho các nhà nghiên cứu:

• Xác định chu kỳ PCR dựa trên dữ liệu
• Các tùy chọn tăng năng suất linh hoạt
• Quy trình làm việc được sắp xếp hợp lý
• Sẵn sàng cho nền tảng Illumina

Bằng cách loại bỏ các thách thức tối ưu hóa PCR truyền thống, sự đổi mới này cho phép các nhà khoa học tập trung vào khám phá sinh học thay vì tối ưu hóa kỹ thuật, có khả năng đẩy nhanh các đột phá trong phân tích biểu hiện gen và nghiên cứu transcriptomics.