Le 27 septembre 2025, a research team from the College of Veterinary Medicine at South China Agricultural University published a new study on the molecular epidemiology and evolutionary dynamics of porcine reproductive and respiratory syndrome virus type II (PRRSV-2) in the journal *Transboundary and Emerging Diseases*.
Basée sur 328 échantillons cliniques de 27 provinces en Chine en 2024-2025, cette étude est la première à révéler systématiquement la distribution actuelle de la lignée, les modèles de transmission,variation antigénique, et les points chauds de recombinaison du PRRSV-2 en Chine, fournissant des preuves scientifiques importantes pour l'optimisation des vaccins et la prévention et le contrôle des épidémies.
Points marquants de la recherche
* L'étude est la première à révéler systématiquement la coexistence de cinq lignées PRRSV-2 majeures en Chine en 2024-2025, y compris les lignées 1.5, 1.8, 3, 5 et 8.7, avec la lignée 1.8 (similaire à la NADC30) devenant la souche circulante dominante (représentant 48,5% des échantillons positifs).
• Le Guangdong (noyau sud) et le Henan (centre central) sont les "origines de propagation" des deux lignées dominantes, 1.8 et 1.5Le virus s'est propagé de ces deux régions vers les provinces environnantes au nord et au sud, le Hubei, le Shanxi et le Jiangsu devenant de nouveaux clusters.
• La région ORF2-ORF3 a été identifiée comme un point chaud de recombinaison, avec des recombinaisons fréquentes entre les souches de vaccins et les souches de type sauvage.
• Sur la base de l' analyse de la distance génétique de la SDM, la souche vaccinale actuelle présente des différences antigéniques significatives par rapport aux principales lignées circulantes (1.8 et 3),suggérant une diminution potentielle de l' efficacité protectrice du vaccin.
• La lignée 5 a connu une augmentation de 106,6% de la diversité des nucléotides en un an, ce qui indique un taux d'évolution significativement accéléré.
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Des études montrent que cinq lignées principales de PRRSV-II circulent simultanément dans les champs chinois en 2024-2025, la lignée 1.8 (similaire à la NADC30) représentant près de la moitié,présentant des différences antigéniques significatives par rapport aux souches de vaccinsLe virus a formé une plaque tournante de transmission nord-sud dans les provinces du Guangdong et du Henan, avec une recombinaison à haute fréquence dans les régions ORF2-ORF3.La lignée 5 a montré un doublement de la diversité génétique en un an, indiquant de nouveaux défis pour l' efficacité protectrice des vaccins actuels.
Introduction au projet
Le PRRSV, l'un des virus les plus destructeurs de l'industrie porcine mondiale, est répandu en Chine depuis près de 30 ans.avec la reconstruction accélérée de l'industrie après la peste porcine africaine, les problèmes de diversification de la lignée du VRSP, de transmission interrégionale et de recombinaison liée au vaccin sont devenus de plus en plus importants.Les études systématiques ciblant cette phase critique de 2024-2025 demeurent insuffisantes.
Résultats de la recherche
1Cinq lignées coexistent, la lignée 1.8 étant dominante:
L'étude a classé le PRRSV-2 actuellement en circulation en cinq lignées: 1.5 (NADC34-like), 1.8 (NADC30-like), 3, 5 et 8.7La lignée 1.8 représentait 48,5% des échantillons positifs, ce qui en fait la souche absolument dominante et la plus largement répandue; la lignée 1.5 représentait 23,2%, juste derrière 1.8 en termes de prévalenceLes lignées 3, 5 et 8.7 présentent une répartition régionalement limitée.
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Figure 1. Prélèvement d'échantillons et analyse phylogénétique
a) La taille des cercles dans chaque province représente le nombre d'échantillons et les différentes couleurs représentent les différentes lignées.b) Arbre phylogénétique de type II du virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin chinois (PRRSV) selon la probabilité maximale (ML)Les cercles rouges représentent les séquences obtenues dans cette étude, et les astérisques bleus représentent les séquences génomiques entières obtenues.
2Le Guangdong et le Henan comme "centres d'échange de virus":
L'analyse de la dynamique de transmission spatio-temporelle identifie clairement le Guangdong et le Henan comme des "centres d'échange de virus" pour le PRRSV de type II, servant de nœuds de transmission clés reliant le nord et le sud.La souche dominante, lignée 1.8, s'est d'abord propagé largement dans ces deux régions et a ensuite continué à se propager dans les provinces voisines telles que le Hunan, le Hubei, le Jiangsu et le Shaanxi; lignée 1.5, centrée dans le Henan, s'est propagée aux provinces centrales et septentrionales comme le Shanxi, le Hebei et le Zhejiang.Ces deux régions ont formé un réseau de transmission regroupé couvrant le nord et le sud, en favorisant davantage l'échange et la diffusion génétiques entre les différentes lignées.Leur rôle essentiel a également été validé à la fois par la proportion d'échantillons (se classant parmi les cinq premiers) et le traçage du parcours de transmission..
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Figure 2. Analyse de la transmission
(a1, b1, c1, d1): Arbre phylogénétique construit à l'aide du logiciel Nextstrain avec une estimation de probabilité maximale basée sur ORF5. Différentes régions des branches sont marquées de couleurs différentes. (a2, b2,c2, d2): Reconstruction phylogénétique du PRRSV ORF5. La taille du cercle représente le nombre d'échantillons et la couleur correspond au nœud ancestral.
3Différences antigéniques significatives, mettant en cause l'efficacité du vaccin:
L'analyse de mise à l'échelle multidimensionnelle a révélé que la souche dominante était de 1,8 (48.5%) et la souche 3 (haute diversité antigénique) dans les lignées actuelles prévalentes de PRRSV sont significativement séparées des souches de vaccins couramment utilisées telles que JXA1.En revanche, les lignées 5 et 8.7 présentent une grande similitude antigénique avec les souches de vaccins.Cette divergence antigénique suggère que les vaccins existants peuvent ne pas offrir une protection complète contre les deux lignées prédominantes.Cette conclusion doit être vérifiée par des essais sérologiques ultérieurs.
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Figure 3. Analyse en grappes du MDS des souches de vaccins, des souches prototypes et des échantillons de terrain.
4L' évolution accélérée et une augmentation de la diversité génétique dans la lignée 5:
La lignée 5 du PRRSV de type II présente des caractéristiques évolutionnaires significatives, avec une augmentation de 106,6% de la diversité nucléotidique en un an, ce qui indique une augmentation rapide de la diversité génétique.Son test D de Tajima montre une valeur significativement négative., ce qui suggère que cette lignée peut subir une expansion rapide de la population ou une sélection directionnelle, avec un taux d'évolution significativement accéléré.Une surveillance étroite de son statut épidémique et des tendances de variation est nécessaire..
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Figure 4. Analyse de la recombinaison
a) Analyse de recombinaison de la souche R24121302heyuan241213. Les différentes couleurs représentent différentes souches; un astérisque rouge indique R24121302heyuan241213.
b) Analyse de recombinaison de la souche P24110708wuhan241107. Les différentes couleurs représentent différentes souches; un astérisque rouge indique P24110708wuhan241107.
(c) Analyse de recombinaison de la souche P25012805heyuan250128. Les différentes couleurs représentent différentes souches; un astérisque rouge indique P25012805heyuan250128.
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Figure 5. Analyse de la diversité génétique du gène ORF5 du virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin de type II dans cinq lignées majeures en Chine (2024-2025).
a) Analyse de la diversité des haplotypes (Hd) des lignées 1.5, 1.8, 3, 5 et 8.7. b) Analyse de la diversité des nucléotides (Pi). c) Résultats de l'essai D de Tajima; le nombre de puits et les astérisques indiquent une signification statistique (p < 0,05).
Résumé
Cette étude comble une lacune dans les données épidémiologiques relatives au PRRSV de type II en Chine en 2024-2025.et révèle pour la première fois systématiquement les caractéristiques de recombinaison et les modèles de variation antigénique des souches dominantesL'étude confirme que le PRRSV de type II est entré dans une nouvelle phase de " variation basée sur la recombinaison ", ce qui pose un sérieux défi au système de contrôle du vaccin traditionnel basé sur une seule souche.
The research findings not only provide a scientific basis for developing targeted surveillance programs but also point the way for the development of novel broad-spectrum vaccines—future vaccines should focus on covering key antigenic epitopes of L1C sublineage recombinant strains, tout en renforçant la conception de séquences pour les régions de points chauds de recombinaison.les méthodes de classification de la lignée et de surveillance des variations établies dans cette étude peuvent fournir un paradigme de référence pour la recherche épidémiologique mondiale sur le PRRSV.
Personne à contacter: Mr. Huang Jingtai
Téléphone: 17743230916