Pada tanggal 27 September 2025, a research team from the College of Veterinary Medicine at South China Agricultural University published a new study on the molecular epidemiology and evolutionary dynamics of porcine reproductive and respiratory syndrome virus type II (PRRSV-2) in the journal *Transboundary and Emerging Diseases*.
Berdasarkan 328 sampel klinis dari 27 provinsi di seluruh China pada tahun 2024-2025, penelitian ini adalah yang pertama secara sistematis mengungkapkan distribusi garis keturunan saat ini, pola transmisi,Variasi antigenik, dan titik panas rekombinasi PRRSV-2 di Cina, memberikan bukti ilmiah penting untuk optimalisasi vaksin dan pencegahan dan pengendalian epidemi.
Sorotan Penelitian
* Studi ini adalah yang pertama secara sistematis mengungkapkan koeksistensi lima garis keturunan utama PRRSV-2 di Cina pada tahun 2024-2025, termasuk garis keturunan 1.5, 1.8, 3, 5, dan 8.7, dengan garis keturunan 1.8 (mirip dengan NADC30) menjadi strain yang mendominasi (menanggung 48,5% dari sampel positif).
• Guangdong (inti selatan) dan Henan (pusat pusat) adalah "asal penyebaran" dari dua garis keturunan dominan, 1.8 dan 1.5Virus itu menyebar dari dua wilayah ini ke provinsi sekitar di utara dan selatan, dengan Hubei, Shanxi, dan Jiangsu menjadi kelompok baru.
• Daerah ORF2-ORF3 diidentifikasi sebagai hotspot rekombinasi, dengan seringnya rekombinasi antara strain vaksin dan strain tipe liar.
• Berdasarkan analisis jarak genetik MDS, strain vaksin saat ini menunjukkan perbedaan antigenik yang signifikan dari garis keturunan utama yang beredar (1. 8 dan 3),menunjukkan potensi penurunan dalam efektivitas perlindungan vaksin.
• Lini 5 melihat peningkatan 106,6% dalam keragaman nukleotida dalam satu tahun, menunjukkan tingkat evolusi yang sangat dipercepat.
![]()
Studi menunjukkan bahwa lima garis keturunan utama PRRSV-II beredar secara bersamaan di ladang China pada tahun 2024-2025, dengan garis keturunan 1.8 (seperti NADC30) menyumbang hampir setengah,menunjukkan perbedaan antigenik yang signifikan dari strain vaksinVirus telah membentuk pusat transmisi utara-selatan di provinsi Guangdong dan Henan, dengan rekombinasi frekuensi tinggi di wilayah ORF2-ORF3.Silsilah 5 menunjukkan dua kali lipat keragaman genetik dalam satu tahun, menunjukkan tantangan baru terhadap efektivitas perlindungan vaksin saat ini.
Pengantar
PRRSV, salah satu virus paling merusak di industri babi global, telah lazim di Cina selama hampir 30 tahun.dengan mempercepat rekonstruksi industri setelah wabah wabah babi Afrika, masalah diversifikasi garis keturunan PRRSV, transmisi lintas-regional, dan rekombinasi terkait vaksin menjadi semakin menonjol.studi sistematis yang menargetkan fase kritis 2024-2025 masih kurang.
Hasil Penelitian
1Lima garis keturunan hidup berdampingan, dengan garis keturunan 1.8 yang dominan:
Studi ini mengkategorikan PRRSV-2 yang saat ini beredar ke dalam lima garis keturunan: 1.5 (NADC34-like), 1.8 (NADC30-like), 3, 5, dan 8.7Lineage 1.8 menyumbang 48,5% dari sampel positif, menjadikannya strain yang sangat dominan dan yang paling luas didistribusikan; lineage 1.5 menyumbang 23,2%, kedua hanya untuk 1.8 dalam hal prevalensiLini 3, 5, dan 8.7 menunjukkan distribusi yang terbatas secara regional.
![]()
![]()
Gambar 1. Pengumpulan sampel dan analisis filogenetik.
(a) Ukuran lingkaran di setiap provinsi mewakili jumlah sampel, dan warna yang berbeda mewakili garis keturunan yang berbeda.(b) Kemungkinan maksimum (ML) pohon filogenetik genotipe tipe II dari virus sindrom reproduksi dan pernapasan babi Cina (PRRSV)Lingkaran merah mewakili urutan yang diperoleh dalam penelitian ini, dan bintang biru mewakili urutan seluruh genom yang diperoleh.
2. Guangdong dan Henan sebagai "pusat pertukaran virus":
Analisis dinamika transmisi spasial-waktu dengan jelas mengidentifikasi Guangdong dan Henan sebagai "pusat pertukaran virus" untuk PRRSV tipe II, yang berfungsi sebagai simpul transmisi utama yang menghubungkan utara dan selatan.Strain dominan, garis keturunan 1.8, pertama menyebar luas di kedua wilayah ini dan kemudian terus menyebar ke provinsi tetangga seperti Hunan, Hubei, Jiangsu, dan Shaanxi; garis keturunan 1.5, berpusat di Henan, memancarkan ke provinsi tengah dan utara seperti Shanxi, Hebei, dan Zhejiang.kedua wilayah ini membentuk jaringan transmisi terakumulasi yang mencakup utara dan selatan, lebih mendorong pertukaran genetik dan difusi antara garis keturunan yang berbeda.Peran penting mereka juga divalidasi oleh proporsi sampel (peringkat di antara lima besar) dan pelacakan jalur transmisi.
![]()
![]()
![]()
Gambar 2. analisis transmisi.
(a1, b1, c1, d1): Pohon filogenetik yang dibangun menggunakan perangkat lunak Nextstrain dengan perkiraan kemungkinan maksimum berdasarkan ORF5. Daerah yang berbeda pada cabang ditandai dengan warna yang berbeda. (a2, b2,c2, d2): Rekonstruksi filogenetik dari PRRSV ORF5. Ukuran lingkaran mewakili jumlah sampel, dan warna sesuai dengan node nenek moyang.
3Perbedaan antigenik yang signifikan, menantang efektivitas vaksin:
Analisis skala multi-dimensi menunjukkan bahwa strain dominan 1,8 (48.5%) dan strain 3 (keanekaragaman antigen tinggi) dalam garis keturunan PRRSV yang umum saat ini secara signifikan terpisah dari strain vaksin yang umum digunakan seperti JXA1, CH-1R, dan VR2332 dalam ruang antigenik. Sebaliknya, garis keturunan 5 dan 8.7 menunjukkan kemiripan antigenik yang tinggi dengan strain vaksin.Perbedaan antigenik ini menunjukkan bahwa vaksin yang ada mungkin tidak memberikan perlindungan lengkap terhadap dua garis keturunan utama yang umum, 1.8 dan 3, menimbulkan tantangan untuk pengendalian penyakit.
![]()
Gambar 3. Analisis kelompok MDS dari strain vaksin, strain prototipe, dan sampel lapangan.
4Evolusi yang dipercepat dan meningkatnya keragaman genetik dalam garis keturunan 5:
Tipe II PRRSV garis keturunan 5 menunjukkan karakteristik evolusioner yang signifikan, dengan lonjakan 106,6% dalam keragaman nukleotida dalam satu tahun, menunjukkan peningkatan cepat dalam keragaman genetik.Tes D Tajima menunjukkan nilai negatif yang signifikan., menunjukkan bahwa garis keturunan ini mungkin mengalami ekspansi populasi yang cepat atau seleksi arah, dengan tingkat evolusi yang sangat dipercepat.Perlu pemantauan ketat status epidemi dan tren variasi.
![]()
![]()
![]()
Gambar 4. Analisis rekombinasi.
(a) Analisis rekombinasi strain R24121302heyuan241213. Warna yang berbeda mewakili strain yang berbeda; bintang merah menunjukkan R24121302heyuan241213.
(b) Analisis rekombinasi dari strain P24110708wuhan241107. Warna yang berbeda mewakili strain yang berbeda; bintang merah menunjukkan P24110708wuhan241107.
(c) Analisis rekombinasi strain P25012805heyuan250128. warna yang berbeda mewakili strain yang berbeda; sebuah bintang merah menunjukkan P25012805heyuan250128.
![]()
Gambar 5. Analisis keragaman genetik gen ORF5 dari virus sindrom reproduksi dan pernapasan babi tipe II di lima garis keturunan utama di Cina (2024-2025).
(a) Analisis keanekaragaman haplotip (Hd) dari garis keturunan 1.5, 1.8, 3, 5, dan 8.7. b) Analisis keanekaragaman nukleotida (Pi). c) Hasil tes D Tajima; jumlah sumur dan asterisk menunjukkan signifikansi statistik (p < 0,05).
Ringkasan
Studi ini mengisi kesenjangan dalam data epidemiologis PRRSV tipe II 2024-2025 di Cina,dan untuk pertama kalinya secara sistematis mengungkapkan karakteristik rekombinasi dan pola variasi antigenik dari strain dominanStudi ini mengkonfirmasi bahwa PRRSV tipe II telah memasuki tahap baru "variasi yang didorong oleh rekombinasi", yang menimbulkan tantangan serius bagi sistem kontrol vaksin berbasis strain tunggal tradisional.
The research findings not only provide a scientific basis for developing targeted surveillance programs but also point the way for the development of novel broad-spectrum vaccines—future vaccines should focus on covering key antigenic epitopes of L1C sublineage recombinant strains, sementara memperkuat desain urutan untuk wilayah hotspot rekombinasi.Metode klasifikasi garis keturunan dan pemantauan variasi yang ditetapkan dalam penelitian ini dapat memberikan paradigma referensi untuk penelitian epidemiologis PRRSV global.
Kontak Person: Mr. Huang Jingtai
Tel: 17743230916