wiadomości o firmie Kompleksowa analiza PRRSV typu II w Chinach w latach 2024-2025: Współistnienie wielu linii i przyspieszonego antygenu

27 września 2025 r. zespół badawczy z College of Veterinary Medicine na South China Agricultural University opublikował w czasopiśmie *Transboundary and Emerging Diseases* nowe badanie dotyczące epidemiologii molekularnej i dynamiki ewolucyjnej wirusa zespołu rozrodczo-oddechowego świń typu II (PRRSV-2).

W oparciu o 328 próbek klinicznych z 27 prowincji całych Chin w latach 2024–2025 niniejsze badanie jest pierwszym, które systematycznie ujawnia obecne rozmieszczenie linii, wzorce przenoszenia, zmienność antygenową i gorące punkty rekombinacji PRRSV-2 w Chinach, dostarczając ważnych dowodów naukowych na temat optymalizacji szczepionek oraz zapobiegania epidemiom i ich kontroli.

Najważniejsze badania

* Badanie jako pierwsze systematycznie ujawnia współistnienie pięciu głównych linii PRRSV-2 w Chinach w latach 2024–2025, w tym linii 1,5, 1,8, 3, 5 i 8,7, przy czym linia 1,8 (podobna do NADC30) stała się dominującym szczepem krążącym (stanowiącym 48,5% próbek pozytywnych).

• Guangdong (południowe jądro) i Henan (centralny ośrodek) stanowią „rozprzestrzeniające się źródła” dwóch dominujących linii rodowych, 1.8 i 1.5. Wirus rozprzestrzenił się z tych dwóch regionów na sąsiednie prowincje na północy i południu, przy czym Hubei, Shanxi i Jiangsu stały się nowymi skupiskami.

• Region ORF2-ORF3 został zidentyfikowany jako gorący punkt rekombinacji, z częstą rekombinacją pomiędzy szczepami szczepionkowymi a szczepami typu dzikiego.

• Na podstawie analizy odległości genetycznej MDS można stwierdzić, że obecny szczep szczepionkowy wykazuje znaczące różnice antygenowe w porównaniu z głównymi krążącymi liniami (1.8 i 3), co sugeruje potencjalne zmniejszenie skuteczności ochronnej szczepionki.

• Linia 5 odnotowała 106,6% wzrost różnorodności nukleotydów w ciągu jednego roku, co wskazuje na znacznie przyspieszone tempo ewolucji.

Badania pokazują, że w latach 2024–2025 na chińskich polach będzie jednocześnie krążyć pięć głównych linii PRRSV-II, przy czym linia 1.8 (podobna do NADC30) będzie stanowić prawie połowę i będzie wykazywać znaczące różnice antygenowe w porównaniu ze szczepami szczepionkowymi. Wirus utworzył węzeł transmisji z północy na południe w prowincjach Guangdong i Henan, z rekombinacją o wysokiej częstotliwości w regionach ORF2-ORF3. Linia 5 wykazała podwojenie różnorodności genetycznej w ciągu jednego roku, co wskazuje na nowe wyzwania dla skuteczności ochronnej obecnych szczepionek.

Wstęp

PRRSV, jeden z najbardziej niszczycielskich wirusów w światowym przemyśle trzody chlewnej, występuje w Chinach od prawie 30 lat. W ostatnich latach, wraz z przyspieszoną odbudową branży po afrykańskim pomorze świń, kwestie dywersyfikacji linii PRRSV, przenoszenia międzyregionalnego i rekombinacji związanej ze szczepionkami stają się coraz bardziej widoczne. Brakuje jednak systematycznych badań ukierunkowanych na ten krytyczny etap przypadający na lata 2024–2025.

Wyniki badań

1. Współistnieje pięć linii, z dominującą linią 1.8:

W badaniu sklasyfikowano obecnie krążący PRRSV-2 na pięć linii: 1,5 (podobna do NADC34), 1,8 (podobna do NADC30), 3, 5 i 8.7. Linia 1.8 stanowiła 48,5% pozytywnych próbek, co czyni ją odmianą absolutnie dominującą i najbardziej rozpowszechnioną; rodowód 1,5 stanowił 23,2%, ustępując jedynie 1,8 pod względem rozpowszechnienia. Linie 3, 5 i 8.7 wykazywały dystrybucję ograniczoną regionalnie.

Rycina 1. Pobieranie próbek i analiza filogenetyczna.

(a) Rozmiar kół w każdej prowincji oznacza liczbę próbek, a różne kolory reprezentują różne linie rodowe. b) Drzewo filogenetyczne największego prawdopodobieństwa (ML) genotypu typu II chińskiego wirusa zespołu rozrodczo-oddechowego świń (PRRSV). Czerwone kółka reprezentują sekwencje uzyskane w tym badaniu, a niebieskie gwiazdki oznaczają uzyskane sekwencje całego genomu.

2. Guangdong i Henan jako „centra wymiany wirusów”:

Analiza czasoprzestrzenna dynamiki transmisji wyraźnie identyfikuje Guangdong i Henan jako „centra wymiany wirusa” dla PRRSV typu II, służące jako kluczowe węzły transmisji łączące północ z południem. Dominujący szczep, linia 1.8, najpierw rozprzestrzenił się szeroko w tych dwóch regionach, a następnie kontynuował rozprzestrzenienie się na sąsiednie prowincje, takie jak Hunan, Hubei, Jiangsu i Shaanxi; linia 1.5, skupiona w Henan, promieniowała do centralnych i północnych prowincji, takich jak Shanxi, Hebei i Zhejiang. Wykorzystując zalety międzyregionalnego krążenia wirusów, te dwa regiony utworzyły klastrową sieć transmisyjną obejmującą północ i południe, jeszcze bardziej promując wymianę genetyczną i dyfuzję między różnymi liniami. Ich kluczową rolę potwierdzono także na podstawie proporcji próbek (miejsce w pierwszej piątce) i śledzenia ścieżki transmisji.

Rysunek 2. Analiza transmisji.

(a1, b1, c1, d1): Drzewo filogenetyczne skonstruowane przy użyciu oprogramowania Nextstrain z estymacją największej wiarygodności w oparciu o ORF5. Różne obszary na gałęziach są oznaczone różnymi kolorami. (a2, b2, c2, d2): Rekonstrukcja filogenetyczna ORF5 PRRSV. Rozmiar koła reprezentuje liczbę próbek, a kolor odpowiada węzłowi przodkowi.

3. Znaczące różnice antygenowe, kwestionująca skuteczność szczepionki:

Analiza wielowymiarowego skalowania ujawniła, że ​​dominujący szczep 1.8 (48,5%) i szczep 3 (wysoka różnorodność antygenowa) w obecnie dominujących liniach PRRSV są znacząco oddzielone od powszechnie stosowanych szczepów szczepionkowych, takich jak JXA1, CH-1R i VR2332 w przestrzeni antygenowej. I odwrotnie, linie 5 i 8.7 wykazują wysokie podobieństwo antygenowe do szczepów szczepionkowych. Ta rozbieżność antygenowa sugeruje, że istniejące szczepionki mogą nie zapewniać całkowitej ochrony przed dwiema głównymi dominującymi liniami, 1.8 i 3, co stanowi wyzwanie dla kontroli chorób. Wniosek ten wymaga dalszej weryfikacji w drodze kolejnych badań serologicznych.

Rycina 3. Analiza skupień MDS szczepów szczepionkowych, szczepów prototypowych i próbek terenowych.

4. Przyspieszona ewolucja i wzrost różnorodności genetycznej w linii 5:

Linia 5 PRRSV typu II wykazuje znaczące cechy ewolucyjne, ze wzrostem różnorodności nukleotydów o 106,6% w ciągu jednego roku, co wskazuje na szybki wzrost różnorodności genetycznej. Test D Tajimy wykazuje znacząco ujemną wartość, co sugeruje, że linia ta może przechodzić szybką ekspansję populacji lub selekcję kierunkową, ze znacznie przyspieszonym tempem ewolucji. Konieczne jest ścisłe monitorowanie stanu epidemii i trendów zmienności.

Rysunek 4. Analiza rekombinacji.

(a) Analiza rekombinacji szczepu R24121302heyuan241213. Różne kolory reprezentują różne odmiany; czerwona gwiazdka oznacza R24121302heyuan241213.
( b ) Analiza rekombinacji szczepu P24110708wuhan241107. Różne kolory reprezentują różne odmiany; czerwona gwiazdka oznacza P24110708wuhan241107.
(c) Analiza rekombinacji szczepu P25012805heyuan250128. Różne kolory reprezentują różne odmiany; czerwona gwiazdka oznacza P25012805heyuan250128.

Rycina 5. Analiza różnorodności genetycznej genu ORF5 wirusa zespołu rozrodczo-oddechowego świń typu II w pięciu głównych liniach w Chinach (2024–2025).

( a ) Analiza różnorodności haplotypów (Hd) linii 1.5, 1.8, 3, 5 i 8.7. (b) Analiza różnorodności nukleotydów (Pi). (c) Wyniki testu D Tajimy; liczby dołków i gwiazdki wskazują istotność statystyczną (p < 0,05).

Streszczenie

Badanie to wypełnia lukę w danych epidemiologicznych dotyczących PRRSV typu II w Chinach za lata 2024–2025 i po raz pierwszy systematycznie ujawnia cechy rekombinacji i wzorce zmienności antygenowej szczepów dominujących. Badanie potwierdza, że ​​PRRSV typu II wszedł w nowy etap „zmienności wywołanej rekombinacją”, co stanowi poważne wyzwanie dla tradycyjnego systemu kontroli szczepionek opartych na jednym szczepie.

Wyniki badań nie tylko zapewniają podstawę naukową do opracowania programów ukierunkowanego nadzoru, ale także wskazują drogę do opracowania nowatorskich szczepionek o szerokim spektrum działania — przyszłe szczepionki powinny skupiać się na pokryciu kluczowych epitopów antygenowych rekombinowanych szczepów podlinii L1C, przy jednoczesnym wzmocnieniu projektowania sekwencji dla regionów hotspotów rekombinacji. Co więcej, metody klasyfikacji linii i monitorowania zmienności ustalone w tym badaniu mogą stanowić paradygmat odniesienia dla globalnych badań epidemiologicznych PRRSV.