أخبار الشركة عن PLoS One | الخصائص الوبائية لفيروس الدوران الخنزيري من النوعين 2 و 3 المحللة من بيانات ستة أطباء بيطريين أمريكيين

في السنوات الأخيرة، تسبب فيروس سيركوفيروس الخنازير (PCV) في خسائر اقتصادية كبيرة لصناعة الخنازير في جميع أنحاء العالم.فيروسات السيركوفيروس الخنازير من النوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3) هي الفيروسات الأكثر شيوعاً في مزارع الخنازير، كل من هذه المرضات مرتبطة بمجموعة متنوعة من أعراض أمراض الخنازير.

لاستكشاف مزيد من الوبائيات والخصائص السريرية لهذه الدراسة استخدمت بيانات تشخيصية من ست مختبرات تشخيص بيطرية في الولايات المتحدة من عام 2002 إلى 2023.بما في ذلك معلومات عن نتائج PCR، أنواع العينات، وفئات عمر الخنازير. حللت الدراسة انتشار و الارتباطات السريرية لفيروسات السيركوفيروس الخنازير من النوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3).

أظهرت النتائج أن انتشار PCV2 انخفض بعد إدخال اللقاح في عام 2006 ولكنه انتعش بعد عام 2018، وخاصة في مزارع التكاثر.استمر انتشار PCV3 في الزيادة منذ تقريره الأول في عام 2016وبالإضافة إلى ذلك، فإن تحليل بيانات عينات الأنسجة حدد عتبات PCR لتشخيص PCV2 (Ct ≤ 22.4) و PCV3 (Ct ≤ 26.7).قد تساعد هذه النتائج في مراقبة الأهمية السريرية لنتائج اختبار PCV في الوقت الحقيقي وتحديد التهديدات المحتملة للمرض..

مقدمة

يسبب فيروس السيركوفيروس الخنزير من النوع 2 (PCV2) متلازمة التبخر المتعددة الأنظمة ، في حين يرتبط النوع 3 (PCV3) بالفشل الإنجابي والتهاب الجلد والكلى.المرض المرتبط به (PCVAD) يكلف حوالي 3-4 دولار لكل خنزيرلا يمكن أن يعتمد التشخيص فقط على إيجابية PCR؛ فإنه يتطلب مزيجا من آفات الأنسجة الليمفاوية والمظاهر السريرية (مثل فقدان الوزن) ،والحمولة الفيروسية (قيمة Ct) ترتبط بشدة المرضتظهر هذه الدراسة بشكل منهجي اتجاهات انتشار PCV2/3 على المدى الطويل في الولايات المتحدة للمرة الأولى وتضع إطارًا لمراقبة الوقت الحقيقي على أساس البيانات الكبيرة.

نتائج البحث

1نتائج PCR لحالات PCV2 في فترات زمنية مختلفة

كما هو مبين في الشكل 1، استمر معدل إيجابية فيروس PCV2 في الارتفاع بين عامي 2002 و 2006، حيث بلغ ذروته 75.28٪ في عام 2006.انخفض معدل الإيجابية بشكل حاد من 2007 إلى 2011، حيث بلغ 27.24 ٪ في عام 2011. ثم انتعش قليلا من 2012 إلى 2017 ، ثم ارتفع بشكل كبير مرة أخرى بعد عام 2018 ، ليصل إلى 41.39 ٪ في عام 2023.

لاستكشاف مزيد من الوبائيات والخصائص السريرية لهذه الدراسة استخدمت بيانات تشخيصية من ست مختبرات تشخيص بيطرية في الولايات المتحدة من عام 2002 إلى 2023.بما في ذلك معلومات عن نتائج PCR، أنواع العينات، وفئات عمر الخنازير. حللت الدراسة انتشار و الارتباطات السريرية لفيروسات السيركوفيروس الخنازير من النوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3).

أظهرت النتائج أن انتشار PCV2 انخفض بعد إدخال اللقاح في عام 2006 ولكنه انتعش بعد عام 2018، وخاصة في مزارع التكاثر.استمر انتشار PCV3 في الزيادة منذ تقريره الأول في عام 2016وبالإضافة إلى ذلك، فإن تحليل بيانات عينات الأنسجة حدد عتبات PCR لتشخيص PCV2 (Ct ≤ 22.4) و PCV3 (Ct ≤ 26.7).قد تساعد هذه النتائج في مراقبة الأهمية السريرية لنتائج اختبار PCV في الوقت الحقيقي وتحديد التهديدات المحتملة للمرض..

مقدمة

يسبب فيروس السيركوفيروس الخنزير من النوع 2 (PCV2) متلازمة التبخر المتعددة الأنظمة ، في حين يرتبط النوع 3 (PCV3) بالفشل الإنجابي والتهاب الجلد والكلى.المرض المرتبط به (PCVAD) يكلف حوالي 3-4 دولار لكل خنزيرلا يمكن أن يعتمد التشخيص فقط على إيجابية PCR؛ فإنه يتطلب مزيجا من آفات الأنسجة الليمفاوية والمظاهر السريرية (مثل فقدان الوزن) ،والحمولة الفيروسية (قيمة Ct) ترتبط بشدة المرضتظهر هذه الدراسة بشكل منهجي اتجاهات انتشار PCV2/3 على المدى الطويل في الولايات المتحدة للمرة الأولى وتضع إطارًا لمراقبة الوقت الحقيقي على أساس البيانات الكبيرة.

نتائج البحث

1نتائج PCR لحالات PCV2 في فترات زمنية مختلفة

كما هو مبين في الشكل 1، استمر معدل إيجابية فيروس PCV2 في الارتفاع بين عامي 2002 و 2006، حيث بلغ ذروته 75.28٪ في عام 2006.انخفض معدل الإيجابية بشكل حاد من 2007 إلى 2011، حيث بلغ 27.24 ٪ في عام 2011. ثم انتعش قليلا من 2012 إلى 2017 ، ثم ارتفع بشكل كبير مرة أخرى بعد عام 2018 ، ليصل إلى 41.39 ٪ في عام 2023.

الشكل 2. التغيرات في نتائج اختبار PCR PCV3 مع مرور الوقت ، 2017-2023

(الأخضر: سلبي، الأحمر: إيجابي، الخط الأسود المكسور: معدل إيجابي)

الأرجواني: غير محدد; الأصفر: مشتبه به)

الاستنتاج: استمرت إيجابية PCV3 في الارتفاع منذ عام 2016، وخاصة في مزارع البالغين / المراهقين.

3نتائج اختبار PCR لحالات PCV2 و PCV3 المشتركة على مر السنين

يظهر الشكل 3 أنه منذ إدخال اختبار PCV2/PCV3 متعدد PCR في مختبرات التشخيص البيطري في عام 2018 ، ارتفع عدد الحالات التي تعاني من العدوى المشتركة ،من 71 فقط في عام 2017 إلى 8كما ارتفع معدل الإيجابية المشتركة لـ PCV2 و PCV3 من 14.81٪ في ربيع 2018 إلى 33.51٪ في ربيع 2023.

الشكل 3. عدد حالات الكشف المشترك عن PCV2 و PCV3 ومعدلات الإيجابية ، 2017-2023

(الأخضر: سلبي، الأحمر: إيجابي، الخط الأسود المكسور: معدل إيجابي)

الاستنتاج: أدى إدخال اختبار PCR متعدد إلى زيادة كبيرة في معدل الكشف عن PCV2/PCV3، حيث تمثل عينات السوائل المعالجة أعلى نسبة.

4الكشف في مراحل الإنتاج المختلفة

يظهر الشكل 4 أن معدل إيجابية PCV2 كان أعلى في قطيع الخنازير المتنامية من المزارع الخنازير، في حين كان العكس صحيحًا بالنسبة إلى PCV3. علاوة على ذلك، منذ شتاء عام 2019،كان معدل إيجابية فيروس PCV3 في مزارع الخنازير أعلى باستمرار من مجموعات الخنازير المتنامية.

الرسم البياني 4. نسبة الحالات الإيجابية لفيروس PCV2 و PCV3 في مزارع التشطيب/الزراعة والخنازير المفروضة من الرضاعة إلى السوق (2017-2023)

(أ: نسبة الحالات الإيجابية في مزارع التشطيب/الزراعة؛ ب: نسبة الحالات الإيجابية في الخنازير التي تم فصلها لتسويقها)

الاستنتاج: فيروس PCV2 أكثر شيوعًا في الخنازير المنتهية، في حين أن فيروس PCV3 أكثر انتشاراً في الخنازير.

5أنواع العينات المستخدمة لاختبار PCV2 (A) و PCV3 (B) على مر السنين

يظهر الشكل 5 أن الأنسجة والأعضاء (مثل الرئتين، الغدد الليمفاوية، الطحال، الخ) هي أنواع العينات الأكثر شيوعًا التي يتم اختبارها لـ PCV2/3.ارتفعت نسبة عينات السوائل المعالجة بشكل كبير منذ عام 2018، وهو ما يمثل 38% من إجمالي اختبارات PCV2 في عام 2023.

الشكل 5. نسبة الكشف عن PCV2 و PCV3 في أنواع عينة مختلفة

الاستنتاج: تستخدم عينات السوائل المعالجة بشكل متزايد للكشف عن فيروسات السيركوفيروس 2 و 3 للخنازير (PCV2/PCV3) وهي مناسبة بشكل خاص للكشف المتزامن عن كلا الفيروسين.

6الارتباط بين قيم PCR Ct وتشخيص المرض

كشف تحليل الانحدار اللوجستي أن الحد الأدنى لـ Ct للكشف عن PCV2 PCR وصل إلى دقة 81.63٪ وحساسية 81.15٪ عند حد الأدنى لـ Ct 22.4؛ للكشف عن PCV3 PCR ، كان حد قطع Ct من 26. 7 يتوافق مع دقة 70. 69٪ وحساسية 70. 99٪.

الشكل 6. قيم PCV2 و PCV3 Ct ودقة التشخيص والحساسية

الاستنتاج: يمكن استخدام قيم PCR Ct كمؤشر مرجعي للتشخيص السريري لفيروس السيركوفيروس الخنزير من النوعين 2 و 3 (PCV2/PCV3). عندما تكون قيمة Ct للعينة أقل من الحد الأدنى ،من المرجح أن تكون مرتبطة بأمراض سريرية.

ملخص

بناءً على تحليل البيانات من ستة مختبرات تشخيص بيطري في الولايات المتحدة، لوحظ اختلافات كبيرة في نتائج الكشف عن PCV2/ PCV3 عبر فترات زمنية،وأنواع العيناتانخفضت معدلات إيجابية فيروس PCV2 بعد الترويج لللقاح ولكنها عادت إلى الارتفاع في السنوات الأخيرة. استمرت معدلات إيجابية فيروس PCV3 في الارتفاع منذ عام 2016 ،تصبح شائعة بشكل خاص في الخنازير والخنازير البالغةوقد أدى إدخال اختبارات PCR متعددة إلى زيادة كبيرة في معدل الكشف عن PCV2/PCV3 ، مع استخدام عينات السائل المعالجة هي الأكثر شيوعاً.يمكن أن تكون قيم PCR Ct بمثابة مؤشر مرجعي لتشخيص المرض، مساعدة الأطباء البيطريين والمنتجين على مراقبة صحة الخنازير وإدارتها بشكل أكثر فعالية.