berita perusahaan tentang PLoS One. Karakteristik Epidemiologi Sirkovirus Babi Tipe 2 dan 3 dianalisis dari data dari enam dokter hewan AS.

Dalam beberapa tahun terakhir, sirkovirus babi (PCV) telah menyebabkan kerugian ekonomi yang signifikan bagi industri babi di seluruh dunia.Sirkovirus babi tipe 2 (PCV2) dan 3 (PCV3) adalah dua virus yang paling umum di peternakan babi, masing-masing dikaitkan dengan berbagai gejala penyakit babi.

Untuk mempelajari lebih lanjut epidemiologi dan karakteristik klinisnya, penelitian ini menggunakan data diagnostik dari enam laboratorium diagnostik hewan di Amerika Serikat dari tahun 2002 hingga 2023,termasuk informasi tentang hasil PCRStudi ini menganalisis prevalensi dan hubungan klinis sirkovirus babi tipe 2 (PCV2) dan 3 (PCV3).

Hasilnya menunjukkan bahwa prevalensi PCV2 menurun setelah pengenalan vaksin pada tahun 2006 tetapi bangkit kembali setelah 2018, terutama di peternakan pembiakan.Prevalensi PCV3 terus meningkat sejak laporan pertama pada tahun 2016Selain itu, analisis data sampel jaringan menetapkan ambang PCR untuk diagnostik PCV2 (Ct ≤ 22,4) dan PCV3 (Ct ≤ 26,7).Temuan ini dapat membantu memantau signifikansi klinis hasil tes PCV secara real time dan mengidentifikasi potensi ancaman penyakit..

Pengantar

Sirkovirus babi tipe 2 (PCV2) menyebabkan sindrom pembusukan multisystemik, sedangkan tipe 3 (PCV3) dikaitkan dengan gagal reproduksi dan dermatitis dan nefropati.Penyakit terkait (PCVAD) biaya sekitar $ 3-4 per babiDiagnosis tidak dapat didasarkan hanya pada positif PCR; membutuhkan kombinasi lesi jaringan limfoid dan manifestasi klinis (seperti penurunan berat badan),dan beban virus (nilai Ct) berkorelasi dengan tingkat keparahan penyakitStudi ini secara sistematis mengungkapkan tren prevalensi jangka panjang PCV2/3 di Amerika Serikat untuk pertama kalinya dan menetapkan kerangka pemantauan real-time berdasarkan data besar.

Hasil Penelitian

1Hasil PCR dari kasus PCV2 pada periode waktu yang berbeda

Seperti yang ditunjukkan pada Gambar 1, tingkat positif PCV2 terus meningkat antara tahun 2002 dan 2006, mencapai puncak 75,28% pada tahun 2006.tingkat positif turun tajam dari tahun 2007 sampai 2011, mencapai 27,24% pada tahun 2011. Kemudian pulih sedikit dari tahun 2012 hingga 2017, dan kemudian naik secara signifikan lagi setelah tahun 2018, mencapai 41,39% pada tahun 2023.

Untuk mempelajari lebih lanjut epidemiologi dan karakteristik klinisnya, penelitian ini menggunakan data diagnostik dari enam laboratorium diagnostik hewan di Amerika Serikat dari tahun 2002 hingga 2023,termasuk informasi tentang hasil PCRStudi ini menganalisis prevalensi dan hubungan klinis sirkovirus babi tipe 2 (PCV2) dan 3 (PCV3).

Hasilnya menunjukkan bahwa prevalensi PCV2 menurun setelah pengenalan vaksin pada tahun 2006 tetapi bangkit kembali setelah 2018, terutama di peternakan pembiakan.Prevalensi PCV3 terus meningkat sejak laporan pertama pada tahun 2016Selain itu, analisis data sampel jaringan menetapkan ambang PCR untuk diagnostik PCV2 (Ct ≤ 22,4) dan PCV3 (Ct ≤ 26,7).Temuan ini dapat membantu memantau signifikansi klinis hasil tes PCV secara real time dan mengidentifikasi potensi ancaman penyakit..

Pengantar

Sirkovirus babi tipe 2 (PCV2) menyebabkan sindrom pembusukan multisystemik, sedangkan tipe 3 (PCV3) dikaitkan dengan gagal reproduksi dan dermatitis dan nefropati.Penyakit terkait (PCVAD) biaya sekitar $ 3-4 per babiDiagnosis tidak dapat didasarkan hanya pada positif PCR; membutuhkan kombinasi lesi jaringan limfoid dan manifestasi klinis (seperti penurunan berat badan),dan beban virus (nilai Ct) berkorelasi dengan tingkat keparahan penyakitStudi ini secara sistematis mengungkapkan tren prevalensi jangka panjang PCV2/3 di Amerika Serikat untuk pertama kalinya dan menetapkan kerangka pemantauan real-time berdasarkan data besar.

Hasil Penelitian

1Hasil PCR dari kasus PCV2 pada periode waktu yang berbeda

Seperti yang ditunjukkan pada Gambar 1, tingkat positif PCV2 terus meningkat antara tahun 2002 dan 2006, mencapai puncak 75,28% pada tahun 2006.tingkat positif turun tajam dari tahun 2007 sampai 2011, mencapai 27,24% pada tahun 2011. Kemudian pulih sedikit dari tahun 2012 hingga 2017, dan kemudian naik secara signifikan lagi setelah tahun 2018, mencapai 41,39% pada tahun 2023.

Gambar 2. Perubahan hasil tes PCR PCV3 dari waktu ke waktu, 2017-2023

(Hijau: Negatif; Merah: Positif; Hitam garis putus: Tingkat positif;

Ungu: Tidak pasti; Kuning: Diduga)

Kesimpulan: Positivitas PCV3 terus meningkat sejak 2016, terutama di peternakan dewasa/sapi.

3Hasil tes PCR dari kasus infeksi bersama PCV2 dan PCV3 selama bertahun-tahun

Gambar 3 menunjukkan bahwa sejak pengenalan pengujian PCR multiplex PCV2/PCV3 di laboratorium diagnostik hewan pada tahun 2018, jumlah kasus dengan infeksi bersamaan telah meningkat pesat,dari hanya 71 pada tahun 2017 menjadi 8Tingkat ko-positivitas untuk PCV2 dan PCV3 juga meningkat dari 14,81% pada musim semi 2018 menjadi 33,51% pada musim semi 2023.

Gambar 3. Jumlah kasus dan tingkat positif deteksi bersama PCV2 dan PCV3, 2017-2023

(Hijau: Negatif; Merah: Positif; Garis putus hitam: Tingkat positif)

Kesimpulan: Pengenalan pengujian PCR multiplex secara signifikan meningkatkan tingkat deteksi bersama PCV2/PCV3, dengan sampel cairan yang diproses menyumbang persentase tertinggi.

4. Deteksi pada tahap produksi yang berbeda

Gambar 4 menunjukkan bahwa tingkat positif PCV2 lebih tinggi pada ternak babi yang tumbuh daripada di peternakan babi, sedangkan sebaliknya terjadi pada PCV3.tingkat positif PCV3 di peternakan babi betina secara konsisten lebih tinggi daripada pada ternak babi yang sedang tumbuh.

Gambar 4. Persentase kasus positif PCV2 dan PCV3 di peternakan finishing/penanaman dan babi yang disusui untuk dipasarkan (2017-2023)

(A: Persentase Kasus Positif di Ladang Finishing/Benih; B: Persentase Kasus Positif di Babi yang Dibiarkan untuk Dipasarkan)

Kesimpulan: PCV2 lebih umum pada babi finishing, sedangkan PCV3 lebih umum pada babi betina.

5. Jenis Sampel yang Digunakan untuk Pengujian PCV2 (A) dan PCV3 (B) Selama Bertahun-tahun

Gambar 5 menunjukkan bahwa jaringan dan organ (misalnya, paru-paru, kelenjar getah bening, limpa, dll) adalah jenis sampel yang paling umum diuji untuk PCV2/3.persentase sampel cairan yang diproses telah meningkat secara signifikan sejak 2018, menyumbang 38% dari semua pengujian PCV2 pada tahun 2023.

Gambar 5. Proporsi deteksi PCV2 dan PCV3 dalam jenis sampel yang berbeda

Kesimpulan: Sampel cairan yang diproses semakin sering digunakan untuk mendeteksi sirkovirus tipe 2 dan 3 babi (PCV2/PCV3) dan sangat cocok untuk mendeteksi kedua virus secara bersamaan.

6. Korélasi antara Nilai PCR Ct dan Diagnosis Penyakit

Analisis regresi logistik mengungkapkan bahwa batas Ct untuk deteksi PCR PCV2 mencapai akurasi 81,63% dan sensitivitas 81,15% pada batas Ct 22.4Untuk deteksi PCV3 PCR, batas Ct 26,7 sesuai dengan akurasi 70,69% dan sensitivitas 70,99%.

Gambar 6. Nilai Ct PCV2 dan PCV3 dan Keakuratan dan Sensitivitas Diagnostik

Kesimpulan: Nilai Ct PCR dapat digunakan sebagai indikator referensi untuk diagnosis klinis sirkovirus babi tipe 2 dan 3 (PCV2/PCV3).lebih mungkin dikaitkan dengan penyakit klinis.

Ringkasan

Berdasarkan analisis data dari enam laboratorium diagnostik hewan di Amerika Serikat, perbedaan signifikan dalam hasil deteksi PCV2/PCV3 diamati di berbagai periode waktu, tahap produksi,dan jenis sampelTingkat positif PCV2 menurun setelah promosi vaksin tetapi telah bangkit kembali dalam beberapa tahun terakhir. Tingkat positif PCV3 terus meningkat sejak 2016,menjadi sangat umum pada babi dan babi betina dewasaPengenalan tes PCR multiplex telah secara signifikan meningkatkan tingkat deteksi bersama PCV2/PCV3, dengan penggunaan sampel cairan yang diproses menjadi yang paling umum.Nilai PCR Ct dapat berfungsi sebagai indikator referensi untuk diagnosis penyakit, membantu dokter hewan dan produsen untuk memantau dan mengelola kesehatan babi secara lebih efektif.