Negli ultimi anni, il circovirus suino (PCV) ha causato notevoli perdite economiche all'industria suina in tutto il mondo.i virus circovirus suini di tipo 2 (PCV2) e 3 (PCV3) sono i due virus più comuni negli allevamenti suini, ciascuno associato a una varietà di sintomi di malattia dei suini.
Per approfondire la sua epidemiologia e le sue caratteristiche cliniche, questo studio ha utilizzato dati diagnostici provenienti da sei laboratori di diagnostica veterinaria negli Stati Uniti dal 2002 al 2023,comprese le informazioni sui risultati della PCRLo studio ha analizzato la prevalenza e le associazioni cliniche del circovirus suino di tipo 2 (PCV2) e 3 (PCV3).
I risultati hanno mostrato che la prevalenza di PCV2 è diminuita dopo l'introduzione del vaccino nel 2006, ma è ripresa dopo il 2018, in particolare nelle aziende zootecniche.La prevalenza del PCV3 ha continuato ad aumentare dal primo rapporto del 2016Inoltre, l'analisi dei dati dei campioni di tessuto ha stabilito soglie PCR per la diagnosi del PCV2 (Ct ≤ 22,4) e del PCV3 (Ct ≤ 26,7).Questi risultati possono aiutare a monitorare il significato clinico dei risultati dei test PCV in tempo reale e identificare potenziali minacce di malattia..
Introduzione
Il circovirus suino di tipo 2 (PCV2) causa la sindrome da debolezza multisistemica, mentre il tipo 3 (PCV3) è associato a insufficienza riproduttiva e dermatite e nefropatia.La malattia associata (PCVAD) costa circa 3-4 dollari al maialeLa diagnosi non può basarsi esclusivamente sul risultato positivo della PCR; richiede una combinazione di lesioni del tessuto linfoide e manifestazioni cliniche (come perdita di peso),e carica virale (valore Ct) correla con la gravità della malattiaQuesto studio rivela sistematicamente le tendenze di prevalenza a lungo termine del PCV2/3 negli Stati Uniti per la prima volta e stabilisce un quadro di monitoraggio in tempo reale basato su big data.
Risultati della ricerca
1Risultati PCR dei casi di PCV2 in periodi di tempo diversi
Come illustrato nella figura 1, il tasso di positività al PCV2 ha continuato ad aumentare tra il 2002 e il 2006, raggiungendo un picco del 75,28% nel 2006.il tasso di positività è diminuito notevolmente dal 2007 al 2011, raggiungendo il 27,24% nel 2011. Successivamente è rimbalzato leggermente dal 2012 al 2017 e poi è aumentato significativamente di nuovo dopo il 2018, raggiungendo il 41,39% nel 2023.
Per approfondire la sua epidemiologia e le sue caratteristiche cliniche, questo studio ha utilizzato dati diagnostici provenienti da sei laboratori di diagnostica veterinaria negli Stati Uniti dal 2002 al 2023,comprese le informazioni sui risultati della PCRLo studio ha analizzato la prevalenza e le associazioni cliniche del circovirus suino di tipo 2 (PCV2) e 3 (PCV3).
I risultati hanno mostrato che la prevalenza di PCV2 è diminuita dopo l'introduzione del vaccino nel 2006, ma è ripresa dopo il 2018, in particolare nelle aziende zootecniche.La prevalenza del PCV3 ha continuato ad aumentare dal primo rapporto del 2016Inoltre, l'analisi dei dati dei campioni di tessuto ha stabilito soglie PCR per la diagnosi del PCV2 (Ct ≤ 22,4) e del PCV3 (Ct ≤ 26,7).Questi risultati possono aiutare a monitorare il significato clinico dei risultati dei test PCV in tempo reale e identificare potenziali minacce di malattia..
Introduzione
Il circovirus suino di tipo 2 (PCV2) causa la sindrome da debolezza multisistemica, mentre il tipo 3 (PCV3) è associato a insufficienza riproduttiva e dermatite e nefropatia.La malattia associata (PCVAD) costa circa 3-4 dollari al maialeLa diagnosi non può basarsi esclusivamente sul risultato positivo della PCR; richiede una combinazione di lesioni del tessuto linfoide e manifestazioni cliniche (come perdita di peso),e carica virale (valore Ct) correla con la gravità della malattiaQuesto studio rivela sistematicamente le tendenze di prevalenza a lungo termine del PCV2/3 negli Stati Uniti per la prima volta e stabilisce un quadro di monitoraggio in tempo reale basato su big data.
Risultati della ricerca
1Risultati PCR dei casi di PCV2 in periodi di tempo diversi
Come illustrato nella figura 1, il tasso di positività al PCV2 ha continuato ad aumentare tra il 2002 e il 2006, raggiungendo un picco del 75,28% nel 2006.il tasso di positività è diminuito notevolmente dal 2007 al 2011, raggiungendo il 27,24% nel 2011. Successivamente è rimbalzato leggermente dal 2012 al 2017 e poi è aumentato significativamente di nuovo dopo il 2018, raggiungendo il 41,39% nel 2023.
Figura 2. Variazioni dei risultati dei test PCR PCV3 nel tempo, 2017-2023
(Verde: negativo; rosso: positivo; linea rotta nera: tasso positivo;
Viola: indeterminata; gialla: sospetta)
Conclusione: dal 2016 la positività al PCV3 ha continuato ad aumentare, in particolare negli allevamenti di suine adulte.
3Risultati dei test PCR dei casi di coinfezione da PCV2 e PCV3 nel corso degli anni
La figura 3 mostra che, dall'introduzione del test PCR multiplex PCV2/PCV3 nei laboratori veterinari di diagnostica nel 2018, il numero di casi con coinfezione è aumentato,da soli 71 nel 2017 a 8Il tasso di co-positività per PCV2 e PCV3 è aumentato dal 14,81% nella primavera del 2018 al 33,51% nella primavera del 2023.
Figura 3. Numero di casi di co-individuazione del PCV2 e del PCV3 e tassi di positività, 2017-2023
(Verde: negativo; rosso: positivo; linea nera spezzata: tasso positivo)
Conclusione: l'introduzione del test PCR multiplex ha aumentato significativamente il tasso di co-individuazione del PCV2/PCV3, con i campioni di fluidi trattati che rappresentano la percentuale più alta.
4. rilevamento in diverse fasi di produzione
La figura 4 mostra che il tasso di positività al PCV2 era più elevato nelle mandrie di suini in crescita rispetto alle fattorie di scrofe, mentre il contrario era vero per il PCV3.il tasso di positività al PCV3 negli allevamenti di scrofe è costantemente più elevato rispetto alle mandrie di suini in crescita.
Figura 4. Percentuale di casi positivi di PCV2 e PCV3 negli allevamenti di finitura/semina e nei suini svezzati per essere immessi sul mercato (2017-2023)
(A: Percentuale di casi positivi negli allevamenti di finitura/semina; B: Percentuale di casi positivi nei suini svezzati)
Conclusione: il PCV2 è più comune nei suini da lavorazione, mentre il PCV3 è più comune nelle scrofe.
5. Tipologie di campioni utilizzati per le prove del PCV2 (A) e del PCV3 (B) nel corso degli anni
La figura 5 mostra che i tessuti e gli organi (es. polmoni, linfonodi, milza, ecc.) sono i tipi di campione più comuni testati per il PCV2/3.la percentuale di campioni di fluidi trattati è aumentata significativamente dal 2018, che rappresentano il 38% di tutti i test PCV2 nel 2023.
Figura 5. Proporzioni di rilevamento di PCV2 e PCV3 in diversi tipi di campioni
Conclusione: i campioni di fluidi trattati sono sempre più utilizzati per la rilevazione del circovirus suino di tipo 2 e 3 (PCV2/PCV3) e sono particolarmente adatti per la rilevazione simultanea di entrambi i virus.
6. Correlazione tra i valori di PCR-CT e la diagnosi della malattia
L'analisi di regressione logistica ha rivelato che il limite di Ct per la rilevazione PCR del PCV2 ha raggiunto l'81,63% di precisione e l'81,15% di sensibilità a un limite di Ct di 22.4Per la rilevazione PCR del PCV3, il limite di Ct di 26,7 corrispondeva a una precisione del 70,69% e una sensibilità del 70,99%.
Figura 6. Valori di Ct del PCV2 e del PCV3 e precisione e sensibilità diagnostica
Conclusione: i valori di Ct della PCR possono essere utilizzati come indicatore di riferimento per la diagnosi clinica del circovirus suino di tipo 2 e 3 (PCV2/PCV3).è più probabile che sia associato a malattie cliniche.
Riassunto
Sulla base dell' analisi dei dati provenienti da sei laboratori di diagnostica veterinaria negli Stati Uniti, sono state osservate differenze significative nei risultati di rilevazione del PCV2/PCV3 tra periodi di tempo, fasi di produzione,e tipi di campioneI tassi di positività del PCV2 sono diminuiti dopo la promozione del vaccino, ma sono rimbalzati negli ultimi anni.diventando particolarmente comune nei suini e suine adultiL'introduzione di test PCR multiplex ha aumentato significativamente il tasso di co-individuazione del PCV2/PCV3, con l'uso di campioni di fluidi trattati come il più comune.I valori Ct della PCR possono servire come indicatore di riferimento per la diagnosi della malattia, aiutano i veterinari e i produttori a monitorare e gestire in modo più efficace la salute dei suini.
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