Son yıllarda, domuz circovirusu (PCV) dünya çapında domuz endüstrisine önemli ekonomik kayıplara neden olmuştur. Bunların arasında, domuz circovirus tipleri 2 (PCV2) ve 3 (PCV3), domuz çiftliklerinde en yaygın iki virüstür ve her biri çeşitli domuz hastalığı semptomlarıyla ilişkilidir.
Epidemiyolojisini ve klinik özelliklerini daha fazla araştırmak için, bu çalışma, 2002'den 2023'e kadar Amerika Birleşik Devletleri'ndeki altı veteriner teşhis laboratuvarından PCR sonuçları, numune türleri ve domuz yaş grupları hakkında bilgiler dahil olmak üzere teşhis verilerini kullandı. Çalışma, domuz circovirus tipleri 2 (PCV2) ve 3 (PCV3) prevalansını ve klinik ilişkilerini analiz etti.
Sonuçlar, PCV2 prevalansının 2006'da aşının piyasaya sürülmesinden sonra azaldığını, ancak özellikle damızlık çiftliklerinde 2018'den sonra tekrar yükseldiğini gösterdi. PCV3 prevalansı, 2016'daki ilk raporundan bu yana artmaya devam etti, 2023'te zirve yaptı ve yetişkin domuzlarda daha yaygın hale geldi. Ayrıca, doku numunesi verilerinin analizi, PCV2 (Ct ≤ 22.4) ve PCV3 (Ct ≤ 26.7) teşhisi için PCR eşik değerleri belirledi. Bu bulgular, PCV test sonuçlarının klinik önemini gerçek zamanlı olarak izlemeye ve potansiyel hastalık tehditlerini belirlemeye yardımcı olabilir.
Giriş
Domuz circovirus tipi 2 (PCV2) çoklu sistemik israf sendromuna neden olurken, tip 3 (PCV3) üreme yetmezliği ve dermatit ve nefropati ile ilişkilidir. İlişkili hastalık (PCVAD) domuz başına yaklaşık 3-4 ABD dolarına mal olur. Teşhis yalnızca PCR pozitifliğine dayandırılamaz; lenfoid doku lezyonları ve klinik belirtilerin (kilo kaybı gibi) bir kombinasyonunu ve viral yükün (Ct değeri) hastalık şiddetiyle korelasyonunu gerektirir. Bu çalışma, ilk kez Amerika Birleşik Devletleri'nde PCV2/3'ün uzun vadeli prevalans eğilimlerini sistematik olarak ortaya koymakta ve büyük verilere dayalı gerçek zamanlı bir izleme çerçevesi oluşturmaktadır.
Araştırma Sonuçları
1. Farklı Zaman Dilimlerindeki PCV2 Vakalarının PCR Sonuçları
Şekil 1'de gösterildiği gibi, PCV2 pozitiflik oranı 2002 ile 2006 arasında artmaya devam etti ve 2006'da %75,28'lik bir zirveye ulaştı. Ancak, 2006'da aşının piyasaya sürülmesinden sonra, pozitiflik oranı 2007'den 2011'e kadar keskin bir şekilde düştü ve 2011'de %27,24'e ulaştı. Daha sonra 2012'den 2017'ye kadar hafifçe toparlandı ve ardından 2018'den sonra tekrar önemli ölçüde yükselerek 2023'te %41,39'a ulaştı.
Epidemiyolojisini ve klinik özelliklerini daha fazla araştırmak için, bu çalışma, 2002'den 2023'e kadar Amerika Birleşik Devletleri'ndeki altı veteriner teşhis laboratuvarından PCR sonuçları, numune türleri ve domuz yaş grupları hakkında bilgiler dahil olmak üzere teşhis verilerini kullandı. Çalışma, domuz circovirus tipleri 2 (PCV2) ve 3 (PCV3) prevalansını ve klinik ilişkilerini analiz etti.
Sonuçlar, PCV2 prevalansının 2006'da aşının piyasaya sürülmesinden sonra azaldığını, ancak özellikle damızlık çiftliklerinde 2018'den sonra tekrar yükseldiğini gösterdi. PCV3 prevalansı, 2016'daki ilk raporundan bu yana artmaya devam etti, 2023'te zirve yaptı ve yetişkin domuzlarda daha yaygın hale geldi. Ayrıca, doku numunesi verilerinin analizi, PCV2 (Ct ≤ 22.4) ve PCV3 (Ct ≤ 26.7) teşhisi için PCR eşik değerleri belirledi. Bu bulgular, PCV test sonuçlarının klinik önemini gerçek zamanlı olarak izlemeye ve potansiyel hastalık tehditlerini belirlemeye yardımcı olabilir.
Giriş
Domuz circovirus tipi 2 (PCV2) çoklu sistemik israf sendromuna neden olurken, tip 3 (PCV3) üreme yetmezliği ve dermatit ve nefropati ile ilişkilidir. İlişkili hastalık (PCVAD) domuz başına yaklaşık 3-4 ABD dolarına mal olur. Teşhis yalnızca PCR pozitifliğine dayandırılamaz; lenfoid doku lezyonları ve klinik belirtilerin (kilo kaybı gibi) bir kombinasyonunu ve viral yükün (Ct değeri) hastalık şiddetiyle korelasyonunu gerektirir. Bu çalışma, ilk kez Amerika Birleşik Devletleri'nde PCV2/3'ün uzun vadeli prevalans eğilimlerini sistematik olarak ortaya koymakta ve büyük verilere dayalı gerçek zamanlı bir izleme çerçevesi oluşturmaktadır.
Araştırma Sonuçları
1. Farklı Zaman Dilimlerindeki PCV2 Vakalarının PCR Sonuçları
Şekil 1'de gösterildiği gibi, PCV2 pozitiflik oranı 2002 ile 2006 arasında artmaya devam etti ve 2006'da %75,28'lik bir zirveye ulaştı. Ancak, 2006'da aşının piyasaya sürülmesinden sonra, pozitiflik oranı 2007'den 2011'e kadar keskin bir şekilde düştü ve 2011'de %27,24'e ulaştı. Daha sonra 2012'den 2017'ye kadar hafifçe toparlandı ve ardından 2018'den sonra tekrar önemli ölçüde yükselerek 2023'te %41,39'a ulaştı.
Şekil 2. PCV3 PCR Test Sonuçlarındaki Zaman İçindeki Değişiklikler, 2017-2023
(Yeşil: Negatif; Kırmızı: Pozitif; Siyah kesik çizgi: Pozitif oran;
Mor: Belirsiz; Sarı: Şüpheli)
Sonuç: PCV3 pozitifliği, özellikle yetişkin/dişi domuz çiftliklerinde 2016'dan beri artmaya devam etti.
3. Yıllar İçinde PCV2 ve PCV3 Ko-enfeksiyon Vakalarının PCR Test Sonuçları
Şekil 3, 2018'de veteriner teşhis laboratuvarlarında PCV2/PCV3 çoklu PCR testinin uygulanmasından bu yana, ko-enfeksiyon vakalarının sayısının 2017'deki sadece 71'den 2023'te 8.817'ye (o yılki PCV2 testlerinin yaklaşık %80'ini oluşturuyor) yükseldiğini göstermektedir. PCV2 ve PCV3 için ko-pozitiflik oranı da 2018 baharında %14,81'den 2023 baharında %33,51'e yükseldi.
Şekil 3. PCV2 ve PCV3 Ko-tespit Vakalarının Sayısı ve Pozitif Oranları, 2017-2023
(Yeşil: Negatif; Kırmızı: Pozitif; Siyah kesik çizgi: Pozitif oran)
Sonuç: Çoklu PCR testinin uygulanması, PCV2/PCV3 ko-tespit oranını önemli ölçüde artırdı ve işlenmiş sıvı numuneleri en yüksek yüzdeyi oluşturdu.
4. Farklı Üretim Aşamalarında Tespit
Şekil 4, PCV2 pozitiflik oranının büyüyen domuz sürülerinde dişi domuz çiftliklerine göre daha yüksek olduğunu, PCV3 için ise bunun tersinin geçerli olduğunu göstermektedir. Ayrıca, 2019 kışından beri, dişi domuz çiftliklerindeki PCV3 pozitiflik oranı, büyüyen domuz sürülerine göre sürekli olarak daha yüksek olmuştur.
Şekil 4. Besleme/Dişi Domuz Çiftlikleri ve Pazara Hazır Domuzlarda PCV2 ve PCV3 Pozitif Vakaların Yüzdesi (2017-2023)
(A: Besleme/Dişi Domuz Çiftliklerindeki Pozitif Vakaların Yüzdesi; B: Pazara Hazır Domuzlardaki Pozitif Vakaların Yüzdesi)
Sonuç: PCV2, besleme domuzlarında daha yaygınken, PCV3 dişi domuzlarda daha yaygındır.
5. Yıllar İçinde PCV2 (A) ve PCV3 (B) Testi İçin Kullanılan Numune Türleri
Şekil 5, doku ve organların (örneğin, akciğerler, lenf düğümleri, dalak vb.) PCV2/3 için test edilen en yaygın numune türleri olduğunu göstermektedir. Ayrıca, işlenmiş sıvı numunelerinin oranı 2018'den beri önemli ölçüde artmış ve 2023'te tüm PCV2 testlerinin %38'ini oluşturmaktadır.
Şekil 5. Farklı Numune Türlerinde PCV2 ve PCV3'ün Tespit Oranları
Sonuç: İşlenmiş sıvı numuneleri, domuz circovirus tipleri 2 ve 3'ü (PCV2/PCV3) tespit etmek için giderek daha fazla kullanılmaktadır ve her iki virüsün aynı anda tespiti için özellikle uygundur.
6. PCR Ct Değerleri ile Hastalık Teşhisi Arasındaki Korelasyon
Lojistik regresyon analizi, PCV2 PCR tespiti için Ct kesme değerinin 22,4'lük bir Ct kesme değerinde %81,63 doğruluk ve %81,15 duyarlılığa ulaştığını ortaya koydu; PCV3 PCR tespiti için, 26,7'lik Ct kesme değeri %70,69 doğruluk ve %70,99 duyarlılığa karşılık geliyordu.
Şekil 6. PCV2 ve PCV3 Ct Değerleri ve Teşhis Doğruluğu ve Duyarlılığı
Sonuç: PCR Ct değerleri, domuz circovirus tipleri 2 ve 3'ün (PCV2/PCV3) klinik teşhisi için bir referans göstergesi olarak kullanılabilir. Bir numunenin Ct değeri kesme değerinin altındaysa, klinik hastalıkla ilişkilendirilme olasılığı daha yüksektir.
Özet
Amerika Birleşik Devletleri'ndeki altı veteriner teşhis laboratuvarından elde edilen veri analizine dayanarak, PCV2/PCV3 tespit sonuçlarında zaman dilimleri, üretim aşamaları ve numune türleri arasında önemli farklılıklar gözlemlenmiştir. PCV2 pozitiflik oranları aşı teşvikinden sonra azalmış, ancak son yıllarda tekrar yükselmiştir. PCV3 pozitiflik oranları 2016'dan beri artmaya devam etmekte ve özellikle yetişkin domuzlarda ve dişi domuzlarda yaygın hale gelmektedir. Çoklu PCR testlerinin uygulanması, işlenmiş sıvı numunelerinin kullanımı en yaygın olmak üzere, PCV2/PCV3 ko-tespit oranını önemli ölçüde artırmıştır. PCR Ct değerleri, veteriner hekimlerin ve üreticilerin domuz sağlığını daha etkili bir şekilde izlemesine ve yönetmesine yardımcı olarak hastalık teşhisi için bir referans göstergesi olarak hizmet edebilir.
Mesajınız 20-3.000 karakter arasında olmalıdır!