اخبار شرکت PLoS One. مشخصه های اپیدمیولوژیک سیروویروس خوک نوع 2 و 3 تحلیل شده از داده های شش دامپزشک ایالات متحده

در سال های اخیر، سیروویروس خوک (PCV) باعث خسارت های اقتصادی قابل توجهی در صنعت خوک در سراسر جهان شده است.ویروس سیرکوویروس خوک نوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3) دو ویروس شایع ترین در مزارع خوک هستند.، هرکدام با انواع علائم بیماری خوک همراه هستند.

برای بررسی بیشتر اپیدمیولوژی و ویژگی های بالینی آن، این مطالعه از داده های تشخیصی از شش آزمایشگاه تشخیصی دامپزشکی در ایالات متحده از سال 2002 تا 2023 استفاده کرد.از جمله اطلاعات مربوط به نتایج PCRدر این مطالعه شیوع و ارتباط بالینی ویروس سیرکوویروس خوک نوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.

نتایج نشان داد که شیوع PCV2 پس از معرفی واکسن در سال 2006 کاهش یافته اما پس از سال 2018 به ویژه در مزارع پرورش، بهبود یافته است.شیوع PCV3 از اولین گزارش در سال 2016 افزایش یافته استعلاوه بر این، تجزیه و تحلیل داده های نمونه بافت، آستانه های PCR را برای تشخیص PCV2 (Ct ≤ 22.4) و PCV3 (Ct ≤ 26.7) تعیین کرد.این یافته ها ممکن است به نظارت بر اهمیت بالینی نتایج آزمایش PCV در زمان واقعی و شناسایی تهدیدات احتمالی بیماری کمک کنند..

مقدمه

سیرکوویروس خوک نوع 2 (PCV2) باعث سندرم از بین رفتن چند سیستم می شود، در حالی که نوع 3 (PCV3) با نارسایی باروری و درماتیت و نفروپاتی مرتبط است.بیماری مرتبط با آن (PCVAD) حدود ۳ تا ۴ دلار برای هر خوک هزینه داردتشخیص تنها بر اساس PCR مثبت نیست؛ نیاز به ترکیبی از ضایعات بافت لنفوی و نشانه های بالینی (مانند کاهش وزن) دارد.و بار ویروسی (قیمت Ct) با شدت بیماری ارتباط دارد.این مطالعه برای اولین بار روند شیوع طولانی مدت PCV2/3 را در ایالات متحده به طور سیستماتیک نشان می دهد و یک چارچوب نظارت در زمان واقعی بر اساس داده های بزرگ ایجاد می کند.

نتایج تحقیقات

1نتایج PCR از موارد PCV2 در دوره های زمانی مختلف

همانطور که در شکل 1 نشان داده شده است، میزان مثبت بودن PCV2 بین سال های 2002 تا 2006 همچنان در حال افزایش است و به اوج 75.28٪ در سال 2006 رسیده است.میزان مثبت بودن از سال 2007 تا 2011 به شدت کاهش یافته است.در سال ۲۰۱۱، این نرخ به ۲۷.۲۴ درصد رسید. سپس از سال ۲۰۱۲ تا ۲۰۱۷ کمی بهبود یافت و سپس پس از سال ۲۰۱۸ دوباره به طور قابل توجهی افزایش یافت و در سال ۲۰۲۳ به ۴۱.۳۹ درصد رسید.

برای بررسی بیشتر اپیدمیولوژی و ویژگی های بالینی آن، این مطالعه از داده های تشخیصی از شش آزمایشگاه تشخیصی دامپزشکی در ایالات متحده از سال 2002 تا 2023 استفاده کرد.از جمله اطلاعات مربوط به نتایج PCRدر این مطالعه شیوع و ارتباط بالینی ویروس سیرکوویروس خوک نوع 2 (PCV2) و 3 (PCV3) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.

نتایج نشان داد که شیوع PCV2 پس از معرفی واکسن در سال 2006 کاهش یافته اما پس از سال 2018 به ویژه در مزارع پرورش، بهبود یافته است.شیوع PCV3 از اولین گزارش در سال 2016 افزایش یافته استعلاوه بر این، تجزیه و تحلیل داده های نمونه بافت، آستانه های PCR را برای تشخیص PCV2 (Ct ≤ 22.4) و PCV3 (Ct ≤ 26.7) تعیین کرد.این یافته ها ممکن است به نظارت بر اهمیت بالینی نتایج آزمایش PCV در زمان واقعی و شناسایی تهدیدات احتمالی بیماری کمک کنند..

مقدمه

سیرکوویروس خوک نوع 2 (PCV2) باعث سندرم از بین رفتن چند سیستم می شود، در حالی که نوع 3 (PCV3) با نارسایی باروری و درماتیت و نفروپاتی مرتبط است.بیماری مرتبط (PCVAD) حدود ۳ تا ۴ دلار برای هر خوک هزینه داردتشخیص تنها بر اساس PCR مثبت نیست؛ نیاز به ترکیبی از ضایعات بافت لنفوی و نشانه های بالینی (مانند کاهش وزن) دارد.و بار ویروسی (قیمت Ct) با شدت بیماری ارتباط دارد.این مطالعه برای اولین بار روند شیوع طولانی مدت PCV2/3 را در ایالات متحده به طور سیستماتیک نشان می دهد و یک چارچوب نظارت در زمان واقعی بر اساس داده های بزرگ ایجاد می کند.

نتایج تحقیقات

1نتایج PCR از موارد PCV2 در دوره های زمانی مختلف

همانطور که در شکل 1 نشان داده شده است، میزان مثبت بودن PCV2 بین سال های 2002 تا 2006 همچنان در حال افزایش است و به اوج 75.28٪ در سال 2006 رسیده است.میزان مثبت بودن از سال 2007 تا 2011 به شدت کاهش یافته است.در سال ۲۰۱۱، این نرخ به ۲۷.۲۴ درصد رسید. سپس از سال ۲۰۱۲ تا ۲۰۱۷ کمی بهبود یافت و سپس پس از سال ۲۰۱۸ دوباره به طور قابل توجهی افزایش یافت و در سال ۲۰۲۳ به ۴۱.۳۹ درصد رسید.

نمودار ۲. تغییرات در نتایج آزمایش PCR PCV3 در طول زمان، 2017-2023

(سبز: منفی؛ قرمز: مثبت؛ خط شکسته سیاه: نرخ مثبت؛

بنفش: نامشخص؛ زرد: مشکوک)

نتیجه گیری: مثبت بودن PCV3 از سال ۲۰۱۶ به ویژه در مزارع بزرگسالان/خشک ها افزایش یافته است.

3نتایج آزمایش PCR از موارد عفونت همزمان PCV2 و PCV3 در طول سال ها

شکل 3 نشان می دهد که از زمان معرفی آزمایش PCR چندگانه PCV2/PCV3 در آزمایشگاه های تشخیصی دامپزشکی در سال 2018، تعداد موارد مبتلا به عفونت همزمان افزایش یافته است.از فقط 71 در سال 2017 به 8در سال 2023، میزان مثبت بودن PCV2 و PCV3 نیز از 14.81٪ در بهار 2018 به 33.51٪ در بهار 2023 افزایش یافته است.

نمودار 3 تعداد موارد تشخیص همزمان PCV2 و PCV3 و نرخ مثبت، 2017-2023

(سبز: منفی؛ قرمز: مثبت؛ خط شکسته سیاه: نرخ مثبت)

نتیجه گیری: معرفی آزمایش PCR چندگانه به طور قابل توجهی میزان تشخیص همزمان PCV2/PCV3 را افزایش داد، که بیشترین درصد را نمونه های مایعات پردازش شده تشکیل می دهند.

4. تشخیص در مراحل مختلف تولید

شکل 4 نشان می دهد که میزان مثبت بودن PCV2 در گلهای خوک در حال رشد بیشتر از مزارع خوک بود، در حالی که برعکس برای PCV3 بود. علاوه بر این، از زمستان 2019،میزان مثبت بودن PCV3 در مزارع خوک به طور مداوم بالاتر از گله های خوک در حال رشد بوده است..

نمودار ۴. درصد موارد مثبت PCV2 و PCV3 در مزارع تکمیل کننده / تخم گذاری و خوک های از شیر گرفته شده تا به بازار عرضه شده (2017-2023)

(A: درصد موارد مثبت در مزرعه های فرآوری / بذر؛ B: درصد موارد مثبت در خوک های از شیر گرفته شده تا به بازار)

نتیجه گیری: PCV2 در خوک های فرآوری بیشتر است، در حالی که PCV3 در خوک های سوزی بیشتر است.

5انواع نمونه هایی که برای آزمایش PCV2 (A) و PCV3 (B) در طول سالها استفاده شده اند

شکل 5 نشان می دهد که بافت ها و اندام ها (به عنوان مثال ریه ها، غدد لنفاوی، طحال و غیره) شایع ترین نمونه هایی هستند که برای PCV2/3 آزمایش می شوند.نسبت نمونه های مایعات پردازش شده از سال 2018 به طور قابل توجهی افزایش یافته است، که در سال 2023 38 درصد از کل آزمایشات PCV2 را تشکیل می دهد.

شکل ۵: نسبت تشخیص PCV2 و PCV3 در نمونه های مختلف

نتیجه گیری: نمونه های مایع پردازش شده به طور فزاینده ای برای تشخیص انواع 2 و 3 (PCV2/PCV3) از ویروس سیرکوویروس خوک استفاده می شوند و به ویژه برای تشخیص همزمان هر دو ویروس مناسب هستند.

6ارتباط بین مقادیر PCR و تشخیص بیماری

تجزیه و تحلیل بازگشت لجستیکی نشان داد که حد قطع Ct برای تشخیص PCV2 PCR به دقت 81.63٪ و حساسیت 81.15٪ در حد قطع Ct 22 رسید.4برای تشخیص PCV3 PCR، حد قطع Ct 26.7 با دقت 70.69٪ و حساسیت 70.99٪ مطابقت داشت.

شکل ۶. مقادیر Ct PCV2 و PCV3 و دقت و حساسیت تشخیصی

نتیجه گیری: مقادیر Ct PCR را می توان به عنوان شاخص مرجع برای تشخیص بالینی circovirus خوک نوع 2 و 3 (PCV2/PCV3) استفاده کرد.احتمال بیشتری دارد که با بیماری بالینی همراه باشد..

خلاصه

بر اساس تجزیه و تحلیل داده ها از شش آزمایشگاه تشخیصی دامپزشکی در ایالات متحده، تفاوت های قابل توجهی در نتایج تشخیص PCV2/PCV3 در دوره های زمانی، مراحل تولید،و انواع نمونهنرخ مثبت بودن PCV2 پس از ترویج واکسن کاهش یافت اما در سال های اخیر بهبود یافته است. نرخ مثبت بودن PCV3 از سال 2016 افزایش یافته است.به ویژه در خوک ها و خوک های بالغ شایع می شود.معرفی آزمایش های PCR چندگانه به طور قابل توجهی میزان تشخیص همزمان PCV2/PCV3 را افزایش داده است و استفاده از نمونه های مایع پردازش شده شایع ترین مورد است.مقادیر PCR Ct می توانند به عنوان شاخص مرجع برای تشخیص بیماری عمل کنند.، کمک به دامپزشکان و تولید کنندگان برای نظارت و مدیریت موثرتر سلامت خوک.