bedrijfsnieuws over PLoS One | Epidemiologische kenmerken van Porcine Circovirus Types 2 en 3 geanalyseerd aan de hand van gegevens van zes Amerikaanse dierenartsen

In de afgelopen jaren heeft het circovirus bij varkens (PCV) wereldwijd aanzienlijke economische verliezen veroorzaakt voor de varkensindustrie.varkenscircovirussoorten 2 (PCV2) en 3 (PCV3) zijn de twee meest voorkomende virussen in varkenshouderijen, elk geassocieerd met een verscheidenheid aan symptomen van varkensziekte.

Om de epidemiologie en de klinische kenmerken verder te onderzoeken, gebruikte dit onderzoek diagnostische gegevens van zes veterinaire diagnostische laboratoria in de Verenigde Staten van 2002 tot 2023,met inbegrip van informatie over PCR-resultatenDe studie analyseerde de prevalentie en klinische associaties van circovirussoorten 2 (PCV2) en 3 (PCV3) bij varkens.

De resultaten toonden aan dat de prevalentie van PCV2 daalde na de introductie van het vaccin in 2006, maar na 2018 herstelde, vooral in fokbedrijven.De prevalentie van PCV3 is sinds het eerste rapport in 2016 blijven toenemen.Bovendien werd met behulp van analyses van weefselmonsters PCR-drempels vastgesteld voor PCV2- (Ct ≤ 22,4) en PCV3- (Ct ≤ 26,7) -diagnostiek.Deze bevindingen kunnen helpen de klinische betekenis van PCV-testresultaten in realtime te controleren en mogelijke ziekte bedreigingen te identificeren..

Inleiding

Varkenscircovirus type 2 (PCV2) veroorzaakt multisystemisch verwerpingssyndroom, terwijl type 3 (PCV3) geassocieerd wordt met reproductief falen en dermatitis en nephropathie.De bijbehorende ziekte (PCVAD) kost ongeveer $3-4 per varkenDe diagnose kan niet alleen gebaseerd zijn op PCR-positieve resultaten; het vereist een combinatie van lymfweefselletsel en klinische manifestaties (zoals gewichtsverlies),en virale lading (Ct-waarde) correleert met de ernst van de ziekteDeze studie onthult voor het eerst systematisch de langetermijntrends van de prevalentie van PCV2/3 in de Verenigde Staten en stelt een real-time monitoringraamwerk op basis van big data op.

Onderzoeksresultaten

1. PCR-resultaten van PCV2-gevallen in verschillende tijdperken

Zoals in figuur 1 wordt weergegeven, bleef het PCV2-positiviteitspercentage tussen 2002 en 2006 stijgen en bereikte het een piek van 75,28% in 2006.Het positieve percentage daalde sterk van 2007 tot 2011Het is dan licht teruggekomen van 2012 tot 2017 en daarna opnieuw aanzienlijk gestegen na 2018, om in 2023 41,39% te bereiken.

Om de epidemiologie en de klinische kenmerken verder te onderzoeken, gebruikte dit onderzoek diagnostische gegevens van zes veterinaire diagnostische laboratoria in de Verenigde Staten van 2002 tot 2023,met inbegrip van informatie over PCR-resultatenDe studie analyseerde de prevalentie en klinische associaties van circovirussoorten 2 (PCV2) en 3 (PCV3) bij varkens.

De resultaten toonden aan dat de prevalentie van PCV2 daalde na de introductie van het vaccin in 2006, maar na 2018 herstelde, vooral in fokbedrijven.De prevalentie van PCV3 is sinds het eerste rapport in 2016 blijven toenemen.Bovendien werd met behulp van analyses van weefselmonsters PCR-drempels vastgesteld voor PCV2- (Ct ≤ 22,4) en PCV3- (Ct ≤ 26,7) -diagnostiek.Deze bevindingen kunnen helpen de klinische betekenis van PCV-testresultaten in realtime te controleren en mogelijke ziekte bedreigingen te identificeren..

Inleiding

Varkenscircovirus type 2 (PCV2) veroorzaakt multisystemisch verwerpingssyndroom, terwijl type 3 (PCV3) geassocieerd wordt met reproductief falen en dermatitis en nephropathie.De bijbehorende ziekte (PCVAD) kost ongeveer $3-4 per varkenDe diagnose kan niet alleen gebaseerd zijn op PCR-positieve resultaten; het vereist een combinatie van lymfweefselletsel en klinische manifestaties (zoals gewichtsverlies),en virale lading (Ct-waarde) correleert met de ernst van de ziekteDeze studie onthult voor het eerst systematisch de langetermijntrends van de prevalentie van PCV2/3 in de Verenigde Staten en stelt een real-time monitoringraamwerk op basis van big data op.

Onderzoeksresultaten

1. PCR-resultaten van PCV2-gevallen in verschillende tijdperken

Zoals in figuur 1 wordt weergegeven, bleef het PCV2-positiviteitspercentage tussen 2002 en 2006 stijgen en bereikte het een piek van 75,28% in 2006.Het positieve percentage daalde sterk van 2007 tot 2011Het is dan licht teruggekomen van 2012 tot 2017 en daarna opnieuw aanzienlijk gestegen na 2018, om in 2023 41,39% te bereiken.

Figuur 2. Veranderingen in PCV3-PCR-testresultaten in de loop van de tijd, 2017-2023

(Groen: negatief; rood: positief; zwart gebroken lijn: positief tarief;

Paars: onbekend; geel: vermoed)

Conclusie: de PCV3-positiviteit is sinds 2016 blijven stijgen, met name in volwassen/zuigerijbedrijven.

3. PCR-testresultaten van PCV2- en PCV3-co-infectiegevallen in de loop der jaren

Figuur 3 toont aan dat sinds de invoering van PCV2/PCV3-multiplex-PCR-tests in veterinaire diagnostische laboratoria in 2018 het aantal gevallen met co-infectie is gestegen,van slechts 71 in 2017 tot 8De co-positiviteitsgraad voor PCV2 en PCV3 is ook gestegen van 14,81% in het voorjaar van 2018 tot 33,51% in het voorjaar van 2023.

Figuur 3. Aantal PCV2- en PCV3-gelijktijdig gedetecteerde gevallen en positieve percentages, 2017-2023

(groen: negatief; rood: positief; zwart gebroken lijn: positief percentage)

Conclusie: De invoering van multiplex-PCR-tests heeft het PCV2/PCV3-co-detectiegehalte aanzienlijk verhoogd, waarbij het hoogste percentage afkomstig is van verwerkte vloeistofmonsters.

4. Detectie in verschillende productiestadia

Figuur 4 toont aan dat het PCV2-positieve percentage hoger was in varkenshouderijen dan in varkenshouderijen, terwijl het tegenovergestelde geldt voor PCV3.het PCV3-positieve percentage in varkenshouderijen is consequent hoger dan in varkenshouderijen.

Figuur 4. Percentage van PCV2- en PCV3-positieve gevallen in afwerkings-/zaaihouderijen en in varkens die zijn gespeend om op de markt te worden gebracht (2017-2023)

(A: Percentage van de positieve gevallen in afwerkings-/zaaibedrijven; B: Percentage van de positieve gevallen bij varkens die zijn gespeend om op de markt te worden gebracht)

Conclusie: PCV2 komt vaker voor bij afwerkende varkens, terwijl PCV3 vaker voorkomt bij zeugens.

5. Voor PCV2 (A) en PCV3 (B) testen in de loop der jaren gebruikte steekproeftypen

Figuur 5 toont aan dat weefsels en organen (bv. longen, lymfeklieren, milt, enz.) de meest voorkomende monstersoorten zijn die worden getest op PCV2/3.het aandeel verwerkte vloeistofmonsters is sinds 2018 aanzienlijk toegenomenIn 2023 zal dit percentage 38% bedragen van alle PCV2-tests.

Figuur 5. Detectiepercentages van PCV2 en PCV3 in verschillende steekproeftypen

Conclusie: Bewerkte vloeistofmonsters worden steeds vaker gebruikt voor de opsporing van circovirussoorten 2 en 3 (PCV2/PCV3) bij varkens en zijn bijzonder geschikt voor gelijktijdige opsporing van beide virussen.

6. Correlatie tussen PCR-CT-waarden en ziekte-diagnose

Logistieke regressieanalyse toonde aan dat de Ct-cutoff voor PCV2-PCR-detectie 81,63% nauwkeurigheid en 81,15% gevoeligheid bereikte bij een Ct-cutoff van 22.4Voor PCV3-PCR-detectie kwam de Ct-cutoff van 26,7 overeen met een nauwkeurigheid van 70,69% en een gevoeligheid van 70,99%.

Figuur 6. PCV2- en PCV3-CT-waarden en diagnostische nauwkeurigheid en gevoeligheid

Conclusie: PCR-Ct-waarden kunnen worden gebruikt als referentie-indicator voor de klinische diagnose van circovirussoorten 2 en 3 (PCV2/PCV3) bij varkens.het is meer waarschijnlijk geassocieerd met een klinische ziekte.

Samenvatting

Op basis van gegevensanalyse van zes veterinaire diagnostische laboratoria in de Verenigde Staten werden significante verschillen in de resultaten van de detectie van PCV2/PCV3 waargenomen over tijdsperioden, productiefasen,en steekproeftypenDe PCV2-positiviteitscijfers daalden na de promotie van het vaccin, maar zijn de afgelopen jaren weer teruggekeerd.bij volwassen varkens en zeugens bijzonder vaak voorkomenDe introductie van multiplex-PCR-assays heeft de mate van co-detectie van PCV2/PCV3 aanzienlijk verhoogd, waarbij het gebruik van verwerkte vloeistofmonsters het meest voorkomt.PCR-Ct-waarden kunnen dienen als referentie-indicator voor de diagnose van de ziekte, om dierenartsen en producenten te helpen de gezondheid van varkens effectiever te controleren en te beheren.