новости компании о PLoS One | Эпидемиологические характеристики цирковирусов свиней типов 2 и 3, проанализированные по данным шести ветеринарных клиник США

В последние годы свиная циквирус (PCV) принесла значительные экономические потери для свиней во всем мире. Среди них циркирусные типы свиньи 2 (PCV2) и 3 (PCV3) являются двумя наиболее распространенными вирусами на фермах свиней, каждый из которых связан с различными симптомами заболевания свинья.

Чтобы дополнительно изучить его эпидемиологию и клинические характеристики, в этом исследовании использовались диагностические данные из шести ветеринарных диагностических лабораторий в Соединенных Штатах с 2002 по 2023 год, включая информацию о результатах ПЦР, типах выборки и групп свиней. Исследование проанализировало распространенность и клинические ассоциации цирковирусных типов свиньи 2 (PCV2) и 3 (PCV3).

Результаты показали, что распространенность PCV2 снизилась после введения вакцины в 2006 году, но восстановилась после 2018 года, особенно на размножении ферм. Распространенность PCV3 продолжает расти с момента своего первого отчета в 2016 году, пика в 2023 году и становясь более распространенной у взрослых свиней. Кроме того, анализ данных образца ткани установил пороги ПЦР для диагностики PCV2 (CT ≤ 22,4) и PCV3 (CT ≤ 26,7). Эти результаты могут помочь контролировать клиническую значимость теста PCV, результаты в реальном времени и выявить потенциальные угрозы заболевания.

Введение

Циквирусная свиная типа 2 (PCV2) вызывает мультисистемный источник синдрома, в то время как тип 3 (PCV3) связан с репродуктивной недостаточностью, дерматитом и нефропатией. Связанное заболевание (PCVAD) стоит приблизительно 3-4 долл. США на свинью. Диагноз не может быть основан исключительно на позитивности ПЦР; Это требует комбинации поражений лимфоидной ткани и клинических проявлений (таких как потеря веса), а вирусная нагрузка (значение КТ) коррелирует с тяжестью заболевания. Это исследование систематически выявляет долгосрочные тенденции распространенности PCV2/3 в Соединенных Штатах и ​​устанавливает структуру мониторинга в реальном времени на основе больших данных.

Результаты исследований

1. Результаты ПЦР случаев PCV2 в разные периоды времени

Как показано на рисунке 1, уровень позитивности PCV2 продолжал расти в период с 2002 по 2006 год, достигнув пика 75,28% в 2006 году. Однако после введения вакцины в 2006 году уровень позитива резко упал с 2007 по 2011 год, достигнув 27,24% в 2011 году. Затем он немного восстановился с 2012 по 2017 год, а затем в значительной степени выросла после 2018 года, достигнув 41.3 33 до 410 лет.

Чтобы дополнительно изучить его эпидемиологию и клинические характеристики, в этом исследовании использовались диагностические данные из шести ветеринарных диагностических лабораторий в Соединенных Штатах с 2002 по 2023 год, включая информацию о результатах ПЦР, типах выборки и групп свиней. Исследование проанализировало распространенность и клинические ассоциации цирковирусных типов свиньи 2 (PCV2) и 3 (PCV3).

Результаты показали, что распространенность PCV2 снизилась после введения вакцины в 2006 году, но восстановилась после 2018 года, особенно на размножении ферм. Распространенность PCV3 продолжает расти с момента своего первого отчета в 2016 году, пика в 2023 году и становясь более распространенной у взрослых свиней. Кроме того, анализ данных образца ткани установил пороги ПЦР для диагностики PCV2 (CT ≤ 22,4) и PCV3 (CT ≤ 26,7). Эти результаты могут помочь контролировать клиническую значимость теста PCV, результаты в реальном времени и выявить потенциальные угрозы заболевания.

Введение

Циквирусная свиная типа 2 (PCV2) вызывает мультисистемный источник синдрома, в то время как тип 3 (PCV3) связан с репродуктивной недостаточностью, дерматитом и нефропатией. Связанное заболевание (PCVAD) стоит приблизительно 3-4 долл. США на свинью. Диагноз не может быть основан исключительно на позитивности ПЦР; Это требует комбинации поражений лимфоидной ткани и клинических проявлений (таких как потеря веса), а вирусная нагрузка (значение КТ) коррелирует с тяжестью заболевания. Это исследование систематически выявляет долгосрочные тенденции распространенности PCV2/3 в Соединенных Штатах и ​​устанавливает структуру мониторинга в реальном времени на основе больших данных.

Результаты исследований

1. Результаты ПЦР случаев PCV2 в разные периоды времени

Как показано на рисунке 1, уровень позитивности PCV2 продолжал расти в период с 2002 по 2006 год, достигнув пика 75,28% в 2006 году. Однако после введения вакцины в 2006 году уровень позитива резко упал с 2007 по 2011 год, достигнув 27,24% в 2011 году. Затем он немного восстановился с 2012 по 2017 год, а затем в значительной степени выросла после 2018 года, достигнув 41.3 33 до 410 лет.

Рисунок 2. Изменения в результатах ПЦР-теста PCR3 с течением времени, 2017-2023 гг.

(Зеленый: отрицательный; красный: положительный; черная сломанная линия: положительная скорость;

Фиолетовый: неопределенный; Желтый: подозревается)

Вывод: PCV3 позитивность продолжает расти с 2016 года, особенно на фермах для взрослых/SOW.

3. Результаты тестирования ПЦР в случаях совместного инфекции PCV2 и PCV3 на протяжении многих лет

На рисунке 3 показано, что, поскольку внедрение мультиплексного ПЦР-тестирования PCV2/PCV3 в лабораториях ветеринарной диагностики в 2018 году увеличилось количество случаев с коинфекцией, с 71 в 2017 году до 8 817 в 2023 году (бухгалтерский учет почти 80% тестов PCV2 в этом году). Коэффициент совместной позитивности для PCV2 и PCV3 также увеличился с 14,81% весной 2018 года до 33,51% весной 2023 года.

Рисунок 3. Количество случаев совместного обнаружения PCV2 и PCV3, 2017-2023 гг.

(Зеленый: отрицательный; красный: положительный; черная сломанная линия: положительная скорость)

Вывод: введение мультиплексного ПЦР-тестирования значительно увеличило скорость совместного определения PCV2/PCV3, с обработанными образцами жидкости составляют самый высокий процент.

4. Обнаружение на разных стадиях производства

На рисунке 4 показано, что положительная скорость PCV2 была выше в растущих стадах свиней, чем на фермах SOW, в то время как обратное было верно для PCV3. Кроме того, с зимы 2019 года положительный показатель PCV3 в SOW Farms неизменно был выше, чем при растущих стадах свиней.

Рисунок 4. Процент положительных случаев PCV2 и PCV3 в отделке/SOW Farms и свиньи отлучения от отуда (2017-2023)

(A: Процент положительных случаев на фермах отделки/SOW; B: процент положительных случаев у свиней отлучения от отлучения)

Вывод: PCV2 чаще встречается у финишных свиней, а PCV3 более распространен в SOWS.

5. Типы выборки, используемые для тестирования PCV2 (A) и PCV3 (B) на протяжении многих лет

На рисунке 5 показано, что ткани и органы (например, легкие, лимфатические узлы, селезенка и т. Д.) являются наиболее распространенными типами образцов, протестированными для PCV2/3. Кроме того, доля обработанных образцов жидкости значительно увеличилась с 2018 года, что составляет 38% всех тестирования PCV2 в 2023 году.

Рисунок 5. Пропорции обнаружения PCV2 и PCV3 в разных типах выборки

Вывод: обработанные образцы жидкости все чаще используются для обнаружения типов цирковирусов свиной 2 и 3 (PCV2/PCV3) и особенно подходят для одновременного обнаружения обоих вирусов.

6. Корреляция между значениями ПЦР и диагнозом заболеваний

Анализ логистической регрессии показал, что отсечка КТ для обнаружения ПЦР PCV2 достигла точности на 81,63% и чувствительности 81,15% при сокращении КТ в 22,4; Для обнаружения ПЦР PCV3 отсечка КТ составила 26,7, соответствовала точке 70,69% и чувствительности 70,99%.

Рисунок 6. Значения PCV2 и PCV3 CT и точность и чувствительность диагностики

Вывод: значения ПЦР КТ могут использоваться в качестве эталонного индикатора для клинической диагностики циркирусных типов свиньи 2 и 3 (PCV2/PCV3). Когда значение КТ образца ниже отсечения, он, скорее всего, будет связан с клиническим заболеванием.

Краткое содержание

Основываясь на анализе данных из шести ветеринарных диагностических лабораторий в Соединенных Штатах, значительные различия в результатах обнаружения PCV2/PCV3 наблюдались в течение периодов времени, стадий производства и типов выборки. Уровень позитивности PCV2 снизился после продвижения вакцин, но в последние годы отскочил. Позитивные показатели PCV3 продолжают расти с 2016 года, становясь особенно распространенным у взрослых свиней и свиноходов. Внедрение мультиплексных анализов ПЦР значительно увеличило скорость совместного обнаружения PCV2/PCV3, при этом наиболее распространенным является использование обработанных образцов жидкости. Значения PCR CT могут служить эталонным индикатором для диагностики заболеваний, помогая ветеринарам и производителям более эффективно контролировать и управлять здоровьем свиней.