Ces dernières années, le circovirus porcin (PCV) a causé des pertes économiques importantes à l'industrie porcine dans le monde entier.les types de circovirus porcin 2 (PCV2) et 3 (PCV3) sont les deux virus les plus courants dans les élevages porcins, chacune associée à une variété de symptômes de la maladie des porcs.
Pour explorer davantage son épidémiologie et ses caractéristiques cliniques, cette étude a utilisé des données diagnostiques de six laboratoires de diagnostic vétérinaire aux États-Unis de 2002 à 2023,y compris les informations sur les résultats de la PCRL'étude a analysé la prévalence et les associations cliniques du circovirus porcin des types 2 (PCV2) et 3 (PCV3).
Les résultats ont montré que la prévalence du PCV2 a diminué après l'introduction du vaccin en 2006, mais a rebondi après 2018, en particulier dans les élevages.La prévalence du PCV3 a continué d'augmenter depuis son premier rapport en 2016.En outre, l'analyse des données d'échantillons de tissus a établi des seuils de PCR pour le diagnostic du PCV2 (Ct ≤ 22,4) et du PCV3 (Ct ≤ 26,7).Ces résultats peuvent aider à surveiller en temps réel la signification clinique des résultats des tests PCV et à identifier les menaces potentielles de maladie..
Introduction au projet
Le circovirus porcin de type 2 (PCV2) provoque un syndrome de dépérissement multisystémique, tandis que le type 3 (PCV3) est associé à une insuffisance reproductive et à une dermatite et une néphropathie.La maladie associée (PCVAD) coûte environ 3 à 4 dollars par porcLe diagnostic ne peut pas être basé uniquement sur la PCR positive; il nécessite une combinaison de lésions du tissu lymphoïde et de manifestations cliniques (telles que la perte de poids),et la charge virale (valeur Ct) sont en corrélation avec la gravité de la maladieCette étude révèle systématiquement les tendances à long terme de la prévalence du PCV2/3 aux États-Unis pour la première fois et établit un cadre de surveillance en temps réel basé sur de grandes quantités de données.
Résultats de la recherche
1Résultats PCR des cas de PCV2 à des périodes différentes
Comme le montre la figure 1, le taux de positivité au PCV2 a continué d'augmenter entre 2002 et 2006, atteignant un sommet de 75,28% en 2006.le taux de positivité a fortement diminué de 2007 à 2011Il a ensuite légèrement rebondi de 2012 à 2017, puis a de nouveau augmenté de manière significative après 2018, atteignant 41,39% en 2023.
Pour explorer davantage son épidémiologie et ses caractéristiques cliniques, cette étude a utilisé des données diagnostiques de six laboratoires de diagnostic vétérinaire aux États-Unis de 2002 à 2023,y compris les informations sur les résultats de la PCRL'étude a analysé la prévalence et les associations cliniques du circovirus porcin des types 2 (PCV2) et 3 (PCV3).
Les résultats ont montré que la prévalence du PCV2 a diminué après l'introduction du vaccin en 2006, mais a rebondi après 2018, en particulier dans les élevages.La prévalence du PCV3 a continué d'augmenter depuis son premier rapport en 2016.En outre, l'analyse des données d'échantillons de tissus a établi des seuils de PCR pour le diagnostic du PCV2 (Ct ≤ 22,4) et du PCV3 (Ct ≤ 26,7).Ces résultats peuvent aider à surveiller en temps réel la signification clinique des résultats des tests PCV et à identifier les menaces potentielles de maladie..
Introduction au projet
Le circovirus porcin de type 2 (PCV2) provoque un syndrome de dépérissement multisystémique, tandis que le type 3 (PCV3) est associé à une insuffisance reproductive et à une dermatite et une néphropathie.La maladie associée (PCVAD) coûte environ 3 à 4 dollars par porcLe diagnostic ne peut pas être basé uniquement sur la PCR positive; il nécessite une combinaison de lésions du tissu lymphoïde et de manifestations cliniques (telles que la perte de poids),et la charge virale (valeur Ct) sont en corrélation avec la gravité de la maladieCette étude révèle systématiquement les tendances à long terme de la prévalence du PCV2/3 aux États-Unis pour la première fois et établit un cadre de surveillance en temps réel basé sur de grandes quantités de données.
Résultats de la recherche
1Résultats PCR des cas de PCV2 à des périodes différentes
Comme le montre la figure 1, le taux de positivité au PCV2 a continué d'augmenter entre 2002 et 2006, atteignant un sommet de 75,28% en 2006.le taux de positivité a fortement diminué de 2007 à 2011Il a ensuite légèrement rebondi de 2012 à 2017, puis a de nouveau augmenté de manière significative après 2018, atteignant 41,39% en 2023.
Figure 2. Changements dans les résultats des tests PCR PCV3 au fil du temps, 2017-2023
(vert: négatif; rouge: positif; ligne noire brisée: taux positif;
Pourpre: indéterminé; Jaune: suspecté)
Conclusion: la positivité au PCV3 a continué d'augmenter depuis 2016, en particulier dans les exploitations d'adultes et de porcs.
3. Résultats des tests PCR des cas de co-infection PCV2 et PCV3 au fil des ans
La figure 3 montre que depuis l'introduction du test PCR multiplex PCV2/PCV3 dans les laboratoires de diagnostic vétérinaire en 2018, le nombre de cas de co-infection a augmenté de façon spectaculaire,de seulement 71 en 2017 à 8Le taux de co-positivité au PCV2 et au PCV3 est également passé de 14,81% au printemps 2018 à 33,51% au printemps 2023.
Graphique 3. Nombre de cas de co-détection du PCV2 et du PCV3 et taux de positivité, 2017-2023
(vert: négatif; rouge: positif; ligne noire brisée: taux positif)
Conclusion: l'introduction de tests PCR multiplexes a considérablement augmenté le taux de co-détection du PCV2/PCV3, les échantillons de liquide traité représentant le pourcentage le plus élevé.
4Détection à différents stades de production
La figure 4 montre que le taux de positivité au PCV2 était plus élevé dans les troupeaux de porcs en culture que dans les fermes de truies, tandis que l'inverse était vrai pour le PCV3.le taux de positivité au PCV3 dans les fermes de truies a toujours été plus élevé que dans les troupeaux de porcs en croissance.
Graphique 4. Pourcentage de cas positifs de PCV2 et de PCV3 dans les exploitations de finition/semis et les porcs sevrés pour être commercialisés (2017-2023)
(A: Pourcentage de cas positifs dans les exploitations de finition/semis; B: Pourcentage de cas positifs chez les porcs sevrés)
Conclusion: le PCV2 est plus fréquent chez les porcs finissants, tandis que le PCV3 est plus répandu chez les truies.
5. Types d'échantillons utilisés pour les tests PCV2 (A) et PCV3 (B) au fil des ans
La figure 5 montre que les tissus et les organes (p. ex. poumons, ganglions lymphatiques, rate, etc.) sont les types d'échantillons les plus couramment testés pour le PCV2/3.la proportion d'échantillons de fluides transformés a considérablement augmenté depuis 2018, représentant 38% de l'ensemble des tests PCV2 en 2023.
Figure 5. Proportions de détection de PCV2 et PCV3 dans différents types d'échantillons
Conclusion: Les échantillons de liquide traité sont de plus en plus utilisés pour détecter les circovirus porcs de type 2 et 3 (PCV2/PCV3) et conviennent particulièrement à la détection simultanée des deux virus.
6Corrélation entre les valeurs de TC PCR et le diagnostic de la maladie
L'analyse de régression logistique a révélé que le seuil de Ct pour la détection PCR du PCV2 atteignait 81,63% de précision et 81,15% de sensibilité à un seuil de Ct de 22.4Pour la détection par PCR du PCV3, la limite de Ct de 26,7 correspond à une précision de 70,69% et une sensibilité de 70,99%.
Figure 6. Valeur de la CT du PCV2 et du PCV3 et précision et sensibilité du diagnostic
Conclusion: les valeurs de Ct de la PCR peuvent être utilisées comme indicateur de référence pour le diagnostic clinique du circovirus porcin des types 2 et 3 (PCV2/PCV3).il est plus probable qu'il soit associé à une maladie clinique.
Résumé
Sur la base de l' analyse des données provenant de six laboratoires de diagnostic vétérinaire aux États-Unis, des différences significatives dans les résultats de détection du PCV2/PCV3 ont été observées selon les périodes, les stades de production,et types d'échantillonsLes taux de positivité au PCV2 ont diminué après la promotion du vaccin, mais ont rebondi ces dernières années.devenant particulièrement fréquent chez les porcs et les truies adultesL'introduction d'essais PCR multiples a considérablement augmenté le taux de co-détection du PCV2/PCV3, l'utilisation d'échantillons de liquide traité étant la plus courante.Les valeurs Ct de la PCR peuvent servir d'indicateur de référence pour le diagnostic de la maladie, aider les vétérinaires et les producteurs à mieux surveiller et gérer la santé des porcs.
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