W ostatnich latach cyrkowirus świń (PCV) spowodował znaczne straty ekonomiczne dla światowego przemysłu trzodziarskiego. Wśród nich, cyrkowirus świń typu 2 (PCV2) i 3 (PCV3) to dwa najczęstsze wirusy na fermach świń, z których każdy wiąże się z różnymi objawami chorób świń.
Aby dalej zbadać jego epidemiologię i cechy kliniczne, w tym badaniu wykorzystano dane diagnostyczne z sześciu laboratoriów diagnostyki weterynaryjnej w Stanach Zjednoczonych w latach 2002-2023, w tym informacje o wynikach PCR, typach próbek i grupach wiekowych świń. W badaniu przeanalizowano częstość występowania i powiązania kliniczne cyrkowirusów świń typu 2 (PCV2) i 3 (PCV3).
Wyniki wykazały, że częstość występowania PCV2 spadła po wprowadzeniu szczepionki w 2006 r., ale odbiła się po 2018 r., szczególnie na fermach hodowlanych. Częstość występowania PCV3 nadal rosła od czasu pierwszego zgłoszenia w 2016 r., osiągając szczyt w 2023 r. i stając się bardziej powszechna u dorosłych świń. Ponadto analiza danych z próbek tkankowych ustaliła progi PCR dla diagnostyki PCV2 (Ct ≤ 22,4) i PCV3 (Ct ≤ 26,7). Ustalenia te mogą pomóc w monitorowaniu klinicznego znaczenia wyników testów PCV w czasie rzeczywistym i identyfikowaniu potencjalnych zagrożeń chorobowych.
Wprowadzenie
Cyrkowirus świń typu 2 (PCV2) powoduje wieloukładowy zespół wyniszczenia, podczas gdy typ 3 (PCV3) jest związany z niepowodzeniami reprodukcyjnymi oraz zapaleniem skóry i nefropatią. Powiązana choroba (PCVAD) kosztuje około 3-4 dolary na świnię. Diagnoza nie może opierać się wyłącznie na pozytywnym wyniku PCR; wymaga połączenia zmian w tkance limfoidalnej i objawów klinicznych (takich jak utrata masy ciała), a obciążenie wirusem (wartość Ct) koreluje z nasileniem choroby. Niniejsze badanie po raz pierwszy systematycznie ujawnia długoterminowe trendy występowania PCV2/3 w Stanach Zjednoczonych i ustanawia ramy monitorowania w czasie rzeczywistym oparte na dużych zbiorach danych.
Wyniki badań
1. Wyniki PCR dla przypadków PCV2 w różnych okresach
Jak pokazano na rysunku 1, wskaźnik pozytywności PCV2 stale rósł w latach 2002-2006, osiągając szczyt 75,28% w 2006 r. Jednak po wprowadzeniu szczepionki w 2006 r. wskaźnik pozytywności gwałtownie spadł w latach 2007-2011, osiągając 27,24% w 2011 r. Następnie nieznacznie odbił się w latach 2012-2017, a następnie ponownie znacznie wzrósł po 2018 r., osiągając 41,39% w 2023 r.
Aby dalej zbadać jego epidemiologię i cechy kliniczne, w tym badaniu wykorzystano dane diagnostyczne z sześciu laboratoriów diagnostyki weterynaryjnej w Stanach Zjednoczonych w latach 2002-2023, w tym informacje o wynikach PCR, typach próbek i grupach wiekowych świń. W badaniu przeanalizowano częstość występowania i powiązania kliniczne cyrkowirusów świń typu 2 (PCV2) i 3 (PCV3).
Wyniki wykazały, że częstość występowania PCV2 spadła po wprowadzeniu szczepionki w 2006 r., ale odbiła się po 2018 r., szczególnie na fermach hodowlanych. Częstość występowania PCV3 nadal rosła od czasu pierwszego zgłoszenia w 2016 r., osiągając szczyt w 2023 r. i stając się bardziej powszechna u dorosłych świń. Ponadto analiza danych z próbek tkankowych ustaliła progi PCR dla diagnostyki PCV2 (Ct ≤ 22,4) i PCV3 (Ct ≤ 26,7). Ustalenia te mogą pomóc w monitorowaniu klinicznego znaczenia wyników testów PCV w czasie rzeczywistym i identyfikowaniu potencjalnych zagrożeń chorobowych.
Wprowadzenie
Cyrkowirus świń typu 2 (PCV2) powoduje wieloukładowy zespół wyniszczenia, podczas gdy typ 3 (PCV3) jest związany z niepowodzeniami reprodukcyjnymi oraz zapaleniem skóry i nefropatią. Powiązana choroba (PCVAD) kosztuje około 3-4 dolary na świnię. Diagnoza nie może opierać się wyłącznie na pozytywnym wyniku PCR; wymaga połączenia zmian w tkance limfoidalnej i objawów klinicznych (takich jak utrata masy ciała), a obciążenie wirusem (wartość Ct) koreluje z nasileniem choroby. Niniejsze badanie po raz pierwszy systematycznie ujawnia długoterminowe trendy występowania PCV2/3 w Stanach Zjednoczonych i ustanawia ramy monitorowania w czasie rzeczywistym oparte na dużych zbiorach danych.
Wyniki badań
1. Wyniki PCR dla przypadków PCV2 w różnych okresach
Jak pokazano na rysunku 1, wskaźnik pozytywności PCV2 stale rósł w latach 2002-2006, osiągając szczyt 75,28% w 2006 r. Jednak po wprowadzeniu szczepionki w 2006 r. wskaźnik pozytywności gwałtownie spadł w latach 2007-2011, osiągając 27,24% w 2011 r. Następnie nieznacznie odbił się w latach 2012-2017, a następnie ponownie znacznie wzrósł po 2018 r., osiągając 41,39% w 2023 r.
Rysunek 2. Zmiany w wynikach testów PCR na PCV3 w czasie, 2017-2023
(Zielony: Negatywny; Czerwony: Pozytywny; Czarna linia przerywana: Wskaźnik pozytywności;
Fioletowy: Nieokreślony; Żółty: Podejrzany)
Wniosek: Pozytywność PCV3 nadal rośnie od 2016 r., szczególnie na fermach dorosłych/macior.
3. Wyniki testów PCR na przypadki koinfekcji PCV2 i PCV3 na przestrzeni lat
Rysunek 3 pokazuje, że od czasu wprowadzenia testów PCR multipleks PCV2/PCV3 w laboratoriach diagnostyki weterynaryjnej w 2018 r. liczba przypadków koinfekcji wzrosła gwałtownie, z zaledwie 71 w 2017 r. do 8817 w 2023 r. (stanowiąc prawie 80% testów PCV2 w tym roku). Wskaźnik współpozytywności dla PCV2 i PCV3 wzrósł również z 14,81% wiosną 2018 r. do 33,51% wiosną 2023 r.
Rysunek 3. Liczba przypadków współwykrywania PCV2 i PCV3 oraz wskaźniki pozytywności, 2017-2023
(Zielony: Negatywny; Czerwony: Pozytywny; Czarna linia przerywana: Wskaźnik pozytywności)
Wniosek: Wprowadzenie testów PCR multipleks znacznie zwiększyło wskaźnik współwykrywania PCV2/PCV3, przy czym próbki płynów przetworzonych stanowią najwyższy odsetek.
4. Wykrywanie na różnych etapach produkcji
Rysunek 4 pokazuje, że wskaźnik pozytywności PCV2 był wyższy w stadach rosnących świń niż na fermach macior, podczas gdy odwrotnie było w przypadku PCV3. Ponadto, od zimy 2019 r. wskaźnik pozytywności PCV3 na fermach macior konsekwentnie był wyższy niż w stadach rosnących świń.
Rysunek 4. Odsetek przypadków pozytywnych na PCV2 i PCV3 na fermach tuczu/macior i świń od odsadzenia do sprzedaży (2017-2023)
(A: Odsetek przypadków pozytywnych na fermach tuczu/macior; B: Odsetek przypadków pozytywnych u świń od odsadzenia do sprzedaży)
Wniosek: PCV2 jest bardziej powszechne u świń tucznych, podczas gdy PCV3 jest bardziej rozpowszechnione u macior.
5. Rodzaje próbek używanych do testowania PCV2 (A) i PCV3 (B) na przestrzeni lat
Rysunek 5 pokazuje, że tkanki i narządy (np. płuca, węzły chłonne, śledziona itp.) są najczęstszymi rodzajami próbek testowanych na PCV2/3. Ponadto odsetek próbek płynów przetworzonych znacznie wzrósł od 2018 r., stanowiąc 38% wszystkich testów PCV2 w 2023 r.
Rysunek 5. Proporcje wykrywania PCV2 i PCV3 w różnych typach próbek
Wniosek: Próbki płynów przetworzonych są coraz częściej wykorzystywane do wykrywania cyrkowirusów świń typu 2 i 3 (PCV2/PCV3) i są szczególnie odpowiednie do jednoczesnego wykrywania obu wirusów.
6. Korelacja między wartościami Ct PCR a diagnozą choroby
Analiza regresji logistycznej wykazała, że graniczna wartość Ct dla wykrywania PCV2 PCR osiągnęła 81,63% dokładności i 81,15% czułości przy granicznej wartości Ct 22,4; dla wykrywania PCV3 PCR graniczna wartość Ct 26,7 odpowiadała 70,69% dokładności i 70,99% czułości.
Rysunek 6. Wartości Ct PCV2 i PCV3 oraz dokładność i czułość diagnostyczna
Wniosek: Wartości Ct PCR mogą być wykorzystywane jako wskaźnik referencyjny dla klinicznej diagnozy cyrkowirusów świń typu 2 i 3 (PCV2/PCV3). Gdy wartość Ct próbki jest poniżej wartości granicznej, bardziej prawdopodobne jest, że jest ona związana z chorobą kliniczną.
Podsumowanie
Na podstawie analizy danych z sześciu laboratoriów diagnostyki weterynaryjnej w Stanach Zjednoczonych zaobserwowano znaczne różnice w wynikach wykrywania PCV2/PCV3 w różnych okresach, etapach produkcji i typach próbek. Wskaźniki pozytywności PCV2 spadły po promocji szczepionki, ale w ostatnich latach odbiły się. Wskaźniki pozytywności PCV3 nadal rosły od 2016 r., stając się szczególnie powszechne u dorosłych świń i macior. Wprowadzenie testów PCR multipleks znacznie zwiększyło wskaźnik współwykrywania PCV2/PCV3, przy czym najczęściej stosowano próbki płynów przetworzonych. Wartości Ct PCR mogą służyć jako wskaźnik referencyjny dla diagnozy choroby, pomagając lekarzom weterynarii i producentom skuteczniej monitorować i zarządzać zdrowiem świń.
Twoja wiadomość musi mieć od 20 do 3000 znaków!