nouvelles de l'entreprise Une équipe du Sichuan a découvert une nouvelle souche recombinante du virus PRRSV hautement pathogène : Recombinaison du vaccin et du type sauvage

Le 2 juillet 2025, une équipe dirigée par Zhang Zhidong et Zhou Long du Collège des sciences animales et de médecine vétérinaire de l'Université du Sud-Ouest pour les nationalités, en collaboration avec l'Académie des sciences animales du Sichuan, a publié ses dernières recherches dans la revue internationale *Frontiers in Veterinary Science*, rapportant une nouvelle souche du virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP), nommée GX2024, résultant d'une hybridation d'un virus de type sauvage et d'un vaccin vivant modifié (VLM). Cette souche a été isolée d'une ferme porcine dans la province du Sichuan, en Chine, et a présenté une pathogénicité extrêmement élevée (mortalité de 100 %) chez les porcelets.

Points forts de la recherche

• Première découverte des caractéristiques hautement virulentes de la souche recombinante SRRP de type L1C.5 RFLP-1-4-4 en Chine

• Cette souche a été recombinée à partir de trois sources : une souche de type sauvage NADC30-like (L1C.5) + une souche hautement pathogène JXA1-like (L8E) + une souche de vaccin vivant commercial RespPRRS VLM (L5A)

• L'infection des porcelets a provoqué une forte fièvre (40–42°C), de graves hémorragies pulmonaires et des œdèmes, et tous les porcelets sont morts en moins de 14 jours.

• Cela démontre que les vaccins VLM actuels posent un risque de recombinaison et d'échappement immunitaire dans les zones endémiques de type sauvage.

En 2024, une équipe de recherche a découvert des avortements et des mortinaissances chez les truies et une mortalité aiguë chez les porcelets dans une ferme porcine du Sichuan. L'isolement cellulaire et l'analyse du séquençage du génome entier ont confirmé que la nouvelle souche GX2024 appartient au type L1C.5 de la lignée SRRP-2.

Une analyse génétique plus approfondie a révélé que cette souche est un nouveau virus recombinant multiplex, co-recombiné à partir d'une souche de type sauvage NADC30-like, d'une souche hautement pathogène JXA1-like et d'une souche de vaccin vivant modifié (VLM).

Des expériences de provocation chez l'animal ont montré que le GX2024 est hautement pathogène ; les porcelets infectés sont morts en peu de temps, présentant une pneumonie hémorragique sévère et un œdème pulmonaire, des ganglions lymphatiques significativement hypertrophiés et hémorragiques, une augmentation rapide de la charge virale et une augmentation significative des taux d'anticorps sériques.

Introduction

Le syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP) est l'une des maladies virales les plus destructrices de l'industrie porcine mondiale. Ces dernières années, la souche NADC30-like (L1C) est progressivement devenue la souche dominante en circulation dans les élevages porcins chinois, tandis que l'émergence du type RFLP 1–4-4 a attiré l'attention mondiale.

En raison de la coexistence de différentes lignées de souches et de vaccins vivants, les événements de recombinaison génétique du SRRP sont fréquents, ce qui entraîne des mutations virales complexes et des difficultés de contrôle vaccinal.

Résultats de la recherche

1. Isolement et identification de la nouvelle souche GX2024 :

· Des tissus pulmonaires de porcelets présentant de graves symptômes respiratoires ont été prélevés dans une ferme porcine du Sichuan qui avait été vaccinée avec le vaccin RespPRRS VLM. La souche SRRP GX2024 a été isolée à l'aide de cellules Marc-145 et de macrophages alvéolaires porcins (iPAM), avec un génome complet de 15018 nt (numéro d'accès GenBank : PV362838).

Figure 1. Isolement du virus SRRP GX2024

(a) Les cellules iPAM et Marc-145 ont été inoculées avec le SRRP GX2024 et détectées 60 heures après l'infection ; (b) Le test de plaque de l'isolat GX2024 a été effectué à l'aide de cellules iPAM avec une dilution de 10⁻¹⁰ de la solution mère du virus ; (c) Les cellules iPAM et Marc-145 ont été infectées avec une culture virale de sixième génération pendant 48 heures, et l'IFA a été réalisée à l'aide d'un anticorps monoclonal anti-N SRRP. Les noyaux cellulaires ont été colorés avec DAPI. Barre d'échelle = 75 μm.

• Le gène NSP2 de cette souche présente une délétion discontinue de 131 acides aminés, compatible avec la souche NADC30 (111 aa supprimés aux positions 322-432, 1 aa supprimé à la position 483 et 19 aa supprimés aux positions 504-522), et la protéine GP5 présente des mutations uniques d'acides aminés (P¹⁵→L¹⁵, F²³→S²³, etc.), qui sont significativement différentes des souches L1C au pays et à l'étranger.

Figure 2. Alignement multiple des séquences d'acides aminés de NSP2 et GP5

(a) Trois délétions discontinues (régions bleues) existent aux positions des acides aminés 322–432, 483 et 504–522 dans NSP2 des souches GX2024 et NADC30-like. Les régions rouge clair indiquent les délétions d'acides aminés dans le virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin hautement pathogène (HP-SRRP, souche JXA1-like). (b) Alignement multiple des séquences d'acides aminés GP5 de la souche GX2024 et de 17 souches de référence SRRP L1C de Chine et des États-Unis. Les boîtes violettes indiquent les régions du peptide signal, les boîtes rouges indiquent les régions hypervariables (HVR1 et 2) et les boîtes jaunes indiquent les domaines transmembranaires (TM1, 2 et 3).

2. L'analyse de la recombinaison génomique confirme une origine de triple recombinaison :

L'analyse à l'aide des logiciels RDP4 et SimPlot a révélé cinq points de rupture de recombinaison dans le génome GX2024, situés dans les régions ORF1a, ORF1b, ORF3 et ORF4 :

· Les régions ORF1a (1-1868nt) et ORF1b (3565-9392nt) ont montré la plus grande homologie avec la souche JXA1-like (L8E) ;

· La région ORF3 (12688-13172nt) a montré une homologie de 90,1 % avec la souche de vaccin RespPRRS VLM, supérieure à celle de sa souche parentale VR-2332 ;

· Les régions restantes (1869-3564nt, 9393-12687nt, etc.) étaient hautement homologues à la souche NADC30-like (L1C.5), confirmant qu'il s'agit d'une souche à triple recombinaison.

Tableau 1. Comparaison de l'identité nucléotidique entre GX2024 et 11 souches de référence SRRP

Tableau 2. Informations sur l'événement de recombinaison détecté dans GX2024

Figure 3. Analyse de la recombinaison génomique de l'isolat GX2024

3. Expérience de pathogénicité : une létalité de 100 % souligne le risque élevé

Une expérience de provocation a été menée sur 9 porcelets de quatre semaines sans anticorps SRRP (5 provoqués, 4 témoins) :

· Les porcelets provoqués ont développé une forte fièvre supérieure à 40℃ le jour 3, et des symptômes tels qu'une détresse respiratoire, une ataxie et une diarrhée sont apparus les jours 4 à 14. Tous les porcelets sont morts en moins de 14 jours (taux de mortalité de 100 %) ; le groupe témoin n'a montré aucune anomalie.

Figure 4. Analyse de la pathogénicité de l'isolat SRRP GX2024 chez les porcelets

(a) Conception expérimentale animale de cette étude. (b) Température rectale des porcelets inoculés avec GX2024 et non infectés avec le milieu RPMI-1640. La valeur seuil de la fièvre clinique a été fixée à 40,0℃. (c) Scores des symptômes cliniques les jours 3, 7, 10 et 14 au cours de l'expérience de provocation. Les scores comprenaient les symptômes cliniques, les symptômes respiratoires et les symptômes neurologiques. (d) Courbes de survie et de mortalité des porcelets inoculés. (e) Gain de poids hebdomadaire moyen des porcelets inoculés au cours de l'expérience de provocation.

L'examen pathologique a montré une consolidation sévère, un œdème et une hémorragie dans le tissu pulmonaire des porcelets provoqués, un épaississement des septa alvéolaires, une nécrose des cellules épithéliales, des limites floues entre le cortex et la médulla des ganglions lymphatiques, une diminution des lymphocytes et une hémorragie ; l'immunohistochimie a confirmé la présence de grandes quantités d'antigène SRRP dans les poumons et les ganglions lymphatiques.

Figure 5. Observation des lésions pulmonaires et ganglionnaires chez les porcelets inoculés

• La détection de la charge virale a montré que la charge virale sérique a atteint son pic 7 jours après la provocation, et la charge virale dans le tissu pulmonaire était significativement plus élevée que dans les autres tissus. De plus, tous les porcelets provoqués ont produit des anticorps spécifiques au SRRP dans les 7 jours (S/P>0,4).

Figure 6. Charge virale dans le sérum et les tissus et détection des anticorps spécifiques au virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP)

Résumé

Cette étude rapporte pour la première fois une souche SRRP L1C.5 RFLP-1-4-4 hautement pathogène recombinée à partir d'une souche de type sauvage et d'une souche vaccinale, qui est extrêmement mortelle pour les porcelets. L'émergence de cette souche pose un sérieux défi aux stratégies actuelles de contrôle vaccinal du SRRP, soulignant la nécessité de renforcer la surveillance des virus, d'optimiser la conception des vaccins et de mettre l'accent sur la biosécurité et les mesures intégrées de prévention et de contrôle.