কোম্পানির খবর চীনের একটি নতুন L1A/C RFLP 1-3-4 শূকর প্রজনন ও শ্বাসতন্ত্রীয় রোগ সৃষ্টিকারী ভাইরাস (porcine reproductive and respiratory syndrome virus) সনাক্ত করা হয়েছে, যা মারাত্মক রোগ সৃষ্টি করছে।

শুয়োরের প্রজনন ও শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম (পিআরআরএস), যা পিআরআরএস ভাইরাস দ্বারা সৃষ্ট, বিশ্বব্যাপী সবচেয়ে ধ্বংসাত্মক শূকর রোগগুলির মধ্যে একটি। সাম্প্রতিক বছরগুলোতে, ১ নং বংশের একাধিক স্ট্রেইন মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে ব্যাপকভাবে প্রচলিত ছিল, যেখানে L1 RFLP 1-3-4 স্ট্রেইনগুলি চীনে কম রিপোর্ট করা হয়েছে।

সম্প্রতি, তিয়ানজিন কৃষি বিশ্ববিদ্যালয় এবং তিয়ানজিন ঐতিহ্যবাহী চীনা মেডিসিন বিশ্ববিদ্যালয়ের গবেষকরা যৌথভাবে এলসেভিয়ারে একটি গবেষণাপত্র প্রকাশ করেছেন, যেখানে L1A/C RFLP 1–3–4 প্যাটার্নযুক্ত একটি পুনর্মিলনযোগ্য PRRSV ভেরিয়েন্ট নিয়ে আলোচনা করা হয়েছে এবং এর জিনোম বিশ্লেষণ করা হয়েছে।

ভূমিকা

শুয়োরের প্রজনন ও শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম (পিআরআরএস) একটি গুরুতর সংক্রামক রোগ যা পিআরআরএস ভাইরাস দ্বারা সৃষ্ট। এটিকে প্রধানত দুটি প্রকারে ভাগ করা হয়, ইউরোপীয় এবং উত্তর আমেরিকান প্রকার। PRRSV-2 এর জিনগত বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ করতে RFLP এবং বংশ শ্রেণীবিন্যাস পদ্ধতি সাধারণত ব্যবহৃত হয়। ১ নং বংশ (L1) মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে প্রচলিত, যেখানে সাধারণ RFLP প্যাটার্নগুলি হল 1-3-4, 1-4-4, এবং 1-7-4। চীনে, 1-4-4 L1C স্ট্রেইন প্রধান, তবে এর অনুপাত বার্ষিক হ্রাস পাচ্ছে। যদিও কম রিপোর্ট করা হয়, 1-3-4 এর অন্ত্রে উপনিবেশ স্থাপনের অনন্য বৈশিষ্ট্য রয়েছে এবং এটি একটি নতুন প্রভাবশালী স্ট্রেইন হয়ে উঠতে পারে, যা শূকর শিল্পের জন্য গুরুতর হুমকি সৃষ্টি করে।

গবেষণার ফলাফল

১. তিয়ানজিন শূকর খামার থেকে ডায়রিয়ায় আক্রান্ত শূকরছানাদের থেকে L1 PRRSV-এর পৃথকীকরণ

মে থেকে জুন ২০২৪ পর্যন্ত, গুরুতর ডায়রিয়ার পরে তিনটি তিয়ানজিন শূকর খামারের দুধ ছাড়ানো শূকরছানা থেকে সিরামের নমুনা সংগ্রহ করা হয়েছিল। PAM সেল পৃথকীকরণ ব্যবহার করে সিরামের নমুনাগুলি L1 PRRSV-এর জন্য পজিটিভ ছিল এবং বেশ কয়েকটি সাধারণ শূকর ভাইরাসের জন্য নেগেটিভ ছিল। আইসোলেটগুলি সাধারণ সেল একত্রীকরণ এবং খণ্ডতা প্রদর্শন করে এবং সেগুলিকে বিশুদ্ধ করে TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406 নামে নামকরণ করা হয়। ইমিউনোফ্লোরসেন্স বিশ্লেষণ সবুজ প্রতিপ্রভা প্রকাশ করেছে, যার TCID₅₀ মান ছিল যথাক্রমে 1×10^6.34, 1×10^6.25, এবং 3×10^5.0/0.1 mL।

চিত্র ১. PRRSV স্ট্রেইন TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর পৃথকীকরণ এবং সনাক্তকরণ

(A-D) সংক্রমণের ৪৮ ঘণ্টা পর। (E-H) অ্যান্টি-N প্রোটিন অ্যান্টিবডি দিয়ে চিহ্নিত। স্কেল বার, ১০০ μm।

উপসংহার: শুয়োরের প্রজনন ও সংক্রামক সিন্ড্রোম ভাইরাস (PRRSV) L1 সফলভাবে তিয়ানজিনে মে থেকে জুন ২০২৪ এর মধ্যে গুরুতর ডায়রিয়ায় আক্রান্ত দুধ ছাড়ানো শূকরছানার নমুনা থেকে পৃথক করা হয়েছিল। সাইটোপ্যাথিক প্রভাব এবং ইমিউনোফ্লোরসেন্স পরীক্ষার মাধ্যমে এর উচ্চ ক্ষতিকারক ক্ষমতা নিশ্চিত করা হয়েছিল।

২. পৃথকীকৃত PRRSV L1 স্ট্রেইনগুলির জিনগত বৈশিষ্ট্য এবং উপপ্রকার বিশ্লেষণ

আইসোলেট TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর সম্পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের জিনোম সিকোয়েন্সিং L1 (NADC30-এর মতো) উপপ্রকারের সাথে সঙ্গতিপূর্ণ NSP2-তে একটি বিলোপ প্যাটার্ন প্রকাশ করেছে। সম্পূর্ণ-জিনোম ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ L1.8 উপগোষ্ঠীর সাথে ঘনিষ্ঠ সম্পর্ক প্রকাশ করেছে। ORF5 জিনের RFLP বিশ্লেষণ TJ2401-কে L1A উপপ্রকারে এবং TJ2402 ও TJ2406-কে L1C উপপ্রকারে নির্ধারণ করেছে।

চিত্র ২. TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর NSP2 সিকোয়েন্স এবং ফাইলোজেনেটিক ট্রি

(A) TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর NSP2 বিলোপ প্যাটার্ন NADC30-এর মতোই।

(B) তিনটি আইসোলেট L1.8 (NADC30-এর মতো) PRRSV-এর সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত।

(C) TJ2401 L1A-এর অন্তর্গত, যেখানে TJ2402 এবং TJ2406 L1C-এর অন্তর্গত।

উপসংহার: তিনটি আইসোলেট, TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406, যথাক্রমে L1A এবং L1C উপপ্রকারের অন্তর্গত L1 (NADC30-এর মতো) PRRSV।

৩. পৃথকীকৃত PRRSV স্ট্রেইনগুলির মূল জিন সেগমেন্টগুলির পুনর্মিলন বৈশিষ্ট্য এবং বিশ্লেষণ

পুনর্মিলন বিশ্লেষণ প্রকাশ করেছে যে TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর সবকটিতেই পুনর্মিলন বৈশিষ্ট্য বিদ্যমান। TJ2401 এবং TJ2402 L8 (JXA1-এর মতো) ভাইরাস থেকে একটি সাধারণ জিন সেগমেন্ট (1-1970 nt) ভাগ করে, যা সম্ভবত তাদের অনুরূপ ক্লিনিকাল রোগ সৃষ্টিকারী ক্ষমতাতে অবদান রাখে। অন্যদিকে, TJ2406 মূলত NADC30 স্ট্রেনের সাথে সমরূপ ছিল এবং এতে সীমিত পুনর্মিলন সেগমেন্ট ছিল।

চিত্র ৩. প্রতিনিধি PRRSV জিনোমগুলির উপর ভিত্তি করে নির্মিত ফাইলোজেনেটিক ট্রি

উপসংহার: তিনটি PRRSV আইসোলেটই পুনর্মিলনযোগ্য স্ট্রেইন। TJ2401 এবং TJ2402 L8 সেগমেন্টটি ভাগ করে, যার ফলে সম্ভবত একই রকম ক্লিনিকাল রোগ সৃষ্টিকারী ক্ষমতা দেখা যায়।

৪. শূকরছানাদের মধ্যে তিনটি আইসোলেটের ক্লিনিকাল লক্ষণ এবং ভাইরাল গতিবিদ্যার বিশ্লেষণ

TJ2401, TJ2402, বা TJ2406 দিয়ে টিকা দেওয়া শূকরছানাদের শরীরে তাপমাত্রা বৃদ্ধি, গুরুতর ডায়রিয়া, ক্লিনিকাল লক্ষণের স্কোর বৃদ্ধি, দৈনিক ওজন হ্রাস এবং ১১তম দিনে সেরোকনভার্সন দেখা গেছে। সিরাম এবং মলদ্বারের সোয়াবের ভাইরাল লোড উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি পেয়েছিল, যেখানে নিয়ন্ত্রণ গ্রুপে কোনো উপসর্গ বা ইতিবাচক ভাইরাল পরীক্ষা দেখা যায়নি।

চিত্র ৪. শূকরছানাদের ক্লিনিকাল সূচক এবং ভাইরোলজিক্যাল ও ইমিউনোলজিক্যাল পরীক্ষার ফলাফল

(A) TJ2401, TJ2402, বা TJ2406 দিয়ে টিকা দেওয়া শূকরছানাদের সকলেরই শরীরের তাপমাত্রা বৃদ্ধি পেয়েছিল।

(B) শূকরছানাদের দৈনিক ওজন বৃদ্ধি উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছিল।

(C) সংক্রমণের ১১তম দিনে, শূকরছানারা PRRS অ্যান্টিবডিগুলির সেরোকনভার্সন অর্জন করে (থ্রেশহোল্ড ০.৪)।

(D) সংক্রমণের ৫ দিন পর সিরাম ভাইরাল লোড বৃদ্ধি পায় এবং ১১তম দিনে শীর্ষে পৌঁছায়।

(E) মলদ্বারের সোয়াবের ভাইরাল লোড সিরাম ভাইরাল লোডের সাথে সঙ্গতিপূর্ণ ছিল।

(F) ভাইরাস একাধিক টিস্যুতে উপস্থিত ছিল, যার মধ্যে অন্ত্র ছিল প্রধান।

উপসংহার: TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406-এর সবকটিই শূকরছানাদের মধ্যে উল্লেখযোগ্য ক্লিনিকাল লক্ষণ এবং ভাইরাল সংক্রমণ ঘটিয়েছিল, যেখানে নিয়ন্ত্রণ গ্রুপে কোনো অস্বাভাবিকতা দেখা যায়নি।

৫. শূকরছানাদের ফুসফুস এবং অন্ত্রের প্যাথলজিতে PRRSV আইসোলেটগুলির তুলনামূলক বিশ্লেষণ

সমস্ত তিনটি গ্রুপের শূকরছানাকে ২১ দিন পর নেক্রোপসির জন্য মানবিক উপায়ে মেরে ফেলা হয়েছিল। ফলাফল দেখিয়েছে যে TJ2401, TJ2402, বা TJ2406 দ্বারা সংক্রমিত শূকরছানাদের সকলেরই ইন্টারস্টিশিয়াল নিউমোনিয়া, ফুসফুসের একত্রীকরণ এবং রক্তক্ষরণ দেখা গেছে এবং ক্ষত স্কোর অসংক্রমিত গ্রুপের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি ছিল। TJ2401 এবং TJ2402 সংক্রমণ গ্রুপেও অন্ত্রের প্রাচীর পাতলা হওয়া, জলযুক্ত অন্ত্রের বিষয়বস্তু এবং মেসেন্টারিক লিম্ফ নোডের বৃদ্ধি দেখা গেছে, যেখানে TJ2406 গ্রুপে কোনো সুস্পষ্ট অন্ত্রের ক্ষত দেখা যায়নি। অণুবীক্ষণিক পরীক্ষায় দেখা গেছে যে তিনটি ভাইরাস স্ট্রেইন দ্বারা সংক্রমিত শূকরছানাদের অ্যালভিওলার সেপ্টা ঘন ছিল এবং ফুসফুসের অণুবীক্ষণিক ক্ষত স্কোর বৃদ্ধি পেয়েছিল। অন্ত্রের প্যাথলজির ক্ষেত্রে, TJ2401 এবং TJ2402 গ্রুপে অন্ত্রের এপিথেলিয়াল ক্ষয় এবং লিম্ফোসাইটিক অনুপ্রবেশ দেখা গেছে, যেখানে TJ2406 গ্রুপ এবং নিয়ন্ত্রণ গ্রুপে কোনো সুস্পষ্ট ক্ষত দেখা যায়নি।

চিত্র ৪. ফুসফুস এবং অন্ত্রের নমুনায় ম্যাক্রোস্কোপিক এবং মাইক্রোস্কোপিক হিস্টোলজিক্যাল ক্ষতি।

(A) TJ2401, TJ2402, এবং TJ2406 সংক্রমণ উল্লেখযোগ্য ফুসফুসের ক্ষত এবং সুস্পষ্ট প্রদাহজনক কোষ অনুপ্রবেশের কারণ হয়েছে।

(B) TJ2401 এবং TJ2402 ফুসফুস এবং অন্ত্র উভয় ক্ষেত্রেই ক্ষত সৃষ্টি করেছে, যেখানে অসংক্রমিত গ্রুপে কোনো উল্লেখযোগ্য ক্ষত দেখা যায়নি।

উপসংহার: TJ2401 এবং TJ2402 শূকরছানাদের মধ্যে উল্লেখযোগ্য ফুসফুস এবং অন্ত্রের ক্ষত সৃষ্টি করেছে, যেখানে TJ2406 প্রধানত ফুসফুসের ক্ষত সৃষ্টি করেছে, তবে কোনো উল্লেখযোগ্য অন্ত্রের অস্বাভাবিকতা দেখা যায়নি।

সারাংশ

এই গবেষণায় দেখা গেছে যে L1A TJ2401 এবং L1C TJ2402 গুরুতর অন্ত্রের সংক্রমণ ঘটিয়েছে, যেখানে TJ2406 শুধুমাত্র ইন্টারস্টিশিয়াল নিউমোনিয়া ঘটিয়েছে। এটি পরামর্শ দেয় যে NADC30-এর মতো PRRSV-এর রোগ সৃষ্টিকারী ক্ষমতা জটিল এবং ভ্যাকসিনগুলির কার্যকারিতা সীমিত। নজরদারি জোরদার করা এবং নিয়ন্ত্রণ কৌশলগুলির সময়োপযোগী সমন্বয় প্রয়োজন।