Le syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP), causé par le virus SRRP, est l'une des maladies porcines les plus dévastatrices au monde. Ces dernières années, de multiples souches de lignée 1 ont été largement répandues aux États-Unis, tandis que les souches L1 RFLP 1-3-4 ont été moins fréquemment signalées en Chine.
Récemment, des chercheurs de l'Université agricole de Tianjin et de l'Université de médecine traditionnelle chinoise de Tianjin ont publié conjointement une étude dans Elsevier sur un variant recombinant du SRRPV avec un profil L1A/C RFLP 1–3–4 et ont analysé son génome.
Introduction
Le syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP) est une maladie infectieuse grave causée par le virus SRRP. Il est divisé en deux génotypes majeurs, les types européen et nord-américain. Les systèmes de classification RFLP et de lignée sont couramment utilisés pour analyser la diversité génétique du SRRPV-2. La lignée 1 (L1) est répandue aux États-Unis, avec des profils RFLP courants de 1-3-4, 1-4-4 et 1-7-4. En Chine, la souche 1-4-4 L1C prédomine, mais sa proportion diminue chaque année. Bien que moins fréquemment signalé, le 1-3-4 présente des caractéristiques uniques de colonisation intestinale et pourrait devenir une nouvelle souche dominante, posant une grave menace pour l'industrie porcine.
Résultats de la recherche
1. Isolement du SRRPV L1 à partir de porcelets diarrhéiques dans les élevages porcins de Tianjin
De mai à juin 2024, des échantillons de sérum ont été prélevés sur des porcelets allaitants dans trois élevages porcins de Tianjin après une diarrhée sévère. Les échantillons de sérum étaient positifs pour le SRRPV L1 en utilisant l'isolement sur cellules PAM et négatifs pour plusieurs virus porcins courants. Les isolats ont présenté une agrégation et une fragmentation cellulaires typiques et ont été purifiés et nommés TJ2401, TJ2402 et TJ2406. L'analyse par immunofluorescence a révélé une fluorescence verte, avec des valeurs de TCID₅₀ de 1×10^6,34, 1×10^6,25 et 3×10^5,0/0,1 mL, respectivement.
Figure 1. Isolement et identification des souches de SRRPV TJ2401, TJ2402 et TJ2406
(A-D) 48 heures après l'infection. (E-H) Marqués avec un anticorps anti-protéine N. Barre d'échelle, 100 μm.
Conclusion : Le virus du syndrome reproducteur et infectieux porcin (SRRPV) L1 a été isolé avec succès à partir d'échantillons de porcelets allaitants atteints de diarrhée sévère à Tianjin entre mai et juin 2024. Sa forte virulence a été confirmée par des tests d'effet cytopathique et d'immunofluorescence.
2. Caractéristiques génétiques et analyse des sous-types des souches SRRPV L1 isolées
Le séquençage du génome complet des isolats TJ2401, TJ2402 et TJ2406 a révélé un profil de délétion dans NSP2 compatible avec le sous-type L1 (de type NADC30). L'analyse phylogénétique du génome entier a révélé une relation étroite avec le sous-groupe L1.8. L'analyse RFLP du gène ORF5 a attribué TJ2401 au sous-type L1A et TJ2402 et TJ2406 au sous-type L1C.
Figure 2. Séquences NSP2 et arbre phylogénétique de TJ2401, TJ2402 et TJ2406
(A) Le profil de délétion NSP2 de TJ2401, TJ2402 et TJ2406 est identique à celui de NADC30.
(B) Les trois isolats sont étroitement liés au SRRPV L1.8 (de type NADC30).
(C) TJ2401 appartient à L1A, tandis que TJ2402 et TJ2406 appartiennent à L1C.
Conclusion : Les trois isolats, TJ2401, TJ2402 et TJ2406, sont des SRRPV L1 (de type NADC30), appartenant respectivement aux sous-types L1A et L1C.
3. Caractéristiques de recombinaison et analyse des segments géniques clés des souches SRRPV isolées
L'analyse de recombinaison a révélé que TJ2401, TJ2402 et TJ2406 présentaient tous des caractéristiques de recombinaison. TJ2401 et TJ2402 partageaient un segment génique commun (1-1970 nt) provenant de virus L8 (de type JXA1), ce qui pourrait contribuer à leur pathogénicité clinique similaire. TJ2406, en revanche, était principalement homologue à la souche NADC30 et contenait des segments recombinants restreints.
Figure 3. Arbre phylogénétique construit sur la base des génomes représentatifs du SRRPV
Conclusion : Les trois isolats de SRRPV sont des souches recombinantes. TJ2401 et TJ2402 partagent le segment L8, ce qui pourrait entraîner une pathogénicité clinique similaire.
4. Analyse des signes cliniques et de la dynamique virale des trois isolats chez les porcelets
Les porcelets inoculés avec TJ2401, TJ2402 ou TJ2406 ont développé une température corporelle élevée, une diarrhée sévère et une augmentation des scores de symptômes cliniques, une diminution du gain de poids quotidien et une séroconversion le jour 11. Les charges virales sériques et des écouvillons anaux étaient significativement élevées, tandis que le groupe témoin n'a montré aucun symptôme ni test viral positif.
Figure 4. Indicateurs cliniques et résultats des tests virologiques et immunologiques chez les porcelets
(A) Les porcelets inoculés avec TJ2401, TJ2402 ou TJ2406 avaient tous une température corporelle élevée.
(B) Le gain de poids quotidien des porcelets a été significativement réduit.
(C) Le jour 11 post-infection, les porcelets ont atteint la séroconversion des anticorps SRRP (seuil 0,4).
(D) La charge virale sérique a augmenté 5 jours après l'infection et a atteint un pic le jour 11.
(E) La charge virale dans les écouvillons anaux était cohérente avec la charge virale sérique.
(F) Le virus était présent dans de multiples tissus, principalement dans l'intestin.
Conclusion : TJ2401, TJ2402 et TJ2406 ont tous induit des signes cliniques et une infection virale significatifs chez les porcelets, tandis qu'aucune anomalie n'a été observée dans le groupe témoin.
5. Analyse comparative des isolats de SRRPV sur la pathologie pulmonaire et intestinale chez les porcelets
Les porcelets des trois groupes ont été euthanasiés avec humanité le jour 21 post-infection pour nécropsie. Les résultats ont montré que les porcelets infectés par TJ2401, TJ2402 ou TJ2406 ont tous développé une pneumonie interstitielle, une consolidation et une hémorragie pulmonaires, et les scores de lésion étaient significativement plus élevés que ceux du groupe non infecté. Les groupes infectés par TJ2401 et TJ2402 ont également montré un amincissement de la paroi intestinale, un contenu intestinal aqueux et des ganglions lymphatiques mésentériques hypertrophiés, tandis que le groupe TJ2406 n'a montré aucune lésion intestinale évidente. L'examen microscopique a montré que les septa alvéolaires des porcelets infectés par les trois souches virales étaient épaissis et que les scores de lésion microscopique pulmonaire étaient augmentés. En termes de pathologie intestinale, les groupes TJ2401 et TJ2402 ont montré une desquamation épithéliale intestinale et une infiltration lymphocytaire, tandis que le groupe TJ2406 et le groupe témoin n'ont montré aucune lésion évidente.
Figure 4. Lésions histologiques macroscopiques et microscopiques dans les échantillons pulmonaires et intestinaux.
(A) L'infection par TJ2401, TJ2402 et TJ2406 a entraîné des lésions pulmonaires importantes et une infiltration proéminente de cellules inflammatoires.
(B) TJ2401 et TJ2402 ont causé des lésions pulmonaires et intestinales, tandis qu'aucune lésion significative n'a été observée dans le groupe non infecté.
Conclusion : TJ2401 et TJ2402 ont causé des lésions pulmonaires et intestinales importantes chez les porcelets, tandis que TJ2406 a principalement causé des lésions pulmonaires sans anomalies intestinales significatives.
Résumé
Cette étude a révélé que L1A TJ2401 et L1C TJ2402 ont causé une infection intestinale sévère, tandis que TJ2406 n'a causé qu'une pneumonie interstitielle. Cela suggère que la pathogénicité du SRRPV de type NADC30 est complexe et que les vaccins ont une efficacité limitée. Une surveillance renforcée et un ajustement rapide des stratégies de contrôle sont nécessaires.
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