কোম্পানির খবর টাইপ ১ আফ্রিকান সোয়াইন ফিভার স্ট্রেইন

আফ্রিকার সোয়াইন জ্বর একটি অত্যন্ত সংক্রামক শূকর রোগ যা আফ্রিকান সোয়াইন ফিভার ভাইরাস দ্বারা সৃষ্ট, যা জাতীয় শূকর শিল্পের জন্য বিশাল হুমকি সৃষ্টি করে। ২০১৮ সালে জিনোটাইপ II এএসএফ দেশটির অভ্যন্তরে প্রবেশ করে এবং পরবর্তীতে জিনোটাইপ I এএসএফ সনাক্ত হওয়ার খবর পাওয়া যায়।

আফ্রিকার সোয়াইন ফিভার ভাইরাস টাইপ ১-এর জিনোমিক বিশ্লেষণ

জিনোমিক বিশ্লেষণ

জুন ২০২১-এ, শানডং এবং হেনান প্রদেশের দুটি শূকর খামারে মোটা হওয়ার শূকরগুলির মধ্যে দীর্ঘস্থায়ী সংক্রমণের লক্ষণ দেখা যায়, যার মধ্যে ওজন হ্রাস, মাঝে মাঝে জ্বর, ত্বকের আলসার এবং আর্থ্রাইটিস অন্তর্ভুক্ত ছিল। বিক্ষিপ্ত মৃত্যুও পরিলক্ষিত হয়েছিল। চারটি মৃত শূকর থেকে লিম্ফ নোড এবং প্লীহা সহ নমুনা সংগ্রহ করা হয়েছিল এবং এএসএফভি পরীক্ষার জন্য সিএনএএসএফপিএলে পাঠানো হয়েছিল।

ভাইরাল p72 জিনকে লক্ষ্য করে qPCR পরীক্ষা নিশ্চিত করেছে যে সমস্ত নমুনা এএসএফভি-পজিটিভ ছিল। p72 জিনের আরও ক্রম বিশ্লেষণ প্রকাশ করেছে যে এই নমুনাগুলির এএসএফভি স্ট্রেনগুলি টাইপ ১-এর অন্তর্গত। পরবর্তীতে, শানডং এবং হেনান প্রদেশের শূকর খামার থেকে নমুনা থেকে দুটি এএসএফভি জিনোটাইপ আলাদা করা হয়েছিল, যেগুলি Pig/Shandong/DY-I/2021 (SD/DY-I/21) এবং Pig/Henan/ZZ-P1/2021 (HeN/ZZ-P1/21) হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে।

চিত্র ১ এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ এবং হেন/জেডজেড-পি১/২১-এর ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ এবং ইউরোপ ও আফ্রিকা থেকে আসা প্রথম দিকের জিনোটাইপ I আইসোলেটগুলির সাথে তুলনা

চীনা জিনোটাইপ I এএসএফভি স্ট্রেন এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ এবং হেন/জেডজেড-পি১/২১-এর সম্পূর্ণ জিনোটাইপ সিকোয়েন্সিং প্রকাশ করেছে যে তারা পর্তুগিজ জিনোটাইপ I স্ট্রেন এনএইচ/পি68 এবং ওইউআরটি88/3-এর মতো একই ক্ল্যাডের অন্তর্গত, তবে চীনের আগের জিনোটাইপ II স্ট্রেনগুলির থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা। উভয় স্ট্রেনেই ১০টি ওআরএফ ডিলিশন (যেমন, এমজিএফ_360/505 পরিবার জিনে) এবং ৫টি ওআরএফ ট্রাঙ্কশন (যেমন, সিডি2ভি প্রোটিন জিনে ইপি402আর) রয়েছে, যা সম্ভবত দুর্বলতা হ্রাসের সাথে জড়িত। এনএইচ/পি68-এর সাথে তুলনা করলে, এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ এবং হেন/জেডজেড-পি১/২১-এর প্রত্যেকটিতে ১৮টি একক নিউক্লিওটাইড মিউটেশন (১২-১৩ অ্যামিনো অ্যাসিড পরিবর্তন) এবং বৃহৎ ডিলিশন (যেমন, হেন স্ট্রেনে এমজিএফ_110-4/5এল-এ ৬৮৬-bp ডিলিশন) রয়েছে। দুটি স্ট্রেনের বি602এল জিনের সিভিআর বর্ণালী অনন্য ছিল এবং তাদের মধ্যে উল্লেখযোগ্য জিনোমিক পার্থক্য ছিল (যেমন ২৩টি ওআরএফ মিউটেশন এবং ৭০০ bp ডিলিশন), যা ইঙ্গিত করে যে এগুলি স্বাধীনভাবে প্রবেশের ঘটনা এবং উৎস সনাক্তকরণ এবং প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণের জন্য শক্তিশালী পর্যবেক্ষণ প্রয়োজন।

এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ স্ট্রেন টাইপ ১-এর ক্লিনিকাল লক্ষণ

ক্লিনিকাল লক্ষণ

#01 পশু পরীক্ষা

প্রতিটি শূকরকে শরীরের তাপমাত্রা এবং অরুচি, বিষণ্ণতা, জ্বর, বেগুনি ত্বক, টলমলে হাঁটা, ডায়রিয়া এবং কাশি সহ লক্ষণগুলির পরিবর্তনের জন্য প্রতিদিন ২৮ দিন ধরে পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল।

#02 শরীরের তাপমাত্রার পরিবর্তন

এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ স্ট্রেনটি ইন্ট্রামাসকুলারলি ইনোকুলেট করা হয়েছিল এবং প্রতিদিন শরীরের তাপমাত্রা পরিমাপ করা হয়েছিল। ৩ থেকে ১৮ দিন পর্যন্ত, পরীক্ষিত শূকরগুলির মধ্যে সকলেরই বিভিন্ন মাত্রার মাঝে মাঝে জ্বর দেখা যায়। কম-ডোজ গ্রুপে, ২৬ দিনের মধ্যে শুধুমাত্র একটি সহবাসী শূকরের জ্বর হয়েছিল, যেখানে উচ্চ-ডোজ গ্রুপে, ২৩ দিনের মধ্যে উভয় সহবাসী শূকরের জ্বর হয়েছিল। ইন্ট্রামাসকুলার ইনজেকশনের পরে গ্রুপ ১০-এর একটি শূকর ১৬ দিনের মধ্যে মারা যায়।

জিনোটাইপ I এএসএফভি আইসোলেট এসডি/ডিওয়াই-আই/২১-এর সংক্রমণ সমস্ত ইনোকুলেটেড গ্রুপে মাঝে মাঝে জ্বর সৃষ্টি করে (সংক্রমণের ৩ থেকে ১৮ দিন পর)। উচ্চ-ডোজ গ্রুপ (10⁶ TCID₅₀) আরও সুস্পষ্ট লক্ষণ দেখিয়েছিল (সাধারণীকৃত প্যাপুলার ফুসকুড়ি, আর্থ্রাইটিস এবং ত্বকের নেক্রোসিস সহ), তবে সমস্ত শূকর ২৮ দিনের পর্যবেক্ষণ সময়কালে বেঁচে ছিল। কম-ডোজ গ্রুপের একটি শূকর (10³ TCID₅₀) গুরুতর ভিসারাল ক্ষত থেকে মারা যায়, যেখানে বাকিরা বেঁচে ছিল। ওরাল সোয়াব (৫ দিন পর্যন্ত) , রেকটাল সোয়াব (৭ দিন) এবং রক্তে (৭ দিন) ভাইরাল ডিএনএ ক্রমাগতভাবে ২৮ দিনের বেশি সময় ধরে সনাক্ত করা হয়েছিল, যা দীর্ঘায়িত ভাইরাল প্রতিলিপি এবং ঝরে পড়ার ইঙ্গিত দেয়।

#03 লক্ষণ

বেঁচে থাকা শূকরগুলিতে প্যাপুল (এ, বি), ত্বকের নেক্রোসিস (বি, সি) এবং পিছনের পায়ের জয়েন্টগুলি (বি, ডি)। গ্রুপ ১০-এর একটি শূকর (নং ৩) অসুস্থ হয়ে পড়ে এবং সংক্রমণের ১৬তম দিনে মারা যায়। নেক্রোপসি থেকে নাকের রক্তপাত এবং কনজেশন এবং প্লীহা, লিভার এবং লিম্ফ নোডের ফোলাভাব প্রকাশ পায়।

জিনোটাইপ I এএসএফভি আইসোলেট এসডি/ডিওয়াই-আই/২১ যোগাযোগের মাধ্যমে সংক্রমণযোগ্য, সংক্রমিত শূকরগুলি দীর্ঘস্থায়ী লক্ষণ (জ্বর, আর্থ্রাইটিস এবং ত্বকের ক্ষত) প্রদর্শন করে। ওরাল সোয়াবে (সংক্রমণের ৫-৯ দিন পর) ভাইরাল ডিএনএ দ্রুত এবং ক্রমাগত সনাক্ত করা হয়, রেকটাল সোয়াব এবং রক্তে পরে ঝরে পড়ে। সংক্রমিত শূকরগুলির টিস্যুতে (প্লীহা, ফুসফুস এবং অস্থি মজ্জা) উচ্চ ভাইরাল লোড পরিলক্ষিত হয়। যোগাযোগের মাধ্যমে সংক্রমণের পরে, ভাইরাসটি ফুসফুস এবং টনসিলের মতো টিস্যুতে কম পরিমাণে উপস্থিত থাকে। যাইহোক, সমস্ত উন্মুক্ত শূকর বেঁচে ছিল, যা ইঙ্গিত করে যে সংক্রমণের কার্যকারিতা সীমিত কিন্তু দীর্ঘস্থায়ী সংক্রমণ সম্ভব।

03

শূকরগুলিতে এসডি/ডিওয়াই-আই/২১-এর প্রতিলিপি এবং ডিটক্সিফিকেশন

প্রতিলিপি এবং ডিটক্সিফিকেশন

শূকর থেকে প্রতি দুদিন অন্তর ওরাল এবং রেকটাল সোয়াব এবং রক্তের নমুনা সংগ্রহ করা হয়েছিল এবং qPCR দ্বারা ভাইরাল ডিএনএ পরীক্ষা করা হয়েছিল।

চিত্র ৩: মুখ, মল এবং রক্তের টক্সিন

মুখ এখনও প্রথম ডিটক্সিফাই হয়, তবে সনাক্ত করা CT মানগুলি সবই ৩০-এর নিচে।

চিত্র ৪ ভাইরাস ক্যারিয়ার স্ট্যাটাস এবং অ্যান্টিবডি রূপান্তর

এ, অনুভূমিক অক্ষ থেকে, হার্ট, লিভার, প্লীহা, ফুসফুস, কিডনি, টনসিল, থোরাক্স, অ্যাড্রিনাল গ্রন্থি, অস্থি মজ্জা, জয়েন্ট ফ্লুইড, এলএন১ অন্ত্রের লিম্ফ নোড, এলএন২ ইনগুইনাল লিম্ফ নোড, এলএন৩ সাবকলার লিম্ফ নোড, এলএন৪ ব্রঙ্কিয়াল লিম্ফ নোড, এলএন৫ গ্যাস্ট্রোহেপাটিক লিম্ফ নোড এবং এলএন৬ মিডিয়াস্টিনাল লিম্ফ নোড-কে প্রতিনিধিত্ব করে।

জিনোটাইপ I এএসএফভি স্ট্রেন এসডি/ডিওয়াই-আই/২১-এর সংক্রমণের পরে, ভ্যাকসিনযুক্ত এবং যোগাযোগের শূকর উভয়ই p72 প্রোটিনের বিরুদ্ধে IgG অ্যান্টিবডি তৈরি করে (উচ্চ-ডোজ গ্রুপে ৭ম দিনে এবং কম-ডোজ গ্রুপে ৯ম দিনে সনাক্ত করা হয়েছে)। সময়ের সাথে অ্যান্টিবডি মাত্রা বৃদ্ধি পায়। যোগাযোগের শূকরগুলি সংক্রমণের ২১-২৭ দিন পর সেরোকনভার্ট হয়, যা নিশ্চিত করে যে ভাইরাসটি যোগাযোগের মাধ্যমে সংক্রমণ হতে পারে। ভাইরাসটি শূকরের শরীরে দীর্ঘ সময় ধরে প্রতিলিপি তৈরি করে এবং নির্গত হয়। ওরাল এবং রেকটাল সোয়াব এবং রক্তে ২৮ দিনের বেশি সময় ধরে ভাইরাল ডিএনএ ক্রমাগত সনাক্ত করা হয় এবং সংক্রমিত শূকর টিস্যুগুলিতে (প্লীহা, ফুসফুস, লিম্ফ নোড ইত্যাদি) ভাইরাল লোড বেশি থাকে, যা ইঙ্গিত করে যে দীর্ঘস্থায়ী সংক্রমণের সময় ভাইরাস প্রতিলিপি তৈরি করে এবং ঝরে পড়ে, যা সংক্রমণের ঝুঁকি বাড়ায়।

04

সারাংশ

সারাংশ

আফ্রিকার সোয়াইন ফিভার জিনোটাইপ ১ স্ট্রেনগুলির উচ্চ মৃত্যুর হার, ধীর গতি, বিভিন্ন এবং সূক্ষ্ম ক্লিনিকাল প্রকাশ, দীর্ঘস্থায়ী সংক্রমণ ঘটাতে পারে এবং অত্যন্ত সংক্রমণযোগ্য।