কোম্পানির খবর হারবিন ভেটেরিনারি রিসার্চ ইনস্টিটিউটঃ বর্তমান NADC30-like এবং 12 পুনরায় সমন্বিত মডেলের প্রাদুর্ভাব

২০১২ সালে, আমার দেশে PRRSV-এর মতো NADC30 স্ট্রেন প্রথম আবিষ্কৃত হয়েছিল। ২০১৬ সাল থেকে, এই স্ট্রেনটি ধীরে ধীরে দেশের প্রধান স্ট্রেনে পরিণত হয়েছে। বর্তমানে, এই স্ট্রেনটি অত্যন্ত জটিল পুনর্মিলন প্যাটার্ন প্রদর্শন করে, যা কম জিনোম সিকোয়েন্স হোমোলজির দ্বারা চিহ্নিত। এটি মাঝারি ক্লিনিকাল লক্ষণ দেখায়, শক্তিশালী ইমিউনোসপ্রেসिव বৈশিষ্ট্য রয়েছে এবং দুর্বল অ্যান্টিবডি প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি করে, যা নতুন মহামারী বৈশিষ্ট্য উপস্থাপন করে।

সম্প্রতি, চাইনিজ একাডেমি অফ এগ্রিকালচারাল সায়েন্সেস-এর হারবিন ভেটেরিনারি রিসার্চ ইনস্টিটিউট এবং নানিয়াং নরমাল ইউনিভার্সিটি আমার দেশে NADC30-এর মতো PRRSV-এর জিনোমিক বৈশিষ্ট্য এবং মহামারী প্রবণতা নিয়ে পোরসিন হেলথ ম্যানেজমেন্টে অনলাইনে একটি গবেষণা প্রকাশ করেছে, যা সম্পর্কিত এপিডেমিওলজিক্যাল গবেষণা এবং প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণের জন্য ডেটা সরবরাহ করে।

ভূমিকা

পরিপূর্ণ প্রজনন এবং শ্বাসযন্ত্রের সিন্ড্রোম ভাইরাস (PRRSV) আমার দেশের শূকর শিল্পে গুরুতর অর্থনৈতিক ক্ষতি করেছে। ২০১২ সালে, আমার দেশে প্রথম NADC30-এর মতো PRRSV আবিষ্কৃত হয়েছিল। বহু বছর ধরে, হারবিন ভেটেরিনারি রিসার্চ ইনস্টিটিউটের তিয়ান ঝিজুনের দল ক্রমাগতভাবে আমার দেশে PRRSV-এর মহামারী পরিস্থিতি পর্যবেক্ষণ করেছে।

গবেষণার ফলাফল

১. NADC30-এর মতো পুনর্মিলন উল্লেখযোগ্য বৃদ্ধি

গবেষণায় দেখা গেছে যে ২০১৬ সাল থেকে, NADC30-এর মতো PRRSV আমার দেশে প্রধান স্ট্রেন হয়ে উঠেছে। চীনে এর বিস্তার আরও ভালোভাবে বুঝতে, গবেষকরা ৩০টি ভাইরাস স্ট্রেনের সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্স পেতে নেক্সট-জেনারেশন সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি ব্যবহার করেছেন। GenBank ডাটাবেসে থাকা ২২৪টি চীনা স্ট্রেনের সিকোয়েন্সের সাথে একত্রিত করে, তাদের জিনোমিক বৈশিষ্ট্যগুলি পদ্ধতিগতভাবে বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। ফলাফল দেখায় যে পুনর্মিলন স্ট্রেনের সংখ্যা বছর বছর বৃদ্ধি পেয়েছে এবং অ-পুনর্মিলন স্ট্রেনগুলি প্রায় অদৃশ্য হয়ে গেছে। এদের মধ্যে, L1C+L8E, L1C+L5A এবং L1C+L1A+L8E বর্তমানে তিনটি সবচেয়ে সাধারণ পুনর্মিলন প্রকার।

চিত্র ১. চীনে NADC30-এর মতো PRRSV-এর এপিডেমিওলজি এবং পুনর্মিলন

(ক) চীনে PRRSV-এর বিস্তার, (খ) পুনর্মিলন স্ট্রেন প্যাটার্নের সময়ের প্রবণতা

(গ) পুনর্মিলন প্যাটার্নের বিতরণ

উপসংহার: সাম্প্রতিক বছরগুলোতে, NADC30-এর মতো স্ট্রেনগুলি আমার দেশে প্রভাবশালী রয়েছে এবং ব্যাপকহারে পুনর্মিলনে অংশ নিয়েছে, যা একাধিক উপপ্রকার তৈরি করেছে, যার মধ্যে L1C+L8E সবচেয়ে সাধারণ। সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং তাদের বিবর্তন এবং রোগ সৃষ্টিকারী ক্ষমতা অধ্যয়নের জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার হয়ে উঠেছে।

২. ১২টি পুনর্মিলন মডেল

পুনর্মিলন স্ট্রেনের সংখ্যা বৃদ্ধির সাথে, শুধুমাত্র ORF5 জিনের উপর ভিত্তি করে টাইপিং ভাইরাসের বৈশিষ্ট্য সম্পূর্ণরূপে এবং সঠিকভাবে প্রতিফলিত করতে পারছে না। এই গবেষণায় সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সের উপর ভিত্তি করে ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ ব্যবহার করা হয়েছে এবং আমার দেশে NADC30-এর মতো স্ট্রেনগুলিকে শ্রেণীবদ্ধ করতে পুনর্মিলন ফলাফল একত্রিত করা হয়েছে। অবশেষে, অনুরূপ পুনর্মিলন বৈশিষ্ট্যযুক্ত ১২০টি স্ট্রেনকে ১২টি উপপ্রকারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে, NADC30-R1 থেকে R12 পর্যন্ত। উপপ্রকারগুলির মধ্যে গড় জেনেটিক দূরত্ব ছিল ৫.৭৩% (স্ট্যান্ডার্ড ডেভিয়েশন ±১.৬৮), যেখানে উপপ্রকারগুলির মধ্যে জেনেটিক দূরত্ব সাধারণত ১০% এর বেশি ছিল। একই গ্রুপের সমস্ত স্ট্রেনের Nsp2 প্রোটিনে ১৩১টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি বিচ্ছিন্ন বিলুপ্তি ছিল, যা NADC30-এর মতো স্ট্রেনের সাধারণ বৈশিষ্ট্যের সাথে সঙ্গতিপূর্ণ। ক্ষতিকারকতার ক্ষেত্রে, প্রতিটি গ্রুপের স্ট্রেনগুলি উল্লেখযোগ্য ধারাবাহিকতা দেখায়নি, বেশিরভাগ স্ট্রেন মাঝারি ক্ষতিকারকতার ছিল।

চিত্র ২. ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ এবং পুনর্মিলন প্যাটার্নের উপর ভিত্তি করে NADC30-এর মতো PRRSV-এর শ্রেণীবিভাগ পদ্ধতি

(ক) সম্পূর্ণ জিনোম ফাইলোজেনেটিক ট্রি, (খ) পুনর্মিলন প্যাটার্ন জিনোম ম্যাপ

উপসংহার: এই গবেষণায় সম্পূর্ণ জিনোম বিশ্লেষণের মাধ্যমে চীনা NADC30-এর মতো স্ট্রেনগুলিকে ১২ প্রকারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। এই স্ট্রেনগুলিতে একটি সাধারণ Nsp2 বিলুপ্তি, মাঝারি ক্ষতিকারক ক্ষমতা এবং গ্রুপের মধ্যে উল্লেখযোগ্য জিনগত পরিবর্তন দেখা গেছে।

৩. ১৯টি প্রদেশ থেকে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্স

ফলাফল দেখায় যে আমার দেশের ১৯টি প্রদেশ থেকে NADC30-এর মতো ভাইরাসগুলির সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সগুলি ২০১৮ সাল থেকে NADC30-R1 থেকে R12 প্রকারের অন্তর্গত স্ট্রেনের সংখ্যা ধীরে ধীরে বৃদ্ধি পেয়েছে, যার মধ্যে NADC30-R1 এবং NADC30-R2 একটি উল্লেখযোগ্য অংশ প্রতিনিধিত্ব করে। NADC30-R1 স্ট্রেনটি প্রথম ২০১৪ সালে দেখা যায় এবং দীর্ঘদিন ধরে এটি বিস্তার লাভ করেছে, সাম্প্রতিক প্রতিবেদনেও এটি চলছে। NADC30-R2 স্ট্রেনটি আমার দেশে সবচেয়ে বিস্তৃত NADC30-এর মতো ভাইরাস, যা কমপক্ষে ১২টি প্রদেশ এবং অঞ্চলে ছড়িয়ে পড়েছে। ২০২০ সালে প্রথম দেখা যাওয়ার পর, এটি দ্রুত ছড়িয়ে পড়ে, সাম্প্রতিক বছরগুলোতে এর সনাক্তকরণের হার উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে। যদিও NADC30-এর মতো স্ট্রেনগুলির পুনর্মিলন প্যাটার্ন জটিল, কিছু একই পুনর্মিলন প্রকারের স্ট্রেন চীনের কিছু অংশে প্রচলিত হয়ে উঠেছে।

চিত্র ৩. প্রতিটি গ্রুপে NADC30-এর মতো PRRSV সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সের ভৌগোলিক বিতরণ এবং অনুপাত

(ক-খ) স্ট্রেন প্রকারের ভৌগোলিক বিতরণ, (গ) R1/R2 প্রাধান্য

উপসংহার: আমার দেশে NADC30-এর মতো ভাইরাসগুলির মধ্যে, R1 এবং R2 স্ট্রেনের সংখ্যা বাড়ছে। বিশেষ করে, ব্যাপকভাবে এবং দ্রুত ছড়িয়ে পড়া R2 স্ট্রেন জটিল পুনর্মিলন প্যাটার্ন প্রদর্শন করে এবং কিছু এলাকায় ক্রমাগত বিস্তার লাভ করছে।

৪. পুনর্মিলন স্ট্রেনের অনুপাত

আমার দেশে NADC30-এর মতো PRRSV-এর মহামারী পরিস্থিতি জটিল রয়েছে, নতুন পুনর্মিলন স্ট্রেনের ক্রমাগত আবির্ভাব ভাইরাসের জিনগত বৈচিত্র্য বৃদ্ধি করছে। উল্লেখযোগ্যভাবে, NADC30-IR এখনও বৃহত্তম গ্রুপ, এবং এই গ্রুপের মধ্যে পুনর্মিলন প্যাটার্নগুলি বেশ বৈচিত্র্যময় এবং ধারাবাহিক বৈশিষ্ট্যের অভাব রয়েছে। GenBank ডাটাবেসে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সের সংখ্যা বাড়ার সাথে সাথে, ভবিষ্যতে নতুন বৈশিষ্ট্যপূর্ণ স্ট্রেন আবিষ্কৃত হতে পারে, অথবা সেগুলিকে বিদ্যমান NADC30-R1 থেকে R12 প্রকারের মধ্যে পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ করা যেতে পারে।

চিত্র ৪. চীনে বিভিন্ন পুনর্মিলন প্যাটার্ন সহ NADC30-এর মতো PRRSV-এর অনুপাত

NR: অ-পুনর্মিলন স্ট্রেন; IR: অনিয়মিত পুনর্মিলন প্যাটার্নযুক্ত স্ট্রেন; R1 থেকে R12: ধারাবাহিক বৈশিষ্ট্যযুক্ত পুনর্মিলন স্ট্রেন। X-অক্ষ এই গবেষণায় ব্যবহৃত শ্রেণীবিভাগ মানদণ্ডকে প্রতিনিধিত্ব করে। Y-অক্ষ প্রতিটি প্রকারের জন্য নমুনার আকারকে প্রতিনিধিত্ব করে।

উপসংহার: আমার দেশে NADC30-এর মতো PRRSV-এর মহামারী পরিস্থিতি জটিল, জিনগত বৈচিত্র্য বৃদ্ধি পাচ্ছে। NADC30-IR প্রভাবশালী গ্রুপ। আরও ডেটা উপলব্ধ হওয়ার সাথে সাথে নতুন স্ট্রেন দেখা দিতে পারে বা বিদ্যমান শ্রেণীবিভাগ সমন্বয় করা যেতে পারে।

সারাংশ

এই গবেষণায় দেখা যায় যে বর্তমানে আমার দেশে প্রচলিত PRRSV-2 প্রধানত L1A, L1C, L3.5, এবং L8E সাবলাইনিজ দ্বারা গঠিত, যার মধ্যে L1C (NADC30-এর মতো) প্রভাবশালী এবং ঘন ঘন পুনর্মিলন ঘটায়। পুনর্মিলন ভাইরাল বৈচিত্র্যকরণ এবং বিবর্তনকে উৎসাহিত করে, তবে পুনর্মিলন সরাসরি ক্ষতিকারক ক্ষমতা নির্ধারণ করে না; ক্ষতিকারক ক্ষমতা নির্দিষ্ট পুনর্মিলন প্যাটার্নের সাথে সম্পর্কিত।