noticias de la compañía sobre Instituto de Investigación Veterinaria de Harbin: Prevalencia actual de modelos similares a NADC30 y 12 recombinantes

En 2012, la cepa NADC30 similar a PRRSV se descubrió por primera vez en mi país. Desde 2016, esta cepa se ha convertido gradualmente en la cepa predominante en el país. Actualmente, esta cepa exhibe un patrón de recombinación altamente complejo, caracterizado por una baja homología de la secuencia del genoma. Exhibe síntomas clínicos moderados, posee fuertes propiedades inmunosupresoras e induce una respuesta de anticuerpos débil, presentando nuevas características epidémicas.

Recientemente, el Instituto de Investigación Veterinaria de Harbin de la Academia China de Ciencias Agrícolas y la Universidad Normal de Nanyang publicaron un estudio en línea en Porcine Health Management sobre las características genómicas y las tendencias epidémicas del PRRSV similar a NADC30 en mi país, proporcionando apoyo de datos para la investigación epidemiológica relacionada y la prevención y el control.

Introducción

El virus del síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRSV) ha causado graves pérdidas económicas a la industria porcina de mi país. En 2012, el PRRSV similar a NADC30 se descubrió por primera vez en mi país. Durante muchos años, el equipo de Tian Zhijun en el Instituto de Investigación Veterinaria de Harbin ha monitoreado continuamente la situación epidémica del PRRSV en mi país.

Resultados de la investigación

1. Aumento significativo de las recombinaciones similares a NADC30

Los estudios han demostrado que desde 2016, el PRRSV similar a NADC30 se ha convertido en la cepa predominante en mi país. Para comprender mejor su prevalencia en China, los investigadores utilizaron la tecnología de secuenciación de próxima generación para obtener las secuencias completas del genoma de 30 cepas de virus. Combinado con secuencias de 224 cepas chinas en la base de datos GenBank, sus características genómicas fueron analizadas sistemáticamente. Los resultados mostraron que el número de cepas recombinantes aumentó año tras año, y las cepas no recombinantes casi han desaparecido. Entre ellas, L1C+L8E, L1C+L5A y L1C+L1A+L8E son actualmente los tres tipos recombinantes más comunes.

Figura 1. Epidemiología y recombinación del PRRSV similar a NADC30 en China

(A) Prevalencia del PRRSV en China, (B) Tendencias temporales de los patrones de cepas recombinantes

(C) Distribución de los patrones de recombinación

Conclusión: En los últimos años, las cepas similares a NADC30 han seguido dominando en mi país y han participado ampliamente en la recombinación, formando múltiples subtipos, siendo L1C+L8E el más común. La secuenciación del genoma completo se ha convertido en una herramienta clave para estudiar su evolución y patogenicidad.

2. 12 Modelos de recombinación

Con el creciente número de cepas recombinantes, la tipificación basada únicamente en el gen ORF5 ya no puede reflejar de forma completa y precisa las características virales. Este estudio utilizó el análisis filogenético basado en secuencias completas del genoma y combinó los resultados de la recombinación para clasificar las cepas similares a NADC30 en mi país. En última instancia, 120 cepas con características de recombinación similares se clasificaron en 12 subtipos, NADC30-R1 a R12. La distancia genética promedio dentro de los subtipos fue del 5,73% (desviación estándar ±1,68), mientras que la distancia genética entre los subtipos generalmente superó el 10%. Todas las cepas del mismo grupo tenían una deleción discontinua de 131 aminoácidos en la proteína Nsp2, consistente con las características típicas de las cepas similares a NADC30. En términos de virulencia, las cepas de cada grupo no mostraron una consistencia significativa, siendo la mayoría de las cepas de virulencia moderada.

Figura 2. Sistema de clasificación del PRRSV similar a NADC30 basado en el análisis filogenético y los patrones de recombinación

(A) Árbol filogenético del genoma completo, (B) Mapa del genoma del patrón de recombinación

Conclusión: Este estudio clasificó las cepas chinas similares a NADC30 en 12 tipos a través del análisis del genoma completo. Se descubrió que estas cepas exhibían una deleción típica de Nsp2, con virulencia moderada y una variación genética significativa dentro del grupo.

3. Secuencias completas del genoma de 19 provincias

Los resultados mostraron que las secuencias completas del genoma de los virus similares a NADC30 de 19 provincias de mi país revelaron un aumento gradual en el número de cepas pertenecientes a los tipos NADC30-R1 a R12 desde 2018, con NADC30-R1 y NADC30-R2 representando una proporción significativa. La cepa NADC30-R1 apareció por primera vez en 2014 y ha estado circulando durante mucho tiempo, con informes recientes aún en curso. La cepa NADC30-R2 es el virus similar a NADC30 más ampliamente distribuido en mi país, habiéndose extendido a al menos 12 provincias y regiones. Después de su primera aparición en 2020, se propagó rápidamente, con un aumento significativo en su tasa de detección en los últimos años. Aunque los patrones de recombinación de las cepas similares a NADC30 son complejos, algunas cepas del mismo tipo recombinante se han vuelto prevalentes en algunas partes de China.

Figura 3. Distribución geográfica y proporción de secuencias completas del genoma del PRRSV similar a NADC30 en cada grupo

(A-B) Distribución geográfica de los tipos de cepas, (C) Dominancia de R1/R2

Conclusión: Entre los virus similares a NADC30 en mi país, el número de cepas R1 y R2 está aumentando. En particular, la cepa R2, de amplia distribución y rápida propagación, exhibe patrones de recombinación complejos y continúa circulando en algunas áreas.

4. Proporción de cepas recombinantes

La situación epidémica del PRRSV similar a NADC30 en mi país sigue siendo compleja, con la aparición continua de nuevas cepas recombinantes que aumentan la diversidad genética del virus. En particular, NADC30-IR sigue siendo el grupo más grande, y los patrones de recombinación dentro de este grupo son bastante diversos y carecen de características consistentes. A medida que aumenta el número de secuencias completas del genoma en la base de datos GenBank, se pueden descubrir nuevas cepas características en el futuro, o pueden ser reclasificadas en los tipos NADC30-R1 a R12 existentes.

Figura 4. Proporción de PRRSV similar a NADC30 con diferentes patrones de recombinación en China

NR: cepa no recombinante; IR: cepa con patrón de recombinación irregular; R1 a R12: cepas recombinantes con características consistentes. El eje X representa los criterios de clasificación utilizados en este estudio. El eje Y representa el tamaño de la muestra para cada tipo.

Conclusión: La situación epidémica del PRRSV similar a NADC30 en mi país es compleja, con una creciente diversidad genética. NADC30-IR es el grupo dominante. Pueden surgir nuevas cepas o la clasificación existente puede ajustarse a medida que haya más datos disponibles.

Resumen

Este estudio muestra que el PRRSV-2 que actualmente circula en mi país está compuesto principalmente por los linajes L1A, L1C, L3.5 y L8E, de los cuales L1C (similar a NADC30) es dominante y se recombina con frecuencia. La recombinación promueve la diversificación y evolución viral, pero la recombinación no determina directamente la virulencia; la virulencia está asociada con patrones de recombinación específicos.