ข่าว บริษัท เกี่ยวกับ สถาบันวิจัยสัตวแพทย์ฮาร์บิน: การแพร่หลายในปัจจุบันของรุ่น NADC30-like และ 12 รุ่นรีคอมบิแนนท์

ในปี 2012 สายพันธุ์ NADC30 ที่คล้ายกับ PRRSV ถูกค้นพบครั้งแรกในประเทศของฉัน ตั้งแต่ปี 2016 สายพันธุ์นี้ค่อย ๆ กลายเป็นสายพันธุ์ที่ก้าวหน้าในประเทศสายพันธุ์นี้แสดงลักษณะการผสมผสานใหม่ที่ซับซ้อนมาก, มีลักษณะด้วยการจําลองรหัสพันธุกรรมที่ต่ํา มีอาการทางคลินิกที่ปานกลาง มีคุณสมบัติการกดดันภูมิคุ้มกันที่แข็งแรง และผลักดันการตอบสนองของแอนติบอดีที่อ่อนแอที่แสดงลักษณะระบาดใหม่.

ล่าสุด the Harbin Veterinary Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences and Nanyang Normal University published a study online in Porcine Health Management on the genomic characteristics and epidemic trends of NADC30-like PRRSV in my country, ให้การสนับสนุนข้อมูลสําหรับการวิจัยโรคระบาดและการป้องกันและควบคุมที่เกี่ยวข้อง

คําแนะนํา

ไวรัสอาการบํารุงพันธุ์และทางเดินหายใจของหมู (PRRSV) ส่งผลให้อุตสาหกรรมหมูในประเทศของฉันเสียหายทางเศรษฐกิจอย่างหนัก ในปี 2012 ไวรัส PRRSV ที่คล้าย NADC30 ถูกค้นพบครั้งแรกในประเทศของฉันหลายปีแล้ว, ทีมงานของ Tian Zhijun ที่สถาบันวิจัยสัตวแพทย์ฮาร์บิน ได้ติดตามสถานการณ์ระบาดของโรค PRRSV ในประเทศของฉันอย่างต่อเนื่อง

ผลการวิจัย

1. การเพิ่มขึ้นอย่างสําคัญใน NADC30 เหมือนการรวมตัวใหม่

การศึกษาแสดงให้เห็นว่า ตั้งแต่ปี 2016 เป็นต้นไป พีเอสอาร์เอสวีแบบ NADC30 กลายเป็นสายพันธุ์ที่ก้าวหน้าในประเทศของฉันนักวิจัยใช้เทคโนโลยีการเรียงลําดับรุ่นใหม่ เพื่อได้รับลําดับพันธุกรรมทั้งหมดของเชื้อไวรัส 30 เชื้อรวมกันกับลําดับจากสายพันธุ์จีน 224 ในฐานข้อมูล GenBank คุณลักษณะพันธุกรรมของพวกเขาถูกวิเคราะห์อย่างเป็นระบบผลการตรวจแสดงว่าจํานวนสายพันธุ์ที่ผสมผสานกันใหม่ เพิ่มขึ้นจากปีต่อปี, และสายพันธุ์ที่ไม่ผสมผสานได้หายไปเกือบหมด. ในหมู่พวกเขา L1C+L8E, L1C+L5A และ L1C+L1A+L8E ปัจจุบันเป็นสามชนิดผสมผสานที่ทั่วไปที่สุด.

รูปที่ 1. โรคระบาดและการรวมตัวของ PRRSV แบบ NADC30 ในจีน

(A) การแพร่ระบาดของ PRRSV ในจีน (B) แนวโน้มในเวลาของรูปแบบสายพันธุ์ที่ผสมผสานใหม่

(C) การกระจายกระบวนการการรวมตัวใหม่

สรุป: ในช่วงหลายปีที่ผ่านมา สายพันธุ์คล้าย NADC30 ยังคงมีอํานาจในประเทศของฉัน และมีส่วนร่วมอย่างมากในการผสมผสานโดย L1C+L8E เป็นตัวที่พบบ่อยที่สุดการเรียงลําดับพันธุกรรมทั้งพันธุกรรมได้กลายเป็นเครื่องมือสําคัญในการศึกษาวิวัฒนาการและโรค

2. 12 รูปแบบการรวมใหม่

ด้วยจํานวนของสายพันธุ์ที่ผสมผสานมากขึ้น การแบ่งชนิดที่พึ่งพากับพันธุกรรม ORF5 เท่านั้นก็ไม่สามารถสะท้อนลักษณะของไวรัสได้อย่างเต็มที่และแม่นยําอีกต่อไปการศึกษานี้ใช้การวิเคราะห์พันธุกรรมศาสตร์ โดยใช้ลําดับพันธุกรรมทั้งหมด และผลการผสมผสานรวม เพื่อจัดหมวดหมู่สายพันธุ์คล้าย NADC30 ในประเทศของฉันในที่สุด 120 สายพันธุ์ที่มีลักษณะการผสมผสานที่คล้ายกันถูกแบ่งออกเป็น 12 กลุ่มย่อย NADC30-R1 ถึง R12 ระยะทางพันธุกรรมเฉลี่ยภายในกลุ่มย่อยคือ 5.73% (เบี่ยงเบนมาตรฐาน ± 1.68), ในขณะที่ระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างใต้ประเภทโดยทั่วไปมากกว่า 10% ทุกสายพันธุ์ในกลุ่มเดียวกันมีการลบอะมิโนแอซิด 131 ในโปรตีน Nsp2สอดคล้องกับลักษณะเฉพาะของสายพันธุ์คล้าย NADC30ในแง่ของความไวรัสลักษณะ สายพันธุ์ในแต่ละกลุ่มไม่ได้แสดงความสอดคล้องอย่างสําคัญ โดยสายพันธุ์ส่วนใหญ่มีความไวรัสลักษณะปานกลาง

รูปที่ 2 ระบบการจัดหมวดหมู่ของ PRRSV แบบ NADC30 โดยใช้การวิเคราะห์พันธุกรรมศาสตร์และรูปแบบการผสมผสาน

(A) ต้นพันธุ์พันธุกรรมทั้งพันธุกรรม (B) แผนที่พันธุกรรมรูปแบบการรวมใหม่

สรุป: การศึกษานี้แบ่งเชื้อราแบบ NADC30 ของจีนเป็น 12 ชนิด โดยการวิเคราะห์พันธุกรรมทั้งหมด พบว่าเชื้อราเหล่านี้แสดงการลบ Nsp2 แบบปกติที่มีเชื้อไวรัสปานกลางและมีความแตกต่างทางพันธุกรรมที่สําคัญในกลุ่ม.

3การเรียงลําดับพันธุกรรมทั้งหมดจาก 19 จังหวัด

The results showed that whole-genome sequences of NADC30-like viruses from 19 provinces in my country revealed a gradual increase in the number of strains belonging to the NADC30-R1 to R12 types since 2018ไวรัส NADC30-R1 และ NADC30-R2 มีส่วนสําคัญ ไวรัส NADC30-R1 เกิดขึ้นครั้งแรกในปี 2014 และมีการแพร่ระบาดมาเป็นเวลานาน โดยมีรายงานล่าสุดยังคงดําเนินการอยู่สายพันธุ์ NADC30-R2 เป็นไวรัสคล้ายกับ NADC30 ที่แพร่หลายที่สุดในประเทศของฉันจากการปรากฏครั้งแรกในปี 2020 มันแพร่ระบาดอย่างรวดเร็ว โดยอัตราการตรวจพบของมันเพิ่มขึ้นอย่างมากในช่วงหลายปีที่ผ่านมาถึงแม้ว่ารูปแบบการผสมผสานใหม่ของสายพันธุ์คล้าย NADC30 จะซับซ้อน, สายพันธุ์บางชนิดของชนิดที่ผสมผสานเดียวกันได้กลายเป็นที่แพร่หลายในบางส่วนของจีน

ภาพที่ 3 การกระจายภูมิศาสตร์และสัดส่วนของเรียงลําดับพันธุกรรมทั้ง PRRSV แบบ NADC30 ในแต่ละกลุ่ม

(A-B) การกระจายภูมิศาสตร์ของชนิดของสายพันธุ์ (C) R1/R2 ความเด่น

สรุป: ในหมู่ไวรัสแบบ NADC30 ในประเทศของฉัน จํานวนของสายพันธุ์ R1 และ R2 กําลังเพิ่มขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งสายพันธุ์ R2 ที่แพร่หลายและแพร่ระบาดอย่างรวดเร็วแสดงลักษณะการผสมผสานใหม่ที่ซับซ้อน และยังคงแพร่ระบาดในบางพื้นที่.

4. อัตราส่วนของสายพันธุ์ที่ผสมผสาน

สถานการณ์การระบาดของ NADC30 เหมือน PRRSV ในประเทศของฉันยังคงซับซ้อนNADC30-IR ยังคงเป็นกลุ่มที่ใหญ่ที่สุด, และรูปแบบการรวมตัวใหม่ภายในกลุ่มนี้มีความหลากหลายและขาดลักษณะที่สอดคล้องกัน เมื่อจํานวนเรียงลําดับพันธุกรรมทั้งตัวในฐานข้อมูล GenBank เพิ่มขึ้นสายพันธุ์ที่ลักษณะใหม่อาจถูกค้นพบในอนาคตหรือสามารถจัดหมวดใหม่ในแบบ NADC30-R1 ถึง R12 ที่มีอยู่

ภาพที่ 4 อัตราส่วนของ PRRSV แบบ NADC30 ที่มีรูปแบบการผสมผสานใหม่ที่แตกต่างกันในจีน

NR: สายพันธุ์ที่ไม่ผสมผสาน; IR: สายพันธุ์ที่มีรูปแบบการผสมผสานที่ผิดปกติ; R1 ถึง R12: สายพันธุ์ที่ผสมผสานที่มีลักษณะที่ตรงกันแกน X เป็นตัวแทนของเกณฑ์การจัดอันดับที่ใช้ในการศึกษานี้แกน Y แสดงขนาดตัวอย่างสําหรับแต่ละชนิด

สรุป: สถานการณ์การระบาดของ NADC30 เหมือน PRRSV ในประเทศของฉันซับซ้อน, ด้วยความหลากหลายทางพันธุกรรมที่เพิ่มขึ้น. NADC30-IR เป็นกลุ่มหลัก.สายพันธุ์ใหม่อาจปรากฏขึ้น หรือการจัดอันดับที่มีอยู่อาจปรับปรุงเมื่อมีข้อมูลเพิ่มขึ้น.

สรุป

การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่า PRRSV-2 ที่แพร่กระจายอยู่ในประเทศของฉัน เป็นหลักแล้วประกอบด้วย L1A, L1C, L35, และสายพันธุ์ย่อย L8E ซึ่ง L1C (คล้ายกับ NADC30) เป็นตัวหลักและบ่อยครั้งมีการรวมตัวใหม่ การรวมตัวใหม่ส่งเสริมการหลากหลายและวิวัฒนาการของไวรัสแต่การผสมผสานใหม่ไม่ได้กําหนดไวรัสโดยตรงไวรัสลันซ์เกี่ยวข้องกับรูปแบบการผสมผสานใหม่ที่เฉพาะเจาะจง