会社のニュース ハルビン獣医研究所：NADC30様および12の組換えモデルの現在の蔓延

2012年に私の国でPRRSVのようなNADC30株が最初に発見されました. 2016年以来,この株は徐々に国で支配的な株になりました. 現在,この株は非常に複雑な再結合パターンを示しています低ゲノム配列同定性で特徴的です 適度な臨床症状を示し 強い免疫抑制性を持ち 弱い抗体反応を誘発します新しい流行病の特徴を示す.

最近 the Harbin Veterinary Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences and Nanyang Normal University published a study online in Porcine Health Management on the genomic characteristics and epidemic trends of NADC30-like PRRSV in my country関連流行病学研究と予防と制御のためのデータサポートを提供します.

紹介

豚の生殖および呼吸器症候群ウイルス (PRRSV) は,私の国の豚産業に深刻な経済的損失をもたらしました. 2012年に,NADC30のようなPRRSVが初めて私の国で発見されました.何年もティアン・ジジュンのハービン獣医学研究所チームは 私の国のPRRSVの流行状況を継続的に監視しています

研究 結果

1NADC30 のような再結合の著しい増加

研究によると 2016年以降 NADC30型PRRSVは 私の国で 主な株になりました 中国での流行率を よりよく理解するには研究 者 たち は 次 の 世代 の 配列 技術 を 用い て 30 種 の ウイルス の ゲノム 配列 を 完全 に 取得 し まし た遺伝子バンクデータベースにある 224 の中国株の配列と組み合わせて ゲノム特性を体系的に分析しました復合菌株の数は年々増加していることが示されました現在では,最も一般的な3つの再結合型は,L1C+L8E,L1C+L5A,L1C+L1A+L8Eである.

図1. 中国におけるNADC30型PRRSVの流行病学と再結合

(A) 中国におけるPRRSVの流行率 (B) 再結合株パターンの時間的傾向

(C) 再組合せパターンの分布

結論: 近年, NADC30 のような菌株が私の国で支配し続け,多種多様なサブタイプを形成し,再結合に広く参加してきました.L1C+L8Eが最も一般的ですゲノム全体のシーケンシングは 進化と病原性を研究するための重要なツールになりました

2. 12 再組合せモデル

復合菌株の数が増加するにつれて,ORF5遺伝子のみを基にタイプすることは,ウイルスの特徴を完全に正確に反映することができません.この研究では,全ゲノム配列と再結合の結果を基に 遺伝学分析を用いて,私の国で NADC30のような株を分類しました最終的には,類似した再結合特性を有する120の株を NADC30-R1 から R12 の12のサブタイプに分類した.サブタイプ内の平均遺伝的距離は5.73% (標準偏差±1.68)亜型間の遺伝的距離は一般的に10%を超えていたが,同じグループのすべての株は,NSP2タンパク質の131アミノ酸の不連続削除を示した.NADC30型株の典型的な特徴と一致するウイルス性に関して,各グループの株は有意な一貫性を示さなかった.ほとんどの株は中程度ウイルス性であった.

図2 種種分析と再結合パターンに基づく NADC30 型PRRSVの分類システム

(A) 全ゲノムの生殖学樹, (B) 再組合せパターンゲノム地図

結論: この研究では,全ゲノム解析により,中国のNADC30型株を12種類に分類しました.これらの株は典型的なNsp2削除を示していました.集団内での中程度のウイルス性と 重要な遺伝的多様性.

319の州の全ゲノム配列

The results showed that whole-genome sequences of NADC30-like viruses from 19 provinces in my country revealed a gradual increase in the number of strains belonging to the NADC30-R1 to R12 types since 2018NADC30-R1株は2014年に初めて出現し,長い間流通しており,最近の報告はまだ進行中です.NADC30-R2菌株は 我が国で最も広く分布している NADC30型ウイルスです2020年に初めて出現した後は急速に広がり,検出率は近年大幅に増加しています.NADC30のような株の再結合パターンは複雑ですが,同じ再結合型の株が中国の一部で流行している.

図3 各グループにおけるNADC30型PRRSV全ゲノム配列の地理的分布と割合

(A-B) 株種の地理的分布, (C) R1/R2 主張性

結論:私の国では NADC30 型ウイルスのうち R1 と R2 型が増加しています.特に,広範囲に及び迅速に広がるR2株は複雑な再結合パターンを示し,一部の地域で循環し続けています.

4復合株の割合

NADC30型PRRSVの流行状況は複雑であり,新しい再結合株が絶えず出現し,ウイルスの遺伝的多様性が増加しています.NADC30-IR は 最大 の グループ で あるゲノムデータベースの全ゲノム配列数が増加するにつれて,ゲノム構造は将来,新しい特徴的な株が発見されるかもしれない.または,既存のNADC30-R1からR12型に再分類される.

図4 中国における異なる再結合パターンを持つNADC30型PRRSVの割合

NR:再結合性のない株 IR:不規則な再結合パターンを持つ株 R1〜R12:一貫した特徴を持つ再結合性のある株X軸は,本研究で使用された分類基準を表しています.Y軸は各タイプのサンプルサイズを表します.

結論:私の国では NADC30型PRRSVの流行状況が複雑で,遺伝的多様性が増加しています. NADC30-IRは支配的なグループです.新しい菌株が現れ,より多くのデータが入手されるにつれて,既存の分類が調整される可能性があります..

概要

この研究によると 私の国で流通しているPRRSV-2は 主にL1A,L1C,L3から構成されています5L1C (NADC30型) が優勢で頻繁に再結合する.再結合はウイルス多様化と進化を促進する.しかし再結合は直接ウイルス性を決定しませんウイルレンスが特定の再結合パターンに関連しています.