कंपनी की खबर हार्बिन पशु चिकित्सा अनुसंधान संस्थान: एनएडीसी30 जैसे और 12 पुनर्मिलन मॉडल का वर्तमान प्रसार

2012 में, मेरे देश में पहली बार PRRSV-जैसे NADC30 स्ट्रेन की खोज की गई थी। 2016 से, यह स्ट्रेन धीरे-धीरे देश में प्रमुख स्ट्रेन बन गया है। वर्तमान में, यह स्ट्रेन अत्यधिक जटिल पुनर्संयोजन पैटर्न प्रदर्शित करता है, जिसकी विशेषता कम जीनोम अनुक्रम समरूपता है। यह मध्यम नैदानिक ​​लक्षण प्रदर्शित करता है, इसमें मजबूत प्रतिरक्षादमनकारी गुण होते हैं, और यह एक कमजोर एंटीबॉडी प्रतिक्रिया को प्रेरित करता है, जो नए महामारी विज्ञान संबंधी लक्षण प्रस्तुत करता है।

हाल ही में, चीनी कृषि विज्ञान अकादमी के हारबिन पशु चिकित्सा अनुसंधान संस्थान और नानयांग नॉर्मल यूनिवर्सिटी ने मेरे देश में NADC30-जैसे PRRSV के जीनोमिक विशेषताओं और महामारी विज्ञान के रुझानों पर पोर्सिन हेल्थ मैनेजमेंट में ऑनलाइन एक अध्ययन प्रकाशित किया, जो संबंधित महामारी विज्ञान अनुसंधान और रोकथाम और नियंत्रण के लिए डेटा समर्थन प्रदान करता है।

परिचय

पोर्सिन प्रजनन और श्वसन सिंड्रोम वायरस (PRRSV) ने मेरे देश के सूअर उद्योग को गंभीर आर्थिक नुकसान पहुंचाया है। 2012 में, मेरे देश में पहली बार NADC30-जैसे PRRSV की खोज की गई थी। कई वर्षों से, हारबिन पशु चिकित्सा अनुसंधान संस्थान में तियान झिजुन की टीम लगातार मेरे देश में PRRSV की महामारी विज्ञान की स्थिति की निगरानी कर रही है।

अनुसंधान परिणाम

1. NADC30-जैसे पुनर्संयोजनों में महत्वपूर्ण वृद्धि

अध्ययनों से पता चला है कि 2016 से, NADC30-जैसे PRRSV मेरे देश में प्रमुख स्ट्रेन बन गया है। चीन में इसकी व्यापकता को और समझने के लिए, शोधकर्ताओं ने 30 वायरस उपभेदों के पूरे जीनोम अनुक्रम प्राप्त करने के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण तकनीक का उपयोग किया। GenBank डेटाबेस में 224 चीनी उपभेदों के अनुक्रमों के साथ संयुक्त, उनकी जीनोमिक विशेषताओं का व्यवस्थित रूप से विश्लेषण किया गया। परिणामों से पता चला कि पुनर्संयोजन उपभेदों की संख्या वर्ष दर वर्ष बढ़ी, और गैर-पुनर्संयोजन उपभेद लगभग गायब हो गए हैं। उनमें से, L1C+L8E, L1C+L5A और L1C+L1A+L8E वर्तमान में तीन सबसे आम पुनर्संयोजन प्रकार हैं।

चित्र 1. चीन में NADC30-जैसे PRRSV का महामारी विज्ञान और पुनर्संयोजन

(A) चीन में PRRSV की व्यापकता, (B) पुनर्संयोजन स्ट्रेन पैटर्न के अस्थायी रुझान

(C) पुनर्संयोजन पैटर्न का वितरण

निष्कर्ष: हाल के वर्षों में, NADC30-जैसे उपभेद मेरे देश में हावी रहे हैं और व्यापक रूप से पुनर्संयोजन में भाग लेते रहे हैं, जिससे कई उपप्रकार बन रहे हैं, जिसमें L1C+L8E सबसे आम है। संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण उनके विकास और रोगजनकता का अध्ययन करने के लिए एक प्रमुख उपकरण बन गया है।

2. 12 पुनर्संयोजन मॉडल

पुनर्संयोजन उपभेदों की बढ़ती संख्या के साथ, केवल ORF5 जीन पर आधारित टाइपिंग अब वायरल विशेषताओं को पूरी तरह और सटीक रूप से प्रतिबिंबित करने में सक्षम नहीं है। इस अध्ययन में मेरे देश में NADC30-जैसे उपभेदों को वर्गीकृत करने के लिए संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमों के आधार पर फाइलोजेनेटिक विश्लेषण का उपयोग किया गया और पुनर्संयोजन परिणामों को संयुक्त किया गया। अंततः, समान पुनर्संयोजन विशेषताओं वाले 120 उपभेदों को 12 उपप्रकारों, NADC30-R1 से R12 में वर्गीकृत किया गया। उपप्रकारों के भीतर औसत आनुवंशिक दूरी 5.73% (मानक विचलन ±1.68) थी, जबकि उपप्रकारों के बीच आनुवंशिक दूरी आम तौर पर 10% से अधिक थी। एक ही समूह के सभी उपभेदों में Nsp2 प्रोटीन में 131 अमीनो एसिड का एक असंतत विलोपन था, जो NADC30-जैसे उपभेदों की विशिष्ट विशेषताओं के अनुरूप था। विषाणुता के संदर्भ में, प्रत्येक समूह में उपभेदों ने कोई महत्वपूर्ण स्थिरता नहीं दिखाई, जिसमें अधिकांश उपभेद मध्यम विषाणुता के थे।

चित्र 2. फाइलोजेनेटिक विश्लेषण और पुनर्संयोजन पैटर्न के आधार पर NADC30-जैसे PRRSV का वर्गीकरण प्रणाली

(A) संपूर्ण-जीनोम फाइलोजेनेटिक ट्री, (B) पुनर्संयोजन पैटर्न जीनोम मानचित्र

निष्कर्ष: इस अध्ययन ने संपूर्ण-जीनोम विश्लेषण के माध्यम से चीनी NADC30-जैसे उपभेदों को 12 प्रकारों में वर्गीकृत किया। इन उपभेदों में एक विशिष्ट Nsp2 विलोपन पाया गया, जिसमें मध्यम विषाणुता और समूह के भीतर महत्वपूर्ण आनुवंशिक भिन्नता थी।

3. 19 प्रांतों से संपूर्ण-जीनोम अनुक्रम

परिणामों से पता चला कि मेरे देश के 19 प्रांतों से NADC30-जैसे वायरस के संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमों में 2018 से NADC30-R1 से R12 प्रकारों से संबंधित उपभेदों की संख्या में धीरे-धीरे वृद्धि हुई है, जिसमें NADC30-R1 और NADC30-R2 एक महत्वपूर्ण अनुपात का प्रतिनिधित्व करते हैं। NADC30-R1 स्ट्रेन पहली बार 2014 में दिखाई दिया और लंबे समय से प्रसारित हो रहा है, हाल की रिपोर्ट अभी भी जारी हैं। NADC30-R2 स्ट्रेन मेरे देश में सबसे व्यापक रूप से वितरित NADC30-जैसे वायरस है, जो कम से कम 12 प्रांतों और क्षेत्रों में फैल गया है। 2020 में पहली बार दिखाई देने के बाद, यह तेजी से फैला, हाल के वर्षों में इसकी पहचान दर में उल्लेखनीय वृद्धि हुई है। हालांकि NADC30-जैसे उपभेदों के पुनर्संयोजन पैटर्न जटिल हैं, एक ही पुनर्संयोजन प्रकार के कुछ उपभेद चीन के कुछ हिस्सों में प्रचलित हो गए हैं।

चित्र 3. प्रत्येक समूह में NADC30-जैसे PRRSV संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमों का भौगोलिक वितरण और अनुपात

(A-B) स्ट्रेन प्रकारों का भौगोलिक वितरण, (C) R1/R2 प्रभुत्व

निष्कर्ष: मेरे देश में NADC30-जैसे वायरस में, R1 और R2 उपभेदों की संख्या बढ़ रही है। विशेष रूप से, व्यापक और तेजी से फैलने वाला R2 स्ट्रेन जटिल पुनर्संयोजन पैटर्न प्रदर्शित करता है और कुछ क्षेत्रों में प्रसारित होता रहता है।

4. पुनर्संयोजन उपभेदों का अनुपात

मेरे देश में NADC30-जैसे PRRSV की महामारी विज्ञान की स्थिति जटिल बनी हुई है, नए पुनर्संयोजन उपभेदों के लगातार उभरने से वायरस की आनुवंशिक विविधता बढ़ रही है। विशेष रूप से, NADC30-IR सबसे बड़ा समूह बना हुआ है, और इस समूह के भीतर पुनर्संयोजन पैटर्न काफी विविध हैं और उनमें सुसंगत विशेषताओं का अभाव है। जैसे-जैसे GenBank डेटाबेस में संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमों की संख्या बढ़ती है, भविष्य में नई विशिष्ट उपभेदों की खोज की जा सकती है, या उन्हें मौजूदा NADC30-R1 से R12 प्रकारों में पुनर्वर्गीकृत किया जा सकता है।

चित्र 4. चीन में विभिन्न पुनर्संयोजन पैटर्न वाले NADC30-जैसे PRRSV का अनुपात

NR: गैर-पुनर्संयोजन स्ट्रेन; IR: अनियमित पुनर्संयोजन पैटर्न वाला स्ट्रेन; R1 से R12: सुसंगत विशेषताओं वाले पुनर्संयोजन स्ट्रेन। X-अक्ष इस अध्ययन में उपयोग किए गए वर्गीकरण मानदंडों का प्रतिनिधित्व करता है। Y-अक्ष प्रत्येक प्रकार के लिए नमूना आकार का प्रतिनिधित्व करता है।

निष्कर्ष: मेरे देश में NADC30-जैसे PRRSV की महामारी विज्ञान की स्थिति जटिल है, जिसमें आनुवंशिक विविधता बढ़ रही है। NADC30-IR प्रमुख समूह है। जैसे-जैसे अधिक डेटा उपलब्ध होगा, नए उपभेद उभर सकते हैं या मौजूदा वर्गीकरण को समायोजित किया जा सकता है।

सारांश

यह अध्ययन दिखाता है कि वर्तमान में मेरे देश में प्रसारित PRRSV-2 मुख्य रूप से L1A, L1C, L3.5 और L8E सबलाइनजों से बना है, जिनमें से L1C (NADC30-जैसे) प्रमुख है और अक्सर पुनर्संयोजन करता है। पुनर्संयोजन वायरल विविधीकरण और विकास को बढ़ावा देता है, लेकिन पुनर्संयोजन सीधे विषाणुता का निर्धारण नहीं करता है; विषाणुता विशिष्ट पुनर्संयोजन पैटर्न से जुड़ी होती है।