কোম্পানির খবর [সর্বশেষ গবেষণা] শূকর এপিডেমিক ডায়রিয়ার আণবিক বৈশিষ্ট্য এবং অ্যান্টিজেনিক এপিটোপগুলির একটি বিস্তৃত বিশ্লেষণ

৮ অক্টোবর, ২০২৫ তারিখে, জিলিন বিশ্ববিদ্যালয়ের জুনোসিস ইনস্টিটিউট এবং জিনজিয়াং গবেষণা দলের একটি গবেষণা দল *ফ্রন্টিয়ার্স ইন ভেটেরিনারি সায়েন্স*-এ শূকর এপিডেমিক ডায়রিয়া ভাইরাস (পিইডভি) নিয়ে একটি নতুন গবেষণা প্রকাশ করেছে, যা ২০২২ থেকে ২০২৫ সাল পর্যন্ত চীনে পিইডভি-এর প্রাদুর্ভাবের প্রবণতা, আণবিক বৈশিষ্ট্য এবং অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ পরিবর্তনগুলি পদ্ধতিগতভাবে প্রকাশ করেছে।

গবেষণার প্রধান বিষয়গুলি

* চীনের ২০টি প্রদেশ জুড়ে মোট ২৩৪৬টি নমুনার পরীক্ষা করা হয়েছে, যার মধ্যে পিইডভি-এর ইতিবাচকতার হার ছিল ৪৩.৩%।

* জিনোটাইপিং দেখিয়েছে যে G2c বর্তমানে মূল উপপ্রকার হয়ে উঠেছে।

* এস প্রোটিনের (COE, SS2, SS6, 2C10) মূল নিউট্রালাইজিং এপিটোপগুলিতে একাধিক মিউটেশন পাওয়া গেছে।

* জিনজিয়াং স্ট্রেনে প্রথমবারের মতো একটি নতুন সম্ভাব্য এন-গ্লাইকোসিলেশন সাইট (৩০২ নম্বর অবস্থান) আবিষ্কৃত হয়েছে।

* সাতটি লিনিয়ার এবং দুটি কনফর্মেশনাল অ্যান্টিজেনিক এপিটোপের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে, যা ভ্যাকসিন তৈরির জন্য নতুন লক্ষ্য সরবরাহ করে।

এই গবেষণায় ইঙ্গিত দেওয়া হয়েছে যে ক্লাসিক ভ্যাকসিন স্ট্রেন CV777-এর সাথে তুলনা করলে, বর্তমান প্রচলিত স্ট্রেনটি এস প্রোটিনে শুধুমাত্র ৯২.৭১%-৯৪.৯৯% নিউক্লিওটাইড এবং অ্যামিনো অ্যাসিডের মিল দেখায়, যা বিদ্যমান ভ্যাকসিনের সুরক্ষামূলক কার্যকারিতা দুর্বল হওয়ার ইঙ্গিত দেয়। ভাইরাসের মূল অ্যান্টিজেনিক অঞ্চলে ক্রমাগত মিউটেশন রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা এড়াতে পারে।

ভূমিকা

পিইডভি একটি গুরুত্বপূর্ণ করোনাভাইরাস যা বিশ্বব্যাপী শূকর শিল্পের জন্য হুমকি স্বরূপ, যা সব বয়সের শূকরের মধ্যে ডায়রিয়া, বমি এবং ডিহাইড্রেশন সৃষ্টি করে, যা দুধের শূকরছানাদের মধ্যে অত্যন্ত উচ্চ মৃত্যুর হার ঘটায়। ২০১০ সালে অত্যন্ত রোগ সৃষ্টিকারী প্রকারগুলি দেখা যাওয়ার পর থেকে, চীনের প্রাদুর্ভাব প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণে ক্রমাগত চ্যালেঞ্জের সম্মুখীন হতে হয়েছে।

জিলিন বিশ্ববিদ্যালয়ের অধ্যাপক মো জিয়াওবিং এবং গবেষক লি তিয়ানজেং-এর দল জিনজিয়াং-এর একটি গবেষণা দলের সাথে সহযোগিতা করে এই সর্বশেষ গবেষণাটি সম্পন্ন করেছে, যেখানে বৃহৎ আকারের নমুনা, বিস্তৃত কভারেজ এবং গভীর প্রক্রিয়াগত বিশ্লেষণ করা হয়েছে। এটি ২০২৫ সালের মধ্যে পিইডভি গবেষণার ক্ষেত্রে একটি উল্লেখযোগ্য অর্জন এবং উচ্চ একাডেমিক খ্যাতি রয়েছে।

গবেষণার ফলাফল

১. এপিডেমিওলজিক্যাল প্রবণতা:

২০২২ থেকে ২০২৫ সাল পর্যন্ত চীনে পিইডভি-এর সামগ্রিক ইতিবাচকতার হার ছিল ৪৩.৩%, যার মধ্যে লিয়াওনিং, আনহুই এবং গুয়াংসি সহ ছয়টি প্রদেশে ইতিবাচকতার হার ৬০%-এর বেশি ছিল। জিনজিয়াং, দক্ষিণ চীন এবং উত্তর-পূর্ব চীন ছিল উচ্চ-ঘটনার এলাকা।

চিত্র ১. শূকর এপিডেমিক ডায়রিয়া ভাইরাস (পিইডভি) সংক্রমণ এবং ডায়রিয়ায় আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে এর ভৌগোলিক বিতরণ।

(ক) বার গ্রাফ প্রতিটি প্রদেশে পিইডভি-এর ইতিবাচকতার হার দেখায় এবং লাইন গ্রাফ ৯৫% আত্মবিশ্বাসের ব্যবধানের ঊর্ধ্ব এবং নিম্ন সীমা দেখায়। (খ) পিইডভি-এর ভৌগোলিক বিতরণ। সবুজ থেকে লাল রঙ ক্রমবর্ধমান ইতিবাচকতার হার নির্দেশ করে।

২. জিনোটাইপিক বৈশিষ্ট্য:

১৫টি সিকোয়েন্সযুক্ত স্ট্রেনের মধ্যে, ১টি G1c উপপ্রকারের, ৪টি G2b উপপ্রকারের এবং ১০টি G2c উপপ্রকারের ছিল, যা নিশ্চিত করে যে G2c প্রভাবশালী উপপ্রকারে পরিণত হয়েছে।

চিত্র ২. পিইডভি এস জিনের ফাইলোজেনেটিক ট্রি

লাল পঞ্চভুজ এই গবেষণায় প্রাপ্ত সিকোয়েন্সগুলি উপস্থাপন করে। বিভিন্ন রঙ বিভিন্ন জিনোটাইপ উপস্থাপন করে।

৩. ক্রম পরিবর্তন:

সিকোয়েন্সযুক্ত স্ট্রেন এবং ক্লাসিক ভ্যাকসিন স্ট্রেন CV777-এর এস জিনের নিউক্লিওটাইড এবং অ্যামিনো অ্যাসিডের হোমোলজি যথাক্রমে শুধুমাত্র ৯২.৭১%-৯৪.৮৩% এবং ৯২.৮৯%-৯৪.৯৯% ছিল। মূল নিউট্রালাইজিং এপিটোপগুলিতে (COE, SS2, SS6, 2C10) বিভিন্ন মাত্রার মিউটেশন পরিলক্ষিত হয়েছে।

চিত্র ৩. পিইডভি এস প্রোটিনের মূল অ্যান্টিজেনিক এপিটোপগুলির তুলনা

সবুজ, কমলা, নীল এবং হলুদ অঞ্চলগুলি যথাক্রমে অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ COE, SS2, SS6 এবং 2C10-এর সাথে মিলে যায়।

৪. অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ এবং গ্লাইকোসিলেশন বৈশিষ্ট্য:

৩১-৫৪aa সহ সাতটি সংরক্ষিত অ্যান্টিজেনিক অঞ্চলগুলির পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। পিইডভি/জিনজিয়াং/২ স্ট্রেনে অবস্থান ৩০২ (NKTI)-এ একটি নতুন এন-গ্লাইকোসিলেশন সাইট পাওয়া গেছে। কিছু স্ট্রেনে গ্লাইকোসিলেশন সাইটের অনুপস্থিতি রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা এড়ানোর সাথে সম্পর্কিত হতে পারে।

চিত্র ৪. ১৫টি পিইডভি স্ট্রেন এবং ভ্যাকসিন স্ট্রেনের এস প্রোটিনে সম্ভাব্য নির্দিষ্ট এন-গ্লাইকোসিলেশন সাইটের পূর্বাভাস ফলাফল।

উল্লম্ব অক্ষ স্ট্রেনের নাম উপস্থাপন করে এবং অনুভূমিক অক্ষ অ্যামিনো অ্যাসিড সাইট উপস্থাপন করে। নীল অঞ্চলগুলি একই অ্যামিনো অ্যাসিড সাইটে অভিন্ন এন-গ্লাইকোসিলেশন নির্দেশ করে এবং লাল অঞ্চলগুলি পার্থক্য নির্দেশ করে।

চিত্র ৫. এস প্রোটিনের নেটিভ ট্রাইমার অবস্থায় ধারাবাহিক এপিটোপগুলির সংরক্ষিত অঞ্চলগুলির ভিজ্যুয়ালাইজেশন।

(ক) পূর্বাভাসিত এপিটোপ অঞ্চলে সিকোয়েন্সযুক্ত স্ট্রেন এবং ভ্যাকসিন স্ট্রেনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স সারিবদ্ধকরণ। (খ–ই) সংরক্ষিত অ্যান্টিজেনিক এপিটোপগুলির ভিজ্যুয়ালাইজেশন। নীল, সবুজ এবং সাদা অঞ্চলগুলি এস প্রোটিন ট্রাইমারের চেইন এ, বি এবং সি উপস্থাপন করে। হলুদ গোলকগুলি ০.৭-এর বেশি স্কোর সহ সম্ভাব্য অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ অঞ্চল নির্দেশ করে। (চ) এস প্রোটিন মনোমারের মূল অ্যামিনো অ্যাসিড সাইটগুলির বর্ধিত দৃশ্য, যেখানে লাল অঞ্চলগুলি এস প্রোটিন মনোমারের মূল অ্যামিনো অ্যাসিড সাইটগুলি উপস্থাপন করে।

চিত্র ৬. এস প্রোটিনের নেটিভ ট্রাইমার অবস্থায় ধারাবাহিক এপিটোপগুলির সংরক্ষিত অঞ্চলগুলির ভিজ্যুয়ালাইজেশন।

(ক) পূর্বাভাসিত এপিটোপ অঞ্চলে সিকোয়েন্সযুক্ত এবং ভ্যাকসিন স্ট্রেনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স সারিবদ্ধকরণ। (খ–ই) সংরক্ষিত অ্যান্টিজেনিক এপিটোপগুলির ভিজ্যুয়ালাইজেশন। নীল, সবুজ এবং সাদা অঞ্চলগুলি এস প্রোটিন ট্রাইমারের চেইন এ, বি এবং সি উপস্থাপন করে। হলুদ গোলকগুলি ০.৭-এর বেশি স্কোর সহ সম্ভাব্য অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ অঞ্চল নির্দেশ করে। (চ) এস প্রোটিন মনোমারের মূল অ্যামিনো অ্যাসিড সাইটগুলির বর্ধিত দৃশ্য, যেখানে লাল অঞ্চলগুলি এস প্রোটিন মনোমারের মূল অ্যামিনো অ্যাসিড সাইটগুলি উপস্থাপন করে।

সংক্ষিপ্তসার

এই গবেষণাটি কেবল ২০২২ থেকে ২০২৫ সাল পর্যন্ত চীনে পিইডভি-এর আণবিক এপিডেমিওলজিক্যাল মানচিত্রকে আপডেট করেনি, বরং মূল অ্যান্টিজেনিক এপিটোপ এবং রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা এড়ানোর পদ্ধতির পরিবর্তন প্রবণতাও প্রকাশ করেছে।

ফলাফলগুলি নির্দেশ করে যে বিদ্যমান ভ্যাকসিন স্ট্রেনগুলি (যেমন CV777) প্রচলিত স্ট্রেনগুলির থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা, যা ভাইরাসের ক্রমাগত বিবর্তন দ্বারা সৃষ্ট প্রতিরোধ ও নিয়ন্ত্রণের চ্যালেঞ্জগুলি মোকাবিলা করার জন্য G2c জিনোটাইপের উপর ভিত্তি করে পরবর্তী প্রজন্মের ভ্যাকসিন তৈরি করার প্রয়োজনীয়তা নির্দেশ করে।