hakkında şirket haberleri [Son Araştırma] Porcine Epidemik İshalinin Moleküler Özelliklerinin ve Antijenik Epitoplarının Kapsamlı Bir Analizi

8 Ekim 2025'te, Jilin Üniversitesi Zoonoz Enstitüsü ve Sincan Araştırma Grubu'ndan bir araştırma ekibi, *Veterinerlik Biliminde Sınırlar* dergisinde domuz salgın ishal virüsü (PEDV) hakkında yeni bir çalışma yayınladı; bu çalışma, 2022'den 2025'e kadar Çin'de PEDV'nin salgın eğilimini, moleküler özelliklerini ve antijenik epitop değişikliklerini sistematik olarak ortaya koydu.

Araştırmanın Öne Çıkan Noktaları

* Çin genelinde 20 ili kapsayan toplam 2346 örnek test edildi ve PEDV pozitiflik oranı %43,3 oldu.

* Genotipleme, G2c'nin mevcut ana alt tip haline geldiğini gösterdi.

* S proteininin anahtar nötralize edici epitoplarında (COE, SS2, SS6, 2C10) çoklu mutasyonlar bulundu.

* Sincan suşunda ilk kez yeni bir potansiyel N-glikosilasyon bölgesi (pozisyon 302) keşfedildi.

* Aşı gelişimi için yeni hedefler sağlayan yedi doğrusal ve iki konformasyonel antijenik epitop tahmin edildi.

Bu çalışma, klasik aşı suşu CV777 ile karşılaştırıldığında, mevcut dolaşımdaki suşun S proteininde yalnızca %92,71-%94,99 oranında nükleotid ve amino asit benzerliği paylaştığını ve mevcut aşıların koruyucu etkinliğinin zayıflıyor olabileceğini öne sürdüğünü göstermektedir. Virüsün kilit antijenik bölgelerdeki sürekli mutasyonu, bağışıklık kaçışını şiddetlendirebilir.

giriiş

PEDV, küresel domuz endüstrisini tehdit eden, her yaştan domuzda ishale, kusmaya ve dehidrasyona neden olan, emziren domuz yavrularında son derece yüksek ölüm oranlarına neden olan önemli bir koronavirüstür. 2010 yılında oldukça patojenik varyantların ortaya çıkmasından bu yana, Çin'in salgını önleme ve kontrolü sürekli zorluklarla karşı karşıya kaldı.

Jilin Üniversitesi'ndeki Profesör Mo Xiaobing ve Araştırmacı Li Tianzeng'in ekibi tarafından Sincan'daki bir araştırma ekibiyle işbirliği içinde tamamlanan bu son araştırma, büyük bir örneklem büyüklüğüne, geniş kapsama ve derinlemesine mekanik analize sahiptir. Bu, 2025 yılına kadar PEDV araştırması alanında önemli bir başarıyı temsil ediyor ve yüksek akademik güvenilirliğe sahip.

Araştırma Sonuçları

1. Epidemiyolojik Eğilimler:

Çin'de 2022'den 2025'e kadar genel PEDV pozitiflik oranı %43,3 idi; Liaoning, Anhui ve Guangxi dahil altı ilde pozitiflik oranları %60'ı aştı. Sincan, Güney Çin ve Kuzeydoğu Çin vakanın yüksek olduğu bölgelerdi.

Şekil 1. Domuz salgını ishal virüsü (PEDV) enfeksiyonu ve ishalden ölen hastalarda coğrafi dağılımı.

(A) Çubuk grafik her ildeki PEDV pozitiflik oranını, çizgi grafik ise %95 güven aralığının üst ve alt sınırlarını göstermektedir. (B) PEDV'nin coğrafi dağılımı. Yeşilden kırmızıya renkler artan pozitiflik oranını gösterir.

2. Genotipik özellikler:

Sıralanan 15 suştan 1'i G1c alt tipinden, 4'ü G2b alt tipinden ve 10'u G2c alt tipindendi; bu da G2c'nin baskın alt tip haline geldiğini doğruluyor.

Şekil 2. PEDV S geninin filogenetik ağacı

Kırmızı pentagramlar bu çalışmada elde edilen dizileri temsil eder. Farklı renkler farklı genotipleri temsil eder.

3. Sıra değişimi:

Sıralanan suşun S geninin ve klasik aşı suşu CV777'nin nükleotid ve amino asit homolojisi sırasıyla yalnızca %92,71-%94,83 ve %92,89-%94,99 idi. Anahtar nötrleştirici epitoplarda (COE, SS2, SS6, 2C10) farklı derecelerde mutasyonlar gözlendi.

Şekil 3. PEDV S proteininin anahtar antijenik epitoplarının karşılaştırılması

Yeşil, turuncu, mavi ve sarı bölgeler sırasıyla COE, SS2, SS6 ve 2C10 antijenik epitoplarına karşılık gelir.

4. Antijenik epitoplar ve glikozilasyon özellikleri:

31-54aa dahil olmak üzere yedi korunmuş antijenik bölge tahmin edildi. PEDV/XinJiang/2 suşunda 302. pozisyonda (NKTI) yeni bir N-glikosilasyon bölgesi bulundu. Bazı suşlarda glikosilasyon bölgelerinin yokluğu immün kaçışla ilişkili olabilir.

Şekil 4. 15 PEDV suşunun ve aşı suşunun S proteinindeki potansiyel spesifik N-glikosilasyon bölgelerinin tahmin sonuçları.

Dikey eksen suş adını temsil eder ve yatay eksen amino asit bölgesini temsil eder. Mavi alanlar aynı amino asit bölgesinde aynı N-glikosilasyonu, kırmızı alanlar ise farklılıkları gösterir.

Şekil 5. S proteininin doğal trimer durumunda sürekli epitopların korunmuş bölgelerinin görselleştirilmesi.

(A) Tahmin edilen epitop bölgesindeki sıralı suş ve aşı suşunun amino asit sekansı hizalaması. (B – E) Korunmuş antijenik epitopların görselleştirilmesi. Mavi, yeşil ve beyaz bölgeler sırasıyla S protein trimerinin A, B ve C zincirlerini temsil eder. Sarı küreler, 0,7'den büyük puanlara sahip potansiyel antijenik epitop bölgelerini gösterir. (F) S protein monomerindeki anahtar amino asit bölgelerinin büyütülmüş görünümü; burada kırmızı alanlar, S protein monomerindeki anahtar amino asit bölgelerini temsil eder.

Şekil 6. S proteininin doğal trimer durumunda sürekli epitopların korunmuş bölgelerinin görselleştirilmesi.

(A) Tahmin edilen epitop bölgelerinde sekanslanmış ve aşı suşlarının amino asit sekansı hizalaması. (B – E) Korunmuş antijenik epitopların görselleştirilmesi. Mavi, yeşil ve beyaz bölgeler sırasıyla S protein trimerinin A, B ve C zincirlerini temsil eder. Sarı küreler, 0,7'den büyük puanlara sahip potansiyel antijenik epitop bölgelerini gösterir. (F) S protein monomerindeki anahtar amino asit bölgelerinin büyütülmüş görünümü; kırmızı alanlar, S protein monomerindeki anahtar amino asit bölgelerini temsil eder.

Özet

Bu çalışma yalnızca Çin'deki PEDV'nin moleküler epidemiyolojik haritasını 2022'den 2025'e kadar güncellemekle kalmadı, aynı zamanda önemli antijenik epitopların ve bağışıklıktan kaçış mekanizmalarının varyasyon eğilimlerini de ortaya çıkardı.

Sonuçlar, mevcut aşı suşlarının (CV777 gibi) dolaşımdaki suşlardan önemli ölçüde farklı olduğunu gösteriyor; bu da virüsün sürekli evriminin neden olduğu önleme ve kontrol zorluklarını ele almak için G2c genotipine dayalı yeni nesil aşıların geliştirilmesi ihtiyacını ortaya koyuyor.