новости компании о [Последние исследования] Всесторонний анализ молекулярных характеристик и антигенных эпитопов вируса эпидемической диареи свиней

8 октября 2025 года исследовательская группа из Института зоонозов Цзилиньского университета и Исследовательской группы Синьцзяна опубликовала новое исследование вируса эпидемической диареи свиней (PEDV) в журнале *Frontiers in Veterinary Science*, систематически раскрывающее тенденции эпидемии, молекулярные характеристики и изменения антигенных эпитопов PEDV в Китае с 2022 по 2025 год.

Основные моменты исследования

* Протестировано 2346 образцов в 20 провинциях Китая, при этом положительный результат на PEDV составил 43,3%.

* Генотипирование показало, что G2c стал текущим основным подтипом.

* Обнаружены множественные мутации в ключевых нейтрализующих эпитопах S-белка (COE, SS2, SS6, 2C10).

* Впервые обнаружен новый потенциальный сайт N-гликозилирования (позиция 302) в штамме Синьцзяна.

* Предсказано семь линейных и два конформационных антигенных эпитопа, что предоставляет новые цели для разработки вакцин.

Это исследование показывает, что по сравнению с классическим вакцинным штаммом CV777, текущий циркулирующий штамм имеет лишь 92,71%-94,99% сходства по нуклеотидам и аминокислотам в S-белке, что предполагает ослабление защитной эффективности существующих вакцин. Непрерывная мутация вируса в ключевых антигенных областях может усугубить иммунный уход.

Введение

PEDV является значительным коронавирусом, угрожающим мировой свиноводческой промышленности, вызывающим диарею, рвоту и обезвоживание у свиней всех возрастов, с чрезвычайно высокой смертностью у сосунков. С момента появления высокопатогенных вариантов в 2010 году профилактика и контроль эпидемии в Китае сталкиваются с постоянными проблемами.

Это последнее исследование, выполненное командой профессора Мо Сяобо и исследователя Ли Тяньцзе из Цзилиньского университета в сотрудничестве с исследовательской группой в Синьцзяне, может похвастаться большим размером выборки, широким охватом и углубленным механистическим анализом. Оно представляет собой значительное достижение в области исследований PEDV к 2025 году и обладает высокой академической надежностью.

Результаты исследования

1. Эпидемиологические тенденции:

Общий уровень положительных результатов на PEDV в Китае с 2022 по 2025 год составил 43,3%, при этом в шести провинциях, включая Ляонин, Аньхой и Гуанси, уровень положительных результатов превысил 60%. Синьцзян, Южный Китай и Северо-Восточный Китай были районами с высокой заболеваемостью.

Рисунок 1. Инфекция вирусом эпидемической диареи свиней (PEDV) и ее географическое распространение у пациентов, умерших от диареи.

(A) Столбчатая диаграмма показывает уровень положительных результатов на PEDV в каждой провинции, а линейный график показывает верхнюю и нижнюю границы 95% доверительного интервала. (B) Географическое распространение PEDV. Цвета от зеленого до красного указывают на увеличение уровня положительных результатов.

2. Генотипические характеристики:

Из 15 секвенированных штаммов 1 относился к подтипу G1c, 4 - к подтипу G2b и 10 - к подтипу G2c, что подтверждает, что G2c стал доминирующим подтипом.

Рисунок 2. Филогенетическое дерево гена S PEDV

Красные пятиконечные звезды представляют последовательности, полученные в этом исследовании. Разные цвета представляют разные генотипы.

3. Вариация последовательности:

Гомология нуклеотидов и аминокислот гена S секвенированного штамма и классического вакцинного штамма CV777 составила всего 92,71%-94,83% и 92,89%-94,99% соответственно. Различные степени мутаций наблюдались в ключевых нейтрализующих эпитопах (COE, SS2, SS6, 2C10).

Рисунок 3. Сравнение ключевых антигенных эпитопов S-белка PEDV

Зеленые, оранжевые, синие и желтые области соответствуют антигенным эпитопам COE, SS2, SS6 и 2C10 соответственно.

4. Антигенные эпитопы и характеристики гликозилирования:

Предсказано семь консервативных антигенных областей, включая 31-54aa. Новый сайт N-гликозилирования в позиции 302 (NKTI) был обнаружен в штамме PEDV/XinJiang/2. Отсутствие сайтов гликозилирования в некоторых штаммах может быть связано с иммунным уходом.

Рисунок 4. Результаты предсказания потенциальных специфических сайтов N-гликозилирования в S-белке 15 штаммов PEDV и вакцинных штаммов.

Вертикальная ось представляет название штамма, а горизонтальная ось представляет сайт аминокислоты. Синие области указывают на идентичное N-гликозилирование в одном и том же сайте аминокислоты, а красные области указывают на различия.

Рисунок 5. Визуализация консервативных областей непрерывных эпитопов в нативном тримерном состоянии S-белка.

(A) Выравнивание аминокислотной последовательности секвенированного штамма и вакцинного штамма в предсказанной области эпитопа. (B–E) Визуализация консервативных антигенных эпитопов. Синие, зеленые и белые области представляют собой цепи A, B и C тримера S-белка соответственно. Желтые сферы указывают на потенциальные области антигенных эпитопов со значениями выше 0,7. (F) Увеличенный вид ключевых сайтов аминокислот на мономере S-белка, где красные области представляют ключевые сайты аминокислот на мономере S-белка.

Рисунок 6. Визуализация консервативных областей непрерывных эпитопов в нативном тримерном состоянии S-белка.

(A) Выравнивание аминокислотной последовательности секвенированных и вакцинных штаммов в предсказанных областях эпитопов. (B–E) Визуализация консервативных антигенных эпитопов. Синие, зеленые и белые области представляют собой цепи A, B и C тримера S-белка соответственно. Желтые сферы указывают на потенциальные области антигенных эпитопов со значениями выше 0,7. (F) Увеличенный вид ключевых сайтов аминокислот на мономере S-белка, где красные области представляют ключевые сайты аминокислот на мономере S-белка.

Резюме

Это исследование не только обновило молекулярную эпидемиологическую карту PEDV в Китае с 2022 по 2025 год, но и выявило тенденции изменения ключевых антигенных эпитопов и механизмы иммунного ухода.

Результаты показывают, что существующие вакцинные штаммы (например, CV777) значительно отличаются от циркулирующих штаммов, что указывает на необходимость разработки вакцин следующего поколения на основе генотипа G2c для решения проблем профилактики и контроля, вызванных непрерывной эволюцией вируса.