nouvelles de l'entreprise [Recherche Récente] Analyse Complète des Caractéristiques Moléculaires et des Épitopes Antigéniques de la Diarrhée Épidémique Porcine

Le 8 octobre 2025, une équipe de recherche de l'Institut des zoonoses de l'Université de Jilin et du groupe de recherche du Xinjiang a publié une nouvelle étude sur le virus de la diarrhée épidémique porcine (PEDV) dans *Frontiers in Veterinary Science*, révélant systématiquement la tendance épidémique, les caractéristiques moléculaires et les changements des épitopes antigéniques du PEDV en Chine de 2022 à 2025.

Points forts de la recherche

* Couvrant 20 provinces à travers la Chine, un total de 2346 échantillons ont été testés, avec un taux de positivité au PEDV de 43,3 %.

* Le génotypage a montré que G2c est devenu le sous-type dominant actuel.

* De multiples mutations ont été trouvées dans les épitopes neutralisants clés de la protéine S (COE, SS2, SS6, 2C10).

* Un nouveau site potentiel de N-glycosylation (position 302) a été découvert pour la première fois dans la souche du Xinjiang.

* Sept épitopes antigéniques linéaires et deux conformationnels ont été prédits, fournissant de nouvelles cibles pour le développement de vaccins.

Cette étude indique que, par rapport à la souche vaccinale classique CV777, la souche actuellement en circulation ne partage que 92,71 % à 94,99 % de similitude nucléotidique et d'acides aminés dans la protéine S, ce qui suggère que l'efficacité protectrice des vaccins existants pourrait s'affaiblir. La mutation continue du virus dans les régions antigéniques clés peut exacerber l'échappement immunitaire.

Introduction

Le PEDV est un coronavirus important qui menace l'industrie porcine mondiale, causant diarrhée, vomissements et déshydratation chez les porcs de tous âges, avec des taux de mortalité extrêmement élevés chez les porcelets allaitants. Depuis l'émergence de variants hautement pathogènes en 2010, la prévention et le contrôle des épidémies en Chine ont rencontré des défis constants.

Cette dernière recherche, réalisée par le professeur Mo Xiaobing et le chercheur Li Tianzeng de l'Université de Jilin en collaboration avec une équipe de recherche du Xinjiang, bénéficie d'une grande taille d'échantillon, d'une large couverture et d'une analyse mécaniste approfondie. Elle représente une réalisation significative dans le domaine de la recherche sur le PEDV d'ici 2025 et possède une grande crédibilité académique.

Résultats de la recherche

1. Tendances épidémiologiques :

Le taux de positivité global au PEDV en Chine de 2022 à 2025 était de 43,3 %, avec six provinces, dont Liaoning, Anhui et Guangxi, ayant des taux de positivité supérieurs à 60 %. Le Xinjiang, la Chine du Sud et la Chine du Nord-Est étaient des zones à forte incidence.

Figure 1. Infection par le virus de la diarrhée épidémique porcine (PEDV) et sa répartition géographique chez les patients décédés de diarrhée.

(A) Le graphique en barres montre le taux de positivité au PEDV dans chaque province, et le graphique linéaire montre les limites supérieure et inférieure de l'intervalle de confiance à 95 %. (B) Répartition géographique du PEDV. Les couleurs, du vert au rouge, indiquent une augmentation du taux de positivité.

2. Caractéristiques génotypiques :

Sur les 15 souches séquencées, 1 était du sous-type G1c, 4 du sous-type G2b et 10 du sous-type G2c, confirmant que G2c est devenu le sous-type dominant.

Figure 2. Arbre phylogénétique du gène S du PEDV

Les pentagrammes rouges représentent les séquences obtenues dans cette étude. Différentes couleurs représentent différents génotypes.

3. Variation de séquence :

L'homologie nucléotidique et en acides aminés du gène S de la souche séquencée et de la souche vaccinale classique CV777 n'était que de 92,71 % à 94,83 % et de 92,89 % à 94,99 %, respectivement. Différents degrés de mutations ont été observés dans les épitopes neutralisants clés (COE, SS2, SS6, 2C10).

Figure 3. Comparaison des épitopes antigéniques clés de la protéine S du PEDV

Les régions vertes, orange, bleues et jaunes correspondent aux épitopes antigéniques COE, SS2, SS6 et 2C10, respectivement.

4. Épitopes antigéniques et caractéristiques de glycosylation :

Sept régions antigéniques conservées, dont 31-54aa, ont été prédites. Un nouveau site de N-glycosylation à la position 302 (NKTI) a été trouvé dans la souche PEDV/XinJiang/2. L'absence de sites de glycosylation dans certaines souches peut être liée à l'échappement immunitaire.

Figure 4. Résultats de la prédiction des sites potentiels de N-glycosylation spécifiques dans la protéine S de 15 souches de PEDV et de souches vaccinales.

L'axe vertical représente le nom de la souche et l'axe horizontal représente le site d'acide aminé. Les zones bleues indiquent une N-glycosylation identique au même site d'acide aminé, et les zones rouges indiquent des différences.

Figure 5. Visualisation des régions conservées des épitopes continus dans l'état trimère natif de la protéine S.

(A) Alignement de la séquence d'acides aminés de la souche séquencée et de la souche vaccinale dans la région épitope prédite. (B–E) Visualisation des épitopes antigéniques conservés. Les régions bleues, vertes et blanches représentent respectivement les chaînes A, B et C de la protéine S trimère. Les sphères jaunes indiquent les régions potentielles des épitopes antigéniques avec des scores supérieurs à 0,7. (F) Vue agrandie des sites d'acides aminés clés sur le monomère de la protéine S, où les zones rouges représentent les sites d'acides aminés clés sur le monomère de la protéine S.

Figure 6. Visualisation des régions conservées des épitopes continus dans l'état trimère natif de la protéine S.

(A) Alignement de la séquence d'acides aminés des souches séquencées et vaccinales dans les régions épitopes prédites. (B–E) Visualisation des épitopes antigéniques conservés. Les régions bleues, vertes et blanches représentent respectivement les chaînes A, B et C de la protéine S trimère. Les sphères jaunes indiquent les régions potentielles des épitopes antigéniques avec des scores supérieurs à 0,7. (F) Vue agrandie des sites d'acides aminés clés sur le monomère de la protéine S, les zones rouges représentant les sites d'acides aminés clés sur le monomère de la protéine S.

Résumé

Cette étude a non seulement mis à jour la carte épidémiologique moléculaire du PEDV en Chine de 2022 à 2025, mais a également révélé les tendances de variation des épitopes antigéniques clés et des mécanismes d'échappement immunitaire.

Les résultats indiquent que les souches vaccinales existantes (telles que CV777) diffèrent significativement des souches en circulation, ce qui suggère la nécessité de développer des vaccins de nouvelle génération basés sur le génotype G2c pour relever les défis de la prévention et du contrôle posés par l'évolution continue du virus.