Blog über Südkorea testet neun PCR-Kits für die Afrikanische Schweinepest zur Lebensmittelsicherheitskontrolle von Abfällen

Der Schatten der Afrikanischen Schweinepest (ASV) breitet sich in der weltweiten Schweinefleischindustrie mit beispielloser Geschwindigkeit aus.Es zerstört nicht nur die Schweinepopulationen, sondern verursacht auch massive wirtschaftliche Verluste für den Viehzuchtbereich weltweit aufgrund seiner fast 100-prozentigen Sterblichkeitsrate und der schnellen Übertragung.. ASFV, ein komplexes, umhülltes DNA-Doppelstrang-Virus, wurde mittels fortgeschrittener Genomsequenzierung in sechs Hauptgenotypen eingeteilt,mit dem relativ konservierten p72-Gen, das als Schlüsselmarker für die Differenzierung dient.

Die Auswirkungen der ASF® reichen weit über die Betriebe hinaus.Die Forschung zeigt, dass sich ASF® durch unzureichend gekochte oder kontaminierte Schweinefleischprodukte, insbesondere durch Lebensmittelabfälle, die als Futtermittel recycelt werden, ausbreiten kann,ein anhaltendes Risiko für SekundärinfektionenAls Reaktion darauf haben Länder wie Südkorea strenge Maßnahmen ergriffen, darunter ein Verbot der Verwendung von Lebensmittelabfällen in Tierfutter.Eine frühzeitige Überwachung von ASFV in Lebensmittelabfallströmen ist daher zu einer entscheidenden Priorität geworden..

Trotz experimenteller Impfstoffkandidaten, die auf spezifische Gene-Deletionen abzielen, gibt es keinen kommerziell tragfähigen ASF-Impfstoff.Diese Abwesenheit unterstreicht die Bedeutung hochempfindlicher und spezifischer Diagnosetools als Grundlage für ASF-Bekämpfungsstrategien..

Die Weltorganisation für Tiergesundheit (WOAH) empfiehlt drei PCR-basierte Diagnosemethoden – eine konventionelle und zwei Echtzeit-PCR-Analysen – für eine schnelle Untersuchung vermuteter ASFV-Proben.Seit der Veröffentlichung der WOAH-Standards, fortschrittliche Techniken wie ELISA, LAMP, Multiplex-PCR und ultraempfindliche Echtzeit-PCR entstanden.Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass die Ergebnisse der Analyse der Nutzung von Endverbrauchern und Regulierungsbehörden in der Praxis sehr unterschiedlich sind, insbesondere bei kommerziellen Kits..

Um diese Lücke zu schließen, bewerteten Forscher systematisch neun von der MAFRA zugelassene Echtzeit-PCR-Kits für ASFV in Südkorea.Die Studie bewertete kritische LeistungsindikatorenDie Ergebnisse wurden mit früheren Daten verglichen, um die Auswahl der optimalen Diagnosetools zu orientieren.

Wesentliche methodische Einzelheiten:

• Auswahl der Stichprobe:20 Proben von Lebensmittelabfällen, die zufällig aus 5 581 ASFV-negativen Proben ausgewählt wurden und zwischen 2020 und 2022 gesammelt wurden.
• Sicherheitsprotokolle:Für die Beseitigung von Risiken für die biologische Gefährdung wurden synthetische ASFV-Sequenzen (HBNH-2019) und Referenzviren (PCV2, PPV, PrV) verwendet.
• DNA-Extraktion:Nach der Homogenisierung von 1 g Proben mit QIAamp® DNA Mini-Kits durchgeführt.

Unter strengen Bedingungen (1000 RFU, kitspezifische Cq-Schwellenwerte) konnten die meisten Kits ASFV bei Konzentrationen unter 1 fg/μL nachweisen.und MiCo Biosystems erreichten eine außergewöhnliche Empfindlichkeit bei 100 ag/μLBei Anwendung eines einheitlichen Cq-Schwellenwerts (< 35) konnten vier Kits bei 1 fg/μl nachgewiesen werden, wobei fünf unter erhöhten RFU-Bedingungen (2500) bei 10 fg/μl noch funktionsfähig waren.

Bemerkenswerte Ergebnisse:

• Kosteneffizienz:Sechs Kits ließen die Kosten pro Reaktion unter 10.000 KRW liegen.
• Geschwindigkeit:Drei Kits (Ahram Biosystems, MiCo BioMed, Kogene Biotech) haben die Analysen in 50 ¢ 70 Minuten ¢ 1 Stunde schneller abgeschlossen als die WOAH-Protokolle.
• Validierung:Drei leistungsstärkste Kits (VDx®, Palm PCRTM, PowerChekTM) zeigten konsistente Ergebnisse bei mehreren Analysten.

Diese erste umfassende Bewertung der von der MAFRA zugelassenen ASFV-Kits in Südkorea identifiziert optimale Instrumente für die Überwachung von Lebensmittelabfällen.Erschwinglichkeit (<10Die Ergebnisse der Studie zeigen, dass die Daten über die Entwicklung von Kernkraftwerken in den USA und in den USA in den letzten zehn Jahren sehr unterschiedlich sind.

Zu den Einschränkungen der Studie gehören das Fehlen von Feldproben von infizierten Tieren aus Gründen der Biosicherheit und die ausschließliche Betonung von Matrizen für Lebensmittelabfälle.Zukünftige Untersuchungen sollten diese Ergebnisse mit verschiedenen Stichprobentypen validieren, einschließlich klinischer Proben aus Ausbrüchen.