Cień Afrykańskiego Pomoru Świń (ASF) rozprzestrzenia się w globalnym przemyśle wieprzowym w niespotykanym dotąd tempie. Ta wysoce zakaźna choroba, wywoływana przez wirusa Afrykańskiego Pomoru Świń (ASFV), nie tylko dziesiątkuje populacje świń, ale także powoduje ogromne straty ekonomiczne w sektorach hodowlanych na całym świecie ze względu na śmiertelność bliską 100% i szybkie przenoszenie. ASFV, złożony, otoczkowy wirus DNA z podwójną nicią, został sklasyfikowany do sześciu głównych genotypów poprzez zaawansowane sekwencjonowanie genomowe, przy czym stosunkowo konserwatywny gen p72 służy jako kluczowy marker do rozróżniania.
Wpływ ASF wykracza daleko poza gospodarstwa. Badania wskazują, że ASFV może rozprzestrzeniać się poprzez niedogotowane lub skażone produkty wieprzowe, szczególnie poprzez odpady żywnościowe poddawane recyklingowi jako pasza, stwarzając stałe ryzyko wtórnych infekcji. W odpowiedzi kraje takie jak Korea Południowa wdrożyły rygorystyczne środki, w tym zakazy stosowania odpadów żywnościowych w paszach dla zwierząt. Wczesne monitorowanie ASFV w strumieniach odpadów żywnościowych stało się zatem priorytetem.
Pomimo eksperymentalnych kandydatów na szczepionki ukierunkowanych na specyficzne delecje genów, nie istnieje żadna komercyjnie opłacalna szczepionka przeciwko ASF. Brak ten podkreśla znaczenie wysoce czułych i specyficznych narzędzi diagnostycznych jako podstawy strategii kontroli ASF.
Światowa Organizacja Zdrowia Zwierząt (WOAH) zaleca trzy metody diagnostyczne oparte na PCR – jedną konwencjonalną i dwie metody PCR w czasie rzeczywistym – do przesiewowego badania dużej liczby podejrzanych próbek ASFV. Od czasu opublikowania standardów WOAH pojawiły się zaawansowane techniki, takie jak ELISA, LAMP, PCR multipleksowy i ultras czuły PCR w czasie rzeczywistym. Jednak wiele z nich pozostaje ograniczonych do środowisk badawczych, a ich rzeczywista wydajność – zwłaszcza w przypadku zestawów komercyjnych – wymaga rygorystycznej oceny przez użytkowników końcowych i organy regulacyjne.
Aby zaradzić tej luce, badacze systematycznie ocenili dziewięć zatwierdzonych przez MAFRA zestawów do PCR w czasie rzeczywistym na obecność ASFV w Korei Południowej. Używając 20 próbek odpadów żywnościowych i syntetycznych kontroli pozytywnych na obecność ASFV, badanie oceniło kluczowe wskaźniki wydajności: specyficzność, czułość, koszt na reakcję i czas przetwarzania. Wyniki zostały porównane z wcześniejszymi danymi, aby pomóc w wyborze optymalnych narzędzi diagnostycznych.
Kluczowe szczegóły metodologiczne:
W rygorystycznych warunkach (1000 RFU, progi Cq specyficzne dla zestawu) większość zestawów wykrywała ASFV w stężeniach poniżej 1 fg/µL. Trzy zestawy od Median Diagnostics, Ahram Biosystems i MiCo Biosystems osiągnęły wyjątkową czułość na poziomie 100 ag/µL. Po zastosowaniu jednolitego progu Cq (<35), cztery zestawy utrzymały wykrywanie na poziomie 1 fg/µL, a pięć nadal działało na poziomie 10 fg/µL w warunkach podwyższonego RFU (2500). Godne uwagi ustalenia:
Efektywność kosztowa:
Ograniczenia badania obejmują brak próbek terenowych od zarażonych zwierząt ze względu na obawy dotyczące bezpieczeństwa biologicznego oraz wyłączne skupienie się na matrycach odpadów żywnościowych. Przyszłe badania powinny potwierdzić te ustalenia przy użyciu różnorodnych typów próbek, w tym próbek klinicznych z ognisk.
Osoba kontaktowa: Mr. Huang Jingtai
Tel: 17743230916
Polish
